RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326153.9

GTPBP6-201, Transcript of GTP binding protein 6 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTPBP6, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP6-201ENST00000326153 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.04■■■□□ 2.88
GTPBP6-201ENST00000326153 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.03■■■□□ 2.88
GTPBP6-201ENST00000326153 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.99■■■□□ 2.87
GTPBP6-201ENST00000326153 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
GTPBP6-201ENST00000326153 SYNJ2O15056 1496 aa32.92■■■□□ 2.86
GTPBP6-201ENST00000326153 ARAP1Q96P48 1450 aa32.9■■■□□ 2.86
GTPBP6-201ENST00000326153 GRIN2AQ12879 1464 aa32.86■■■□□ 2.85
GTPBP6-201ENST00000326153 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.78■■■□□ 2.84
GTPBP6-201ENST00000326153 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.75■■■□□ 2.83
GTPBP6-201ENST00000326153 CHD1O14646 1710 aa32.75■■■□□ 2.83
GTPBP6-201ENST00000326153 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.75■■■□□ 2.83
GTPBP6-201ENST00000326153 FBLN2P98095 1184 aa32.73■■■□□ 2.83
GTPBP6-201ENST00000326153 APLP2Q06481 763 aa32.73■■■□□ 2.83
GTPBP6-201ENST00000326153 CEP170Q5SW79 1584 aa32.71■■■□□ 2.83
GTPBP6-201ENST00000326153 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.69■■■□□ 2.82
GTPBP6-201ENST00000326153 NUP160Q12769 1436 aa32.69■■■□□ 2.82
GTPBP6-201ENST00000326153 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.59■■■□□ 2.81
GTPBP6-201ENST00000326153 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP32.57■■■□□ 2.81
GTPBP6-201ENST00000326153 IQGAP2Q13576 1575 aa32.57■■■□□ 2.8
GTPBP6-201ENST00000326153 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP32.49■■■□□ 2.79
GTPBP6-201ENST00000326153 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.44■■■□□ 2.78
GTPBP6-201ENST00000326153 SAMD9Q5K651 1589 aa32.44■■■□□ 2.78
GTPBP6-201ENST00000326153 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.42■■■□□ 2.78
GTPBP6-201ENST00000326153 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.39■■■□□ 2.78
GTPBP6-201ENST00000326153 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
GTPBP6-201ENST00000326153 DISP1Q96F81 1524 aa32.35■■■□□ 2.77
GTPBP6-201ENST00000326153 JPH4Q96JJ6 628 aa32.34■■■□□ 2.77
GTPBP6-201ENST00000326153 SHROOM2Q13796 1616 aa32.32■■■□□ 2.77
GTPBP6-201ENST00000326153 P3H3Q8IVL6 736 aa32.31■■■□□ 2.76
GTPBP6-201ENST00000326153 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.3■■■□□ 2.76
GTPBP6-201ENST00000326153 MAP3K1Q13233 1512 aa32.3■■■□□ 2.76
GTPBP6-201ENST00000326153 KIAA0556O60303 1618 aa32.28■■■□□ 2.76
GTPBP6-201ENST00000326153 TIAM1Q13009 1591 aa32.27■■■□□ 2.76
GTPBP6-201ENST00000326153 OSCARQ8IYS5 282 aa32.24■■■□□ 2.75
GTPBP6-201ENST00000326153 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
GTPBP6-201ENST00000326153 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
GTPBP6-201ENST00000326153 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
GTPBP6-201ENST00000326153 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.18■■■□□ 2.74
GTPBP6-201ENST00000326153 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.14■■■□□ 2.74
GTPBP6-201ENST00000326153 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.13■■■□□ 2.73
GTPBP6-201ENST00000326153 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32.11■■■□□ 2.73
GTPBP6-201ENST00000326153 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.1■■■□□ 2.73
GTPBP6-201ENST00000326153 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.08■■■□□ 2.73
GTPBP6-201ENST00000326153 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.08■■■□□ 2.73
GTPBP6-201ENST00000326153 FMN1Q68DA7 1419 aa32.07■■■□□ 2.72
GTPBP6-201ENST00000326153 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
GTPBP6-201ENST00000326153 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.95■■■□□ 2.71
GTPBP6-201ENST00000326153 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.92■■■□□ 2.7
GTPBP6-201ENST00000326153 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.91■■■□□ 2.7
GTPBP6-201ENST00000326153 PTPRGP23470 1445 aa31.91■■■□□ 2.7
GTPBP6-201ENST00000326153 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.87■■■□□ 2.69
GTPBP6-201ENST00000326153 ABCA8O94911 1581 aa31.87■■■□□ 2.69
GTPBP6-201ENST00000326153 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
GTPBP6-201ENST00000326153 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
GTPBP6-201ENST00000326153 HECW1Q76N89 1606 aa31.81■■■□□ 2.68
GTPBP6-201ENST00000326153 ARHGEF11O15085 1522 aa31.81■■■□□ 2.68
GTPBP6-201ENST00000326153 ITGAEP38570 1179 aa31.78■■■□□ 2.68
GTPBP6-201ENST00000326153 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
GTPBP6-201ENST00000326153 CLSPNQ9HAW4 1339 aa31.75■■■□□ 2.67
GTPBP6-201ENST00000326153 UACAQ9BZF9 1416 aa31.74■■■□□ 2.67
GTPBP6-201ENST00000326153 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
GTPBP6-201ENST00000326153 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.69■■■□□ 2.66
GTPBP6-201ENST00000326153 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.69■■■□□ 2.66
GTPBP6-201ENST00000326153 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.69■■■□□ 2.66
GTPBP6-201ENST00000326153 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.68■■■□□ 2.66
GTPBP6-201ENST00000326153 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.68■■■□□ 2.66
GTPBP6-201ENST00000326153 ABCC2Q92887 1545 aa31.68■■■□□ 2.66
GTPBP6-201ENST00000326153 ARID3CA6NKF2 412 aa31.68■■■□□ 2.66
GTPBP6-201ENST00000326153 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
GTPBP6-201ENST00000326153 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.65■■■□□ 2.662e-6■■■■■ 26.9
GTPBP6-201ENST00000326153 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.65■■■□□ 2.66
GTPBP6-201ENST00000326153 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.64■■■□□ 2.66
GTPBP6-201ENST00000326153 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.64■■■□□ 2.65
GTPBP6-201ENST00000326153 ATP10BO94823 1461 aa31.63■■■□□ 2.65
GTPBP6-201ENST00000326153 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.62■■■□□ 2.65
GTPBP6-201ENST00000326153 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.6■■■□□ 2.65
GTPBP6-201ENST00000326153 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.59■■■□□ 2.65
GTPBP6-201ENST00000326153 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.59■■■□□ 2.65
GTPBP6-201ENST00000326153 NCOA2Q15596 1464 aa31.58■■■□□ 2.65
GTPBP6-201ENST00000326153 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
GTPBP6-201ENST00000326153 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
GTPBP6-201ENST00000326153 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.54■■■□□ 2.64
GTPBP6-201ENST00000326153 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
GTPBP6-201ENST00000326153 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.5■■■□□ 2.63
GTPBP6-201ENST00000326153 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
GTPBP6-201ENST00000326153 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.44■■■□□ 2.62
GTPBP6-201ENST00000326153 MAPKBP1O60336 1514 aa31.44■■■□□ 2.62
GTPBP6-201ENST00000326153 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
GTPBP6-201ENST00000326153 PTPRKQ15262 1439 aa31.38■■■□□ 2.61
GTPBP6-201ENST00000326153 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
GTPBP6-201ENST00000326153 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.35■■■□□ 2.61
GTPBP6-201ENST00000326153 KIF14Q15058 1648 aa31.34■■■□□ 2.61
GTPBP6-201ENST00000326153 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.33■■■□□ 2.61
GTPBP6-201ENST00000326153 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
GTPBP6-201ENST00000326153 HFM1A2PYH4 1435 aa31.27■■■□□ 2.6
GTPBP6-201ENST00000326153 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.23■■■□□ 2.59
GTPBP6-201ENST00000326153 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.23■■■□□ 2.59
GTPBP6-201ENST00000326153 ASXL2Q76L83 1435 aa31.22■■■□□ 2.59
GTPBP6-201ENST00000326153 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.21■■■□□ 2.59
GTPBP6-201ENST00000326153 MIA2Q96PC5 1412 aa31.21■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms