RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314126.4

AKAP1-201, Transcript of A-kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AKAP1, Length 2,380 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP1-201ENST00000314126 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
AKAP1-201ENST00000314126 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.06■■□□□ 1.28
AKAP1-201ENST00000314126 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.05■■□□□ 1.28
AKAP1-201ENST00000314126 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
AKAP1-201ENST00000314126 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
AKAP1-201ENST00000314126 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.276e-7■■■■■ 35.1
AKAP1-201ENST00000314126 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.98■■□□□ 1.27
AKAP1-201ENST00000314126 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.97■■□□□ 1.27
AKAP1-201ENST00000314126 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.96■■□□□ 1.27
AKAP1-201ENST00000314126 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.96■■□□□ 1.27
AKAP1-201ENST00000314126 PBRM1Q86U86 1689 aa22.94■■□□□ 1.26
AKAP1-201ENST00000314126 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.94■■□□□ 1.26
AKAP1-201ENST00000314126 SAMD9Q5K651 1589 aa22.94■■□□□ 1.26
AKAP1-201ENST00000314126 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.92■■□□□ 1.26
AKAP1-201ENST00000314126 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.88■■□□□ 1.25
AKAP1-201ENST00000314126 FMN1Q68DA7 1419 aa22.88■■□□□ 1.25
AKAP1-201ENST00000314126 P3H3Q8IVL6 736 aa22.86■■□□□ 1.25
AKAP1-201ENST00000314126 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.84■■□□□ 1.25
AKAP1-201ENST00000314126 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
AKAP1-201ENST00000314126 WDR62O43379 1518 aa22.83■■□□□ 1.25
AKAP1-201ENST00000314126 ADAMTS12P58397 1594 aa22.82■■□□□ 1.24
AKAP1-201ENST00000314126 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.8■■□□□ 1.24
AKAP1-201ENST00000314126 IFT140Q96RY7 1462 aa22.78■■□□□ 1.24
AKAP1-201ENST00000314126 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
AKAP1-201ENST00000314126 GRIN2BQ13224 1484 aa22.77■■□□□ 1.24
AKAP1-201ENST00000314126 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.75■■□□□ 1.23
AKAP1-201ENST00000314126 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
AKAP1-201ENST00000314126 IQGAP2Q13576 1575 aa22.72■■□□□ 1.23
AKAP1-201ENST00000314126 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
AKAP1-201ENST00000314126 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.23
AKAP1-201ENST00000314126 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
AKAP1-201ENST00000314126 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
AKAP1-201ENST00000314126 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.64■■□□□ 1.22
AKAP1-201ENST00000314126 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.63■■□□□ 1.21
AKAP1-201ENST00000314126 ITGAEP38570 1179 aa22.62■■□□□ 1.21
AKAP1-201ENST00000314126 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
AKAP1-201ENST00000314126 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.61■■□□□ 1.21
AKAP1-201ENST00000314126 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.61■■□□□ 1.21
AKAP1-201ENST00000314126 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.6■■□□□ 1.21
AKAP1-201ENST00000314126 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.6■■□□□ 1.21
AKAP1-201ENST00000314126 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
AKAP1-201ENST00000314126 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.59■■□□□ 1.21
AKAP1-201ENST00000314126 HECW1Q76N89 1606 aa22.59■■□□□ 1.21
AKAP1-201ENST00000314126 ERCC6Q03468 1493 aa22.58■■□□□ 1.21
AKAP1-201ENST00000314126 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
AKAP1-201ENST00000314126 MAPKBP1O60336 1514 aa22.55■■□□□ 1.2
AKAP1-201ENST00000314126 NCOA2Q15596 1464 aa22.54■■□□□ 1.2
AKAP1-201ENST00000314126 ARHGEF11O15085 1522 aa22.54■■□□□ 1.2
AKAP1-201ENST00000314126 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.54■■□□□ 1.2
AKAP1-201ENST00000314126 GRIN2AQ12879 1464 aa22.52■■□□□ 1.19
AKAP1-201ENST00000314126 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.51■■□□□ 1.19
AKAP1-201ENST00000314126 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
AKAP1-201ENST00000314126 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.5■■□□□ 1.19
AKAP1-201ENST00000314126 KIAA0556O60303 1618 aa22.49■■□□□ 1.19
AKAP1-201ENST00000314126 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
AKAP1-201ENST00000314126 DISP1Q96F81 1524 aa22.45■■□□□ 1.18
AKAP1-201ENST00000314126 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.43■■□□□ 1.18
AKAP1-201ENST00000314126 SYNJ2O15056 1496 aa22.41■■□□□ 1.18
AKAP1-201ENST00000314126 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
AKAP1-201ENST00000314126 HFM1A2PYH4 1435 aa22.39■■□□□ 1.18
AKAP1-201ENST00000314126 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
AKAP1-201ENST00000314126 PTPRKQ15262 1439 aa22.38■■□□□ 1.17
AKAP1-201ENST00000314126 CEP170Q5SW79 1584 aa22.38■■□□□ 1.17
AKAP1-201ENST00000314126 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.36■■□□□ 1.17
AKAP1-201ENST00000314126 MIA2Q96PC5 1412 aa22.33■■□□□ 1.16
AKAP1-201ENST00000314126 NUP160Q12769 1436 aa22.32■■□□□ 1.16
AKAP1-201ENST00000314126 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
AKAP1-201ENST00000314126 NAIPQ13075 1403 aa22.31■■□□□ 1.16
AKAP1-201ENST00000314126 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.29■■□□□ 1.16
AKAP1-201ENST00000314126 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.29■■□□□ 1.16
AKAP1-201ENST00000314126 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
AKAP1-201ENST00000314126 UACAQ9BZF9 1416 aa22.28■■□□□ 1.16
AKAP1-201ENST00000314126 AKNAQ7Z591 1439 aa22.27■■□□□ 1.16
AKAP1-201ENST00000314126 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
AKAP1-201ENST00000314126 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
AKAP1-201ENST00000314126 MIER1Q8N108 512 aa22.25■■□□□ 1.15
AKAP1-201ENST00000314126 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
AKAP1-201ENST00000314126 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.2■■□□□ 1.15
AKAP1-201ENST00000314126 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.2■■□□□ 1.14
AKAP1-201ENST00000314126 NEUROD1Q13562 356 aa22.19■■□□□ 1.14
AKAP1-201ENST00000314126 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.17■■□□□ 1.14
AKAP1-201ENST00000314126 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
AKAP1-201ENST00000314126 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
AKAP1-201ENST00000314126 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
AKAP1-201ENST00000314126 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.14■■□□□ 1.13
AKAP1-201ENST00000314126 JPH4Q96JJ6 628 aa22.14■■□□□ 1.13
AKAP1-201ENST00000314126 ARID3CA6NKF2 412 aa22.13■■□□□ 1.13
AKAP1-201ENST00000314126 FBLN2P98095 1184 aa22.13■■□□□ 1.13
AKAP1-201ENST00000314126 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.13■■□□□ 1.13
AKAP1-201ENST00000314126 ABCA8O94911 1581 aa22.11■■□□□ 1.13
AKAP1-201ENST00000314126 ROCK1Q13464 1354 aa22.1■■□□□ 1.13
AKAP1-201ENST00000314126 DAPK1P53355 1430 aa22.1■■□□□ 1.13
AKAP1-201ENST00000314126 KDM6BO15054 1643 aa22.08■■□□□ 1.13
AKAP1-201ENST00000314126 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
AKAP1-201ENST00000314126 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
AKAP1-201ENST00000314126 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.06■■□□□ 1.12
AKAP1-201ENST00000314126 ABCC5O15440 1437 aa22.05■■□□□ 1.12
AKAP1-201ENST00000314126 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.05■■□□□ 1.12
AKAP1-201ENST00000314126 KIF14Q15058 1648 aa22.05■■□□□ 1.12
AKAP1-201ENST00000314126 TONSLQ96HA7 1378 aa22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 381.3 ms