RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330334.7

HDDC3-201, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-201ENST00000330334 CUL7Q14999 1698 aa30.62■■■□□ 2.49
HDDC3-201ENST00000330334 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.59■■■□□ 2.49
HDDC3-201ENST00000330334 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.58■■■□□ 2.49
HDDC3-201ENST00000330334 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.58■■■□□ 2.49
HDDC3-201ENST00000330334 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.31■■■□□ 2.44
HDDC3-201ENST00000330334 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.28■■■□□ 2.44
HDDC3-201ENST00000330334 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.26■■■□□ 2.43
HDDC3-201ENST00000330334 IQGAP2Q13576 1575 aa30.24■■■□□ 2.43
HDDC3-201ENST00000330334 PTPRGP23470 1445 aa30.23■■■□□ 2.43
HDDC3-201ENST00000330334 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.21■■■□□ 2.43
HDDC3-201ENST00000330334 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.19■■■□□ 2.42
HDDC3-201ENST00000330334 MAPKBP1O60336 1514 aa30.17■■■□□ 2.42
HDDC3-201ENST00000330334 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.12■■■□□ 2.41
HDDC3-201ENST00000330334 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.12■■■□□ 2.41
HDDC3-201ENST00000330334 DISP1Q96F81 1524 aa30.12■■■□□ 2.41
HDDC3-201ENST00000330334 PRXQ9BXM0 1461 aa30.09■■■□□ 2.41
HDDC3-201ENST00000330334 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.08■■■□□ 2.41
HDDC3-201ENST00000330334 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.08■■■□□ 2.41
HDDC3-201ENST00000330334 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.04■■■□□ 2.4
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HDDC3-201ENST00000330334 UACAQ9BZF9 1416 aa30.01■■■□□ 2.39
HDDC3-201ENST00000330334 DIP2BQ9P265 1576 aa29.98■■■□□ 2.39
HDDC3-201ENST00000330334 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.95■■■□□ 2.39
HDDC3-201ENST00000330334 KIAA0556O60303 1618 aa29.95■■■□□ 2.38
HDDC3-201ENST00000330334 GOLGA3Q08378 1498 aa29.92■■■□□ 2.38
HDDC3-201ENST00000330334 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.91■■■□□ 2.38
HDDC3-201ENST00000330334 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.9■■■□□ 2.38
HDDC3-201ENST00000330334 EEA1Q15075 1411 aa29.88■■■□□ 2.37
HDDC3-201ENST00000330334 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.88■■■□□ 2.37
HDDC3-201ENST00000330334 ASXL2Q76L83 1435 aa29.88■■■□□ 2.37
HDDC3-201ENST00000330334 GLI2P10070 1586 aa29.78■■■□□ 2.36
HDDC3-201ENST00000330334 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
HDDC3-201ENST00000330334 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
HDDC3-201ENST00000330334 ABCA8O94911 1581 aa29.7■■■□□ 2.35
HDDC3-201ENST00000330334 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
HDDC3-201ENST00000330334 TSPOAP1O95153 1857 aa29.65■■■□□ 2.34
HDDC3-201ENST00000330334 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.63■■■□□ 2.33
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HDDC3-201ENST00000330334 KDM6BO15054 1643 aa29.63■■■□□ 2.33
HDDC3-201ENST00000330334 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.62■■■□□ 2.33
HDDC3-201ENST00000330334 P3H3Q8IVL6 736 aa29.6■■■□□ 2.33
HDDC3-201ENST00000330334 SAMD9Q5K651 1589 aa29.59■■■□□ 2.33
HDDC3-201ENST00000330334 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
HDDC3-201ENST00000330334 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.56■■■□□ 2.32
HDDC3-201ENST00000330334 KIF21BO75037 1637 aa29.53■■■□□ 2.32
HDDC3-201ENST00000330334 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.53■■■□□ 2.32
HDDC3-201ENST00000330334 ATP10BO94823 1461 aa29.49■■■□□ 2.31
HDDC3-201ENST00000330334 KCNH8Q96L42 1107 aa29.47■■■□□ 2.31
HDDC3-201ENST00000330334 CD109Q6YHK3 1445 aa29.44■■■□□ 2.3
HDDC3-201ENST00000330334 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
HDDC3-201ENST00000330334 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.42■■■□□ 2.3
HDDC3-201ENST00000330334 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
HDDC3-201ENST00000330334 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.39■■■□□ 2.3
HDDC3-201ENST00000330334 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.38■■■□□ 2.29
HDDC3-201ENST00000330334 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.38■■■□□ 2.29
HDDC3-201ENST00000330334 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.38■■■□□ 2.29
HDDC3-201ENST00000330334 ARID3CA6NKF2 412 aa29.37■■■□□ 2.29
HDDC3-201ENST00000330334 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
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HDDC3-201ENST00000330334 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
HDDC3-201ENST00000330334 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.25■■■□□ 2.27
HDDC3-201ENST00000330334 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.23■■■□□ 2.27
HDDC3-201ENST00000330334 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.22■■■□□ 2.27
HDDC3-201ENST00000330334 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.2■■■□□ 2.26
HDDC3-201ENST00000330334 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.19■■■□□ 2.26
HDDC3-201ENST00000330334 FMN1Q68DA7 1419 aa29.16■■■□□ 2.26
HDDC3-201ENST00000330334 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.15■■■□□ 2.26
HDDC3-201ENST00000330334 NEO1Q92859 1461 aa29.12■■■□□ 2.25
HDDC3-201ENST00000330334 ADGRL1O94910 1474 aa29.07■■■□□ 2.24
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HDDC3-201ENST00000330334 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
HDDC3-201ENST00000330334 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.99■■■□□ 2.23
HDDC3-201ENST00000330334 RAPGEF3O95398 923 aa28.99■■■□□ 2.23
HDDC3-201ENST00000330334 HECW1Q76N89 1606 aa28.98■■■□□ 2.23
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HDDC3-201ENST00000330334 FANCAO15360 1455 aa28.93■■■□□ 2.22
HDDC3-201ENST00000330334 AKNAQ7Z591 1439 aa28.93■■■□□ 2.22
HDDC3-201ENST00000330334 PLCH2O75038 1416 aa28.9■■■□□ 2.22
HDDC3-201ENST00000330334 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.9■■■□□ 2.22
HDDC3-201ENST00000330334 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
HDDC3-201ENST00000330334 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.88■■■□□ 2.21
HDDC3-201ENST00000330334 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.86■■■□□ 2.21
HDDC3-201ENST00000330334 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
HDDC3-201ENST00000330334 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.85■■■□□ 2.21
HDDC3-201ENST00000330334 CLIP1P30622 1438 aa28.8■■■□□ 2.2
HDDC3-201ENST00000330334 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.8■■■□□ 2.2
HDDC3-201ENST00000330334 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.79■■■□□ 2.2
HDDC3-201ENST00000330334 RICTORQ6R327 1708 aa28.77■■■□□ 2.2
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HDDC3-201ENST00000330334 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.74■■■□□ 2.19
HDDC3-201ENST00000330334 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.74■■■□□ 2.19
HDDC3-201ENST00000330334 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.74■■■□□ 2.19
HDDC3-201ENST00000330334 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.73■■■□□ 2.19
HDDC3-201ENST00000330334 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
HDDC3-201ENST00000330334 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.73■■■□□ 2.19
HDDC3-201ENST00000330334 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.7■■■□□ 2.19
HDDC3-201ENST00000330334 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.69■■■□□ 2.18
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