RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317555.6

PGAM5-201, Transcript of PGAM family member 5, mitochondrial serine/threonine protein phosphatase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGAM5, Length 1,182 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5-201ENST00000317555 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.82■■■■■ 4.93
PGAM5-201ENST00000317555 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.8■■■■■ 4.92
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PGAM5-201ENST00000317555 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.73■■■■■ 4.91
PGAM5-201ENST00000317555 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.49■■■■■ 4.87
PGAM5-201ENST00000317555 IQGAP2Q13576 1575 aa45.43■■■■■ 4.86
PGAM5-201ENST00000317555 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.28■■■■■ 4.84
PGAM5-201ENST00000317555 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.21■■■■■ 4.83
PGAM5-201ENST00000317555 PTPRGP23470 1445 aa45.18■■■■■ 4.82
PGAM5-201ENST00000317555 PRXQ9BXM0 1461 aa45.17■■■■■ 4.82
PGAM5-201ENST00000317555 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.16■■■■■ 4.82
PGAM5-201ENST00000317555 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.15■■■■■ 4.82
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PGAM5-201ENST00000317555 DISP1Q96F81 1524 aa45.12■■■■■ 4.81
PGAM5-201ENST00000317555 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.08■■■■■ 4.81
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PGAM5-201ENST00000317555 EEA1Q15075 1411 aa44.96■■■■■ 4.79
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PGAM5-201ENST00000317555 GOLGA3Q08378 1498 aa44.85■■■■■ 4.77
PGAM5-201ENST00000317555 DIP2BQ9P265 1576 aa44.82■■■■■ 4.76
PGAM5-201ENST00000317555 FAM69CQ0P6D2 419 aa44.8■■■■■ 4.76
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PGAM5-201ENST00000317555 KDM5BQ9UGL1 1544 aa44.65■■■■■ 4.74
PGAM5-201ENST00000317555 ASXL2Q76L83 1435 aa44.63■■■■■ 4.73
PGAM5-201ENST00000317555 PLB1Q6P1J6 1458 aa44.62■■■■■ 4.73
PGAM5-201ENST00000317555 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.58■■■■■ 4.73
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PGAM5-201ENST00000317555 TSPOAP1O95153 1857 aa44.51■■■■■ 4.72
PGAM5-201ENST00000317555 SAMD9Q5K651 1589 aa44.5■■■■■ 4.71
PGAM5-201ENST00000317555 P3H3Q8IVL6 736 aa44.47■■■■■ 4.71
PGAM5-201ENST00000317555 GLI2P10070 1586 aa44.45■■■■■ 4.71
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PGAM5-201ENST00000317555 KDM6BO15054 1643 aa44.27■■■■■ 4.68
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PGAM5-201ENST00000317555 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.24■■■■■ 4.67
PGAM5-201ENST00000317555 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.21■■■■■ 4.67
PGAM5-201ENST00000317555 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.2■■■■■ 4.67
PGAM5-201ENST00000317555 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.2■■■■■ 4.67
PGAM5-201ENST00000317555 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.2■■■■■ 4.67
PGAM5-201ENST00000317555 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
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PGAM5-201ENST00000317555 ATP10BO94823 1461 aa44.14■■■■■ 4.66
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PGAM5-201ENST00000317555 TEX14Q8IWB6 1497 aa44.08■■■■■ 4.65
PGAM5-201ENST00000317555 CFAP43Q8NDM7 1665 aa44.05■■■■■ 4.64
PGAM5-201ENST00000317555 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP44.02■■■■■ 4.64
PGAM5-201ENST00000317555 CD109Q6YHK3 1445 aa43.97■■■■■ 4.63
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PGAM5-201ENST00000317555 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP43.84■■■■■ 4.61
PGAM5-201ENST00000317555 ABCA9Q8IUA7 1624 aa43.81■■■■■ 4.6
PGAM5-201ENST00000317555 FMN1Q68DA7 1419 aa43.79■■■■■ 4.6
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PGAM5-201ENST00000317555 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.66■■■■■ 4.58
PGAM5-201ENST00000317555 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.62■■■■■ 4.57
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PGAM5-201ENST00000317555 CLIP1P30622 1438 aa43.43■■■■■ 4.54
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PGAM5-201ENST00000317555 KIF14Q15058 1648 aa43.27■■■■■ 4.52
PGAM5-201ENST00000317555 AKNAQ7Z591 1439 aa43.27■■■■■ 4.52
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PGAM5-201ENST00000317555 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.24■■■■■ 4.51
PGAM5-201ENST00000317555 PLCH2O75038 1416 aa43.22■■■■■ 4.51
PGAM5-201ENST00000317555 MYO5CQ9NQX4 1742 aa43.22■■■■■ 4.51
PGAM5-201ENST00000317555 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.19■■■■■ 4.51
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PGAM5-201ENST00000317555 CEP162Q5TB80 1403 aa43.09■■■■■ 4.49
PGAM5-201ENST00000317555 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.06■■■■■ 4.48
PGAM5-201ENST00000317555 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.01■■■■■ 4.48
PGAM5-201ENST00000317555 ARHGAP5Q13017 1502 aa43.01■■■■■ 4.48
PGAM5-201ENST00000317555 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa43■■■■■ 4.47
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