RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318801.8

SYNGR1-202, Transcript of synaptogyrin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SYNGR1, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1-202ENST00000318801 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa49.24■■■■■ 5.47
SYNGR1-202ENST00000318801 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP49.23■■■■■ 5.47
SYNGR1-202ENST00000318801 ERCC6L2Q5T890 1561 aa49.2■■■■■ 5.47
SYNGR1-202ENST00000318801 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa49.11■■■■■ 5.45
SYNGR1-202ENST00000318801 TRHP20396 242 aaPredicted RBP49■■■■■ 5.43
SYNGR1-202ENST00000318801 IQGAP2Q13576 1575 aa48.88■■■■■ 5.42
SYNGR1-202ENST00000318801 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa48.84■■■■■ 5.41
SYNGR1-202ENST00000318801 CSRNP3Q8WYN3 585 aa48.81■■■■■ 5.4
SYNGR1-202ENST00000318801 EEA1Q15075 1411 aa48.78■■■■■ 5.4
SYNGR1-202ENST00000318801 PRXQ9BXM0 1461 aa48.77■■■■■ 5.4
SYNGR1-202ENST00000318801 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.7■■■■■ 5.39
SYNGR1-202ENST00000318801 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP48.68■■■■■ 5.38
SYNGR1-202ENST00000318801 PTPRGP23470 1445 aa48.66■■■■■ 5.38
SYNGR1-202ENST00000318801 TNIKQ9UKE5 1360 aa48.63■■■■■ 5.38
SYNGR1-202ENST00000318801 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa48.6■■■■■ 5.37
SYNGR1-202ENST00000318801 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP48.59■■■■■ 5.37
SYNGR1-202ENST00000318801 UGGT2Q9NYU1 1516 aa48.58■■■■■ 5.37
SYNGR1-202ENST00000318801 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP48.55■■■■■ 5.36
SYNGR1-202ENST00000318801 DISP1Q96F81 1524 aa48.5■■■■■ 5.35
SYNGR1-202ENST00000318801 GOLGA3Q08378 1498 aa48.42■■■■■ 5.34
SYNGR1-202ENST00000318801 ADCY10Q96PN6 1610 aa48.42■■■■■ 5.34
SYNGR1-202ENST00000318801 KIAA0556O60303 1618 aa48.37■■■■■ 5.33
SYNGR1-202ENST00000318801 UACAQ9BZF9 1416 aa48.27■■■■■ 5.32
SYNGR1-202ENST00000318801 MAPKBP1O60336 1514 aa48.24■■■■■ 5.31
SYNGR1-202ENST00000318801 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa48.21■■■■■ 5.31
SYNGR1-202ENST00000318801 ABCC2Q92887 1545 aa48.19■■■■■ 5.3
SYNGR1-202ENST00000318801 KIF21BO75037 1637 aa48.17■■■■■ 5.3
SYNGR1-202ENST00000318801 FAM69CQ0P6D2 419 aa48.12■■■■■ 5.29
SYNGR1-202ENST00000318801 ABCC10Q5T3U5 1492 aa48.09■■■■■ 5.29
SYNGR1-202ENST00000318801 KIF13AQ9H1H9 1805 aa48.06■■■■■ 5.28
SYNGR1-202ENST00000318801 P3H3Q8IVL6 736 aa48.04■■■■■ 5.28
SYNGR1-202ENST00000318801 UBTFP17480 764 aaKnown RBP48.01■■■■■ 5.28
SYNGR1-202ENST00000318801 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP48■■■■■ 5.27
SYNGR1-202ENST00000318801 PLB1Q6P1J6 1458 aa47.96■■■■■ 5.27
SYNGR1-202ENST00000318801 KDM5BQ9UGL1 1544 aa47.96■■■■■ 5.27
SYNGR1-202ENST00000318801 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.93■■■■■ 5.26
SYNGR1-202ENST00000318801 ASXL2Q76L83 1435 aa47.93■■■■■ 5.26
SYNGR1-202ENST00000318801 DIP2BQ9P265 1576 aa47.93■■■■■ 5.26
SYNGR1-202ENST00000318801 SAMD9Q5K651 1589 aa47.91■■■■■ 5.26
SYNGR1-202ENST00000318801 ABCA8O94911 1581 aa47.85■■■■■ 5.25
SYNGR1-202ENST00000318801 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP47.84■■■■■ 5.25
SYNGR1-202ENST00000318801 EFCAB5A4FU69 1503 aa47.73■■■■■ 5.23
SYNGR1-202ENST00000318801 FHOD3Q2V2M9 1422 aa47.66■■■■■ 5.22
SYNGR1-202ENST00000318801 GLI2P10070 1586 aa47.65■■■■■ 5.22
SYNGR1-202ENST00000318801 TSPOAP1O95153 1857 aa47.64■■■■■ 5.22
SYNGR1-202ENST00000318801 WDR7Q9Y4E6 1490 aa47.63■■■■■ 5.21
SYNGR1-202ENST00000318801 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP47.61■■■■■ 5.21
SYNGR1-202ENST00000318801 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa47.59■■■■■ 5.21
SYNGR1-202ENST00000318801 ARID3CA6NKF2 412 aa47.57■■■■■ 5.21
SYNGR1-202ENST00000318801 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP47.53■■■■■ 5.2
SYNGR1-202ENST00000318801 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP47.53■■■■■ 5.2
SYNGR1-202ENST00000318801 KCNH8Q96L42 1107 aa47.53■■■■■ 5.2
SYNGR1-202ENST00000318801 ATP10BO94823 1461 aa47.52■■■■■ 5.2
SYNGR1-202ENST00000318801 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa47.39■■■■■ 5.18
SYNGR1-202ENST00000318801 FMN1Q68DA7 1419 aa47.38■■■■■ 5.18
SYNGR1-202ENST00000318801 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP47.37■■■■■ 5.17
SYNGR1-202ENST00000318801 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa47.36■■■■■ 5.17
SYNGR1-202ENST00000318801 TEX14Q8IWB6 1497 aa47.36■■■■■ 5.17
SYNGR1-202ENST00000318801 KDM6BO15054 1643 aa47.33■■■■■ 5.17
SYNGR1-202ENST00000318801 CD109Q6YHK3 1445 aa47.29■■■■■ 5.16
SYNGR1-202ENST00000318801 PLEKHD1A6NEE1 506 aa47.28■■■■■ 5.16
SYNGR1-202ENST00000318801 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP47.27■■■■■ 5.16
SYNGR1-202ENST00000318801 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP47.27■■■■■ 5.16
SYNGR1-202ENST00000318801 CFAP43Q8NDM7 1665 aa47.26■■■■■ 5.16
SYNGR1-202ENST00000318801 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa47.15■■■■■ 5.14
SYNGR1-202ENST00000318801 HECW1Q76N89 1606 aa47.1■■■■■ 5.13
SYNGR1-202ENST00000318801 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP47.08■■■■■ 5.13
SYNGR1-202ENST00000318801 CLIP1P30622 1438 aa47.08■■■■■ 5.13
SYNGR1-202ENST00000318801 ABCA9Q8IUA7 1624 aa47.05■■■■■ 5.12
SYNGR1-202ENST00000318801 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP47■■■■■ 5.11
SYNGR1-202ENST00000318801 PHLDB1Q86UU1 1377 aa46.92■■■■■ 5.1
SYNGR1-202ENST00000318801 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP46.91■■■■■ 5.1
SYNGR1-202ENST00000318801 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa46.89■■■■■ 5.1
SYNGR1-202ENST00000318801 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP46.86■■■■■ 5.09
SYNGR1-202ENST00000318801 CCDC18Q5T9S5 1454 aa46.79■■■■■ 5.08
SYNGR1-202ENST00000318801 NEO1Q92859 1461 aa46.79■■■■■ 5.08
SYNGR1-202ENST00000318801 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP46.77■■■■■ 5.08
SYNGR1-202ENST00000318801 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP46.76■■■■■ 5.08
SYNGR1-202ENST00000318801 ARAP3Q8WWN8 1544 aa46.76■■■■■ 5.08
SYNGR1-202ENST00000318801 FYCO1Q9BQS8 1478 aa46.76■■■■■ 5.08
SYNGR1-202ENST00000318801 CEP162Q5TB80 1403 aa46.74■■■■■ 5.07
SYNGR1-202ENST00000318801 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.72■■■■■ 5.07
SYNGR1-202ENST00000318801 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP46.7■■■■■ 5.07
SYNGR1-202ENST00000318801 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa46.67■■■■■ 5.06
SYNGR1-202ENST00000318801 TTC37Q6PGP7 1564 aa46.65■■■■■ 5.06
SYNGR1-202ENST00000318801 FANCAO15360 1455 aa46.63■■■■■ 5.05
SYNGR1-202ENST00000318801 CFAP74Q9C0B2 1584 aa46.62■■■■■ 5.05
SYNGR1-202ENST00000318801 KIF14Q15058 1648 aa46.62■■■■■ 5.05
SYNGR1-202ENST00000318801 PLCH2O75038 1416 aa46.58■■■■■ 5.05
SYNGR1-202ENST00000318801 AKNAQ7Z591 1439 aa46.56■■■■■ 5.04
SYNGR1-202ENST00000318801 RAPGEF3O95398 923 aa46.55■■■■■ 5.04
SYNGR1-202ENST00000318801 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa46.52■■■■■ 5.04
SYNGR1-202ENST00000318801 MYO5CQ9NQX4 1742 aa46.5■■■■■ 5.03
SYNGR1-202ENST00000318801 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP46.47■■■■■ 5.03
SYNGR1-202ENST00000318801 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa46.4■■■■■ 5.02
SYNGR1-202ENST00000318801 ADGRL1O94910 1474 aa46.36■■■■■ 5.01
SYNGR1-202ENST00000318801 ARHGAP5Q13017 1502 aa46.35■■■■■ 5.01
SYNGR1-202ENST00000318801 MTUS2Q5JR59 1369 aa46.34■■■■■ 5.01
SYNGR1-202ENST00000318801 SCAPERQ9BY12 1400 aa46.32■■■■■ 5.01
SYNGR1-202ENST00000318801 RICTORQ6R327 1708 aa46.28■■■■■ 5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.7 ms