RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308478.9

LRRN3-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN3, Length 3,099 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3-201ENST00000308478 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.73□□□□□ -1.01
LRRN3-201ENST00000308478 KIF21BO75037 1637 aa8.73□□□□□ -1.01
LRRN3-201ENST00000308478 PPP4R2Q9NY27 417 aa8.72□□□□□ -1.01
LRRN3-201ENST00000308478 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
LRRN3-201ENST00000308478 SMARCA2P51531 1590 aa8.72□□□□□ -1.01
LRRN3-201ENST00000308478 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa8.72□□□□□ -1.01
LRRN3-201ENST00000308478 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
LRRN3-201ENST00000308478 WDR97A6NE52 1622 aa8.72□□□□□ -1.01
LRRN3-201ENST00000308478 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.7□□□□□ -1.02
LRRN3-201ENST00000308478 IL27Q8NEV9 243 aa8.7□□□□□ -1.02
LRRN3-201ENST00000308478 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
LRRN3-201ENST00000308478 ERICH6BQ5W0A0 696 aa8.69□□□□□ -1.02
LRRN3-201ENST00000308478 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
LRRN3-201ENST00000308478 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
LRRN3-201ENST00000308478 MAPKBP1O60336 1514 aa8.66□□□□□ -1.02
LRRN3-201ENST00000308478 ADRA2BP18089 450 aa8.66□□□□□ -1.02
LRRN3-201ENST00000308478 KCNA4P22459 653 aa8.66□□□□□ -1.02
LRRN3-201ENST00000308478 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
LRRN3-201ENST00000308478 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
LRRN3-201ENST00000308478 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
LRRN3-201ENST00000308478 CUX2O14529 1486 aa8.64□□□□□ -1.03
LRRN3-201ENST00000308478 SYNJ1O43426 1573 aa8.63□□□□□ -1.03
LRRN3-201ENST00000308478 FAM9BQ8IZU0 186 aa8.63□□□□□ -1.03
LRRN3-201ENST00000308478 SETD5Q9C0A6 1442 aa8.63□□□□□ -1.03
LRRN3-201ENST00000308478 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
LRRN3-201ENST00000308478 ARAP1Q96P48 1450 aa8.62□□□□□ -1.03
LRRN3-201ENST00000308478 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.61□□□□□ -1.03
LRRN3-201ENST00000308478 SMARCA4P51532 1647 aa8.6□□□□□ -1.03
LRRN3-201ENST00000308478 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
LRRN3-201ENST00000308478 CCDC184Q52MB2 194 aa8.6□□□□□ -1.03
LRRN3-201ENST00000308478 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
LRRN3-201ENST00000308478 TONSLQ96HA7 1378 aa8.59□□□□□ -1.03
LRRN3-201ENST00000308478 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
LRRN3-201ENST00000308478 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
LRRN3-201ENST00000308478 NEFMP07197 916 aa8.57□□□□□ -1.04
LRRN3-201ENST00000308478 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa8.57□□□□□ -1.04
LRRN3-201ENST00000308478 MRS2Q9HD23 443 aa8.56□□□□□ -1.04
LRRN3-201ENST00000308478 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
LRRN3-201ENST00000308478 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa8.55□□□□□ -1.04
LRRN3-201ENST00000308478 WASHC2AQ641Q2 1341 aa8.53□□□□□ -1.04
LRRN3-201ENST00000308478 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
LRRN3-201ENST00000308478 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.52□□□□□ -1.05
LRRN3-201ENST00000308478 ZBED9Q6R2W3 1325 aa8.51□□□□□ -1.05
LRRN3-201ENST00000308478 PHLDB1Q86UU1 1377 aa8.51□□□□□ -1.05
LRRN3-201ENST00000308478 PRXQ9BXM0 1461 aa8.5□□□□□ -1.05
LRRN3-201ENST00000308478 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LRRN3-201ENST00000308478 PPP6R1Q9UPN7 881 aa8.5□□□□□ -1.05
LRRN3-201ENST00000308478 AKNAQ7Z591 1439 aa8.5□□□□□ -1.05
LRRN3-201ENST00000308478 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa8.49□□□□□ -1.05
LRRN3-201ENST00000308478 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
LRRN3-201ENST00000308478 P3H3Q8IVL6 736 aa8.49□□□□□ -1.05
LRRN3-201ENST00000308478 ERICH3Q5RHP9 1530 aa8.48□□□□□ -1.05
LRRN3-201ENST00000308478 USP35Q9P2H5 1018 aa8.48□□□□□ -1.05
LRRN3-201ENST00000308478 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
LRRN3-201ENST00000308478 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
LRRN3-201ENST00000308478 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
LRRN3-201ENST00000308478 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa8.45□□□□□ -1.06
LRRN3-201ENST00000308478 GSE1Q14687 1217 aa8.45□□□□□ -1.06
LRRN3-201ENST00000308478 NUDCQ9Y266 331 aa8.45□□□□□ -1.06
LRRN3-201ENST00000308478 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa8.44□□□□□ -1.06
LRRN3-201ENST00000308478 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.44□□□□□ -1.06
LRRN3-201ENST00000308478 PDE4AP27815 886 aa8.44□□□□□ -1.06
LRRN3-201ENST00000308478 POLR3GLQ9BT43 218 aa8.44□□□□□ -1.06
LRRN3-201ENST00000308478 TIAM1Q13009 1591 aa8.44□□□□□ -1.06
LRRN3-201ENST00000308478 CNTLNQ9NXG0 1405 aa8.43□□□□□ -1.06
LRRN3-201ENST00000308478 TOP2BQ02880 1626 aa8.43□□□□□ -1.06
LRRN3-201ENST00000308478 KIF27Q86VH2 1401 aa8.42□□□□□ -1.06
LRRN3-201ENST00000308478 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
LRRN3-201ENST00000308478 SLC4A3P48751 1232 aa8.41□□□□□ -1.06
LRRN3-201ENST00000308478 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
LRRN3-201ENST00000308478 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
LRRN3-201ENST00000308478 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
LRRN3-201ENST00000308478 NFKBIBQ15653 356 aa8.4□□□□□ -1.06
LRRN3-201ENST00000308478 BACH2Q9BYV9 841 aa8.4□□□□□ -1.06
LRRN3-201ENST00000308478 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.4□□□□□ -1.07
LRRN3-201ENST00000308478 EXOC6Q8TAG9 804 aa8.4□□□□□ -1.07
LRRN3-201ENST00000308478 CCDC7Q96M83 1385 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRN3-201ENST00000308478 RNF123Q5XPI4 1314 aa8.39□□□□□ -1.07
LRRN3-201ENST00000308478 UACAQ9BZF9 1416 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRN3-201ENST00000308478 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRN3-201ENST00000308478 PKNOX2Q96KN3 472 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRN3-201ENST00000308478 RSPH6AQ9H0K4 717 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRN3-201ENST00000308478 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa8.38□□□□□ -1.07
LRRN3-201ENST00000308478 FOXD1Q16676 465 aa8.37□□□□□ -1.07
LRRN3-201ENST00000308478 SKAP1Q86WV1 359 aa8.37□□□□□ -1.07
LRRN3-201ENST00000308478 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.37□□□□□ -1.07
LRRN3-201ENST00000308478 MAP3K1Q13233 1512 aa8.36□□□□□ -1.07
LRRN3-201ENST00000308478 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.36□□□□□ -1.07
LRRN3-201ENST00000308478 NCAPD3P42695 1498 aa8.36□□□□□ -1.07
LRRN3-201ENST00000308478 TMC1Q8TDI8 760 aa8.36□□□□□ -1.07
LRRN3-201ENST00000308478 KIF7Q2M1P5 1343 aa8.36□□□□□ -1.07
LRRN3-201ENST00000308478 NCOA2Q15596 1464 aa8.36□□□□□ -1.07
LRRN3-201ENST00000308478 PEG3Q9GZU2 1588 aa8.35□□□□□ -1.07
LRRN3-201ENST00000308478 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
LRRN3-201ENST00000308478 RRP1P56182 461 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
LRRN3-201ENST00000308478 PTPRKQ15262 1439 aa8.34□□□□□ -1.07
LRRN3-201ENST00000308478 NCOA1Q15788 1441 aa8.34□□□□□ -1.07
LRRN3-201ENST00000308478 MS4A1P11836 297 aa8.34□□□□□ -1.07
LRRN3-201ENST00000308478 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
LRRN3-201ENST00000308478 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa8.33□□□□□ -1.08
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