RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGGTB-201ENST00000319942 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
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RABGGTB-201ENST00000319942 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.38■□□□□ 0.21
RABGGTB-201ENST00000319942 PHF12Q96QT6 1004 aa16.38■□□□□ 0.21
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RABGGTB-201ENST00000319942 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
RABGGTB-201ENST00000319942 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.26■□□□□ 0.19
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RABGGTB-201ENST00000319942 TOP2BQ02880 1626 aa16.25■□□□□ 0.19
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RABGGTB-201ENST00000319942 C7P10643 843 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGGTB-201ENST00000319942 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.2■□□□□ 0.18
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RABGGTB-201ENST00000319942 IFT140Q96RY7 1462 aa15.82■□□□□ 0.12
RABGGTB-201ENST00000319942 CLIP1P30622 1438 aa15.82■□□□□ 0.12
RABGGTB-201ENST00000319942 POTEFA5A3E0 1075 aa15.81■□□□□ 0.12
RABGGTB-201ENST00000319942 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
RABGGTB-201ENST00000319942 PLEKHG5O94827 1062 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
RABGGTB-201ENST00000319942 TRPC6Q9Y210 931 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGGTB-201ENST00000319942 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
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