RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 CUL7Q14999 1698 aa43.79■■■■■ 4.6
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PPP4R4-202ENST00000328839 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.66■■■■■ 4.58
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PPP4R4-202ENST00000328839 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.52■■■■■ 4.56
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PPP4R4-202ENST00000328839 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.38■■■■■ 4.53
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PPP4R4-202ENST00000328839 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.32■■■■■ 4.53
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PPP4R4-202ENST00000328839 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.27■■■■■ 4.52
PPP4R4-202ENST00000328839 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.19■■■■■ 4.5
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PPP4R4-202ENST00000328839 ASXL2Q76L83 1435 aa42.93■■■■■ 4.46
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PPP4R4-202ENST00000328839 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.75■■■■■ 4.43
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PPP4R4-202ENST00000328839 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.6■■■■■ 4.41
PPP4R4-202ENST00000328839 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.5■■■■■ 4.39
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PPP4R4-202ENST00000328839 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa42.48■■■■■ 4.39
PPP4R4-202ENST00000328839 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.48■■■■■ 4.39
PPP4R4-202ENST00000328839 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.38■■■■■ 4.38
PPP4R4-202ENST00000328839 KCNH8Q96L42 1107 aa42.33■■■■■ 4.37
PPP4R4-202ENST00000328839 P3H3Q8IVL6 736 aa42.32■■■■■ 4.37
PPP4R4-202ENST00000328839 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.31■■■■■ 4.36
PPP4R4-202ENST00000328839 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.31■■■■■ 4.36
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
PPP4R4-202ENST00000328839 CD109Q6YHK3 1445 aa42.25■■■■■ 4.35
PPP4R4-202ENST00000328839 ARID3CA6NKF2 412 aa42.24■■■■■ 4.35
PPP4R4-202ENST00000328839 ADGRL1O94910 1474 aa42.21■■■■■ 4.35
PPP4R4-202ENST00000328839 SAMD9Q5K651 1589 aa42.19■■■■■ 4.34
PPP4R4-202ENST00000328839 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.19■■■■■ 4.34
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PPP4R4-202ENST00000328839 ATP10BO94823 1461 aa42.11■■■■■ 4.33
PPP4R4-202ENST00000328839 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.08■■■■■ 4.33
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PPP4R4-202ENST00000328839 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.74■■■■■ 4.27
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PPP4R4-202ENST00000328839 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.49■■■■■ 4.23
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PPP4R4-202ENST00000328839 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.23■■■■■ 4.19
PPP4R4-202ENST00000328839 PLCH2O75038 1416 aa41.21■■■■■ 4.19
PPP4R4-202ENST00000328839 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.2■■■■■ 4.19
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PPP4R4-202ENST00000328839 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.15■■■■■ 4.18
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