RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320054.4

PRPF18-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF18, Length 788 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18-201ENST00000320054 NUP160Q12769 1436 aa22.07■■□□□ 1.12
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PRPF18-201ENST00000320054 IQGAP2Q13576 1575 aa22.01■■□□□ 1.11
PRPF18-201ENST00000320054 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.96■■□□□ 1.11
PRPF18-201ENST00000320054 SHROOM2Q13796 1616 aa21.91■■□□□ 1.1
PRPF18-201ENST00000320054 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.9■■□□□ 1.1
PRPF18-201ENST00000320054 CEP162Q5TB80 1403 aa21.9■■□□□ 1.1
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PRPF18-201ENST00000320054 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.87■■□□□ 1.09
PRPF18-201ENST00000320054 SAMD9Q5K651 1589 aa21.87■■□□□ 1.09
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PRPF18-201ENST00000320054 DISP1Q96F81 1524 aa21.78■■□□□ 1.08
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PRPF18-201ENST00000320054 ARHGEF11O15085 1522 aa21.57■■□□□ 1.04
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PRPF18-201ENST00000320054 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.43■■□□□ 1.02
PRPF18-201ENST00000320054 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.42■■□□□ 1.02
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