RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313843.7

STX4-201, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STX4, Length 1,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-201ENST00000313843 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
STX4-201ENST00000313843 OSCARQ8IYS5 282 aa35.58■■■■□ 3.29
STX4-201ENST00000313843 NUP160Q12769 1436 aa35.55■■■■□ 3.28
STX4-201ENST00000313843 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.55■■■■□ 3.28
STX4-201ENST00000313843 IQGAP2Q13576 1575 aa35.47■■■■□ 3.27
STX4-201ENST00000313843 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.43■■■■□ 3.26
STX4-201ENST00000313843 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.41■■■■□ 3.26
STX4-201ENST00000313843 CEP162Q5TB80 1403 aa35.35■■■■□ 3.25
STX4-201ENST00000313843 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
STX4-201ENST00000313843 SHROOM2Q13796 1616 aa35.26■■■■□ 3.24
STX4-201ENST00000313843 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.25■■■■□ 3.23
STX4-201ENST00000313843 CLIP1P30622 1438 aa35.24■■■■□ 3.23
STX4-201ENST00000313843 JPH4Q96JJ6 628 aa35.24■■■■□ 3.23
STX4-201ENST00000313843 SAMD9Q5K651 1589 aa35.23■■■■□ 3.23
STX4-201ENST00000313843 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.19■■■■□ 3.22
STX4-201ENST00000313843 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.18■■■■□ 3.22
STX4-201ENST00000313843 KIAA0556O60303 1618 aa35.14■■■■□ 3.22
STX4-201ENST00000313843 DISP1Q96F81 1524 aa35.12■■■■□ 3.21
STX4-201ENST00000313843 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
STX4-201ENST00000313843 ARAP1Q96P48 1450 aa35.07■■■■□ 3.2
STX4-201ENST00000313843 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.06■■■■□ 3.2
STX4-201ENST00000313843 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.05■■■■□ 3.2
STX4-201ENST00000313843 P3H3Q8IVL6 736 aa35.04■■■■□ 3.2
STX4-201ENST00000313843 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.04■■■■□ 3.2
STX4-201ENST00000313843 ARHGEF11O15085 1522 aa34.97■■■■□ 3.19
STX4-201ENST00000313843 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.93■■■■□ 3.18
STX4-201ENST00000313843 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.93■■■■□ 3.18
STX4-201ENST00000313843 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.93■■■■□ 3.18
STX4-201ENST00000313843 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.83■■■■□ 3.17
STX4-201ENST00000313843 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
STX4-201ENST00000313843 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
STX4-201ENST00000313843 PTPRGP23470 1445 aa34.8■■■■□ 3.16
STX4-201ENST00000313843 FMN1Q68DA7 1419 aa34.78■■■■□ 3.16
STX4-201ENST00000313843 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.71■■■■□ 3.15
STX4-201ENST00000313843 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.69■■■■□ 3.14
STX4-201ENST00000313843 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.66■■■■□ 3.14
STX4-201ENST00000313843 ABCA8O94911 1581 aa34.66■■■■□ 3.14
STX4-201ENST00000313843 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.65■■■■□ 3.14
STX4-201ENST00000313843 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.65■■■■□ 3.14
STX4-201ENST00000313843 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.64■■■■□ 3.14
STX4-201ENST00000313843 HECW1Q76N89 1606 aa34.64■■■■□ 3.14
STX4-201ENST00000313843 UACAQ9BZF9 1416 aa34.57■■■■□ 3.12
STX4-201ENST00000313843 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
STX4-201ENST00000313843 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.53■■■■□ 3.12
STX4-201ENST00000313843 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
STX4-201ENST00000313843 ABCC2Q92887 1545 aa34.52■■■■□ 3.12
STX4-201ENST00000313843 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.51■■■■□ 3.11
STX4-201ENST00000313843 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.48■■■■□ 3.11
STX4-201ENST00000313843 TIAM1Q13009 1591 aa34.46■■■■□ 3.11
STX4-201ENST00000313843 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
STX4-201ENST00000313843 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
STX4-201ENST00000313843 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.42■■■■□ 3.1
STX4-201ENST00000313843 ARID3CA6NKF2 412 aa34.42■■■■□ 3.1
STX4-201ENST00000313843 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
STX4-201ENST00000313843 MAP3K1Q13233 1512 aa34.36■■■■□ 3.09
STX4-201ENST00000313843 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.34■■■■□ 3.09
STX4-201ENST00000313843 APLP2Q06481 763 aa34.34■■■■□ 3.09
STX4-201ENST00000313843 ATP10BO94823 1461 aa34.33■■■■□ 3.09
STX4-201ENST00000313843 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.31■■■■□ 3.08
STX4-201ENST00000313843 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
STX4-201ENST00000313843 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
STX4-201ENST00000313843 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.26■■■■□ 3.08
STX4-201ENST00000313843 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
STX4-201ENST00000313843 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.22■■■■□ 3.07
STX4-201ENST00000313843 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
STX4-201ENST00000313843 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.19■■■■□ 3.06
STX4-201ENST00000313843 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.14■■■■□ 3.06
STX4-201ENST00000313843 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
STX4-201ENST00000313843 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
STX4-201ENST00000313843 MAPKBP1O60336 1514 aa34.1■■■■□ 3.05
STX4-201ENST00000313843 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.09■■■■□ 3.05
STX4-201ENST00000313843 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
STX4-201ENST00000313843 ASXL2Q76L83 1435 aa34.08■■■■□ 3.05
STX4-201ENST00000313843 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.05
STX4-201ENST00000313843 KIF14Q15058 1648 aa34.07■■■■□ 3.05
STX4-201ENST00000313843 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.03■■■■□ 3.04
STX4-201ENST00000313843 NCOA2Q15596 1464 aa33.96■■■■□ 3.03
STX4-201ENST00000313843 KCNH8Q96L42 1107 aa33.95■■■■□ 3.02
STX4-201ENST00000313843 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.9■■■■□ 3.02
STX4-201ENST00000313843 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.88■■■■□ 3.01
STX4-201ENST00000313843 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33.87■■■■□ 3.01
STX4-201ENST00000313843 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.86■■■■□ 3.01
STX4-201ENST00000313843 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.85■■■■□ 3.01
STX4-201ENST00000313843 ITSN2Q9NZM3 1697 aa33.84■■■■□ 3.01
STX4-201ENST00000313843 DIP2BQ9P265 1576 aa33.83■■■■□ 3.01
STX4-201ENST00000313843 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.82■■■■□ 3.01
STX4-201ENST00000313843 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.82■■■■□ 3
STX4-201ENST00000313843 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.79■■■■□ 3
STX4-201ENST00000313843 GLI2P10070 1586 aa33.78■■■■□ 3
STX4-201ENST00000313843 PREX2Q70Z35 1606 aa33.78■■■■□ 3
STX4-201ENST00000313843 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.77■■■■□ 3
STX4-201ENST00000313843 MYOM3Q5VTT5 1437 aa33.76■■■□□ 2.99
STX4-201ENST00000313843 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.76■■■□□ 2.99
STX4-201ENST00000313843 CCNB3Q8WWL7 1395 aa33.75■■■□□ 2.99
STX4-201ENST00000313843 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
STX4-201ENST00000313843 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.68■■■□□ 2.98
STX4-201ENST00000313843 FGD6Q6ZV73 1430 aa33.67■■■□□ 2.98
STX4-201ENST00000313843 PTPN23Q9H3S7 1636 aa33.67■■■□□ 2.98
STX4-201ENST00000313843 CD109Q6YHK3 1445 aa33.65■■■□□ 2.98
STX4-201ENST00000313843 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms