RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000305031.4

CHSY3-201, Transcript of chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHSY3, Length 3,850 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3-201ENST00000305031 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.51■■□□□ 1.19
CHSY3-201ENST00000305031 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.5■■□□□ 1.19
CHSY3-201ENST00000305031 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.47■■□□□ 1.19
CHSY3-201ENST00000305031 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.47■■□□□ 1.19
CHSY3-201ENST00000305031 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CHSY3-201ENST00000305031 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.46■■□□□ 1.19
CHSY3-201ENST00000305031 NBR1Q14596 966 aa22.45■■□□□ 1.18
CHSY3-201ENST00000305031 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.42■■□□□ 1.18
CHSY3-201ENST00000305031 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CHSY3-201ENST00000305031 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CHSY3-201ENST00000305031 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.4■■□□□ 1.18
CHSY3-201ENST00000305031 NCAPD3P42695 1498 aa22.38■■□□□ 1.17
CHSY3-201ENST00000305031 TONSLQ96HA7 1378 aa22.37■■□□□ 1.17
CHSY3-201ENST00000305031 IGF1RP08069 1367 aa22.35■■□□□ 1.17
CHSY3-201ENST00000305031 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.34■■□□□ 1.17
CHSY3-201ENST00000305031 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CHSY3-201ENST00000305031 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.32■■□□□ 1.16
CHSY3-201ENST00000305031 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CHSY3-201ENST00000305031 KIF21BO75037 1637 aa22.29■■□□□ 1.16
CHSY3-201ENST00000305031 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.28■■□□□ 1.16
CHSY3-201ENST00000305031 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.26■■□□□ 1.15
CHSY3-201ENST00000305031 BCL11AQ9H165 835 aa22.26■■□□□ 1.15
CHSY3-201ENST00000305031 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.25■■□□□ 1.15
CHSY3-201ENST00000305031 ARAP1Q96P48 1450 aa22.24■■□□□ 1.15
CHSY3-201ENST00000305031 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.24■■□□□ 1.15
CHSY3-201ENST00000305031 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CHSY3-201ENST00000305031 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CHSY3-201ENST00000305031 CUX1P39880 1505 aa22.21■■□□□ 1.15
CHSY3-201ENST00000305031 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.2■■□□□ 1.14
CHSY3-201ENST00000305031 CFTRP13569 1480 aa22.2■■□□□ 1.14
CHSY3-201ENST00000305031 NESP48681 1621 aa22.19■■□□□ 1.14
CHSY3-201ENST00000305031 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CHSY3-201ENST00000305031 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.19■■□□□ 1.14
CHSY3-201ENST00000305031 MRS2Q9HD23 443 aa22.17■■□□□ 1.14
CHSY3-201ENST00000305031 FOXD1Q16676 465 aa22.16■■□□□ 1.14
CHSY3-201ENST00000305031 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.15■■□□□ 1.14
CHSY3-201ENST00000305031 PRXQ9BXM0 1461 aa22.14■■□□□ 1.13
CHSY3-201ENST00000305031 TOP2BQ02880 1626 aa22.12■■□□□ 1.13
CHSY3-201ENST00000305031 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.12■■□□□ 1.13
CHSY3-201ENST00000305031 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CHSY3-201ENST00000305031 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.09■■□□□ 1.13
CHSY3-201ENST00000305031 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.07■■□□□ 1.12
CHSY3-201ENST00000305031 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.06■■□□□ 1.12
CHSY3-201ENST00000305031 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.06■■□□□ 1.12
CHSY3-201ENST00000305031 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
CHSY3-201ENST00000305031 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.04■■□□□ 1.12
CHSY3-201ENST00000305031 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.03■■□□□ 1.12
CHSY3-201ENST00000305031 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CHSY3-201ENST00000305031 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
CHSY3-201ENST00000305031 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CHSY3-201ENST00000305031 HMGXB3Q12766 1538 aa21.98■■□□□ 1.11
CHSY3-201ENST00000305031 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.97■■□□□ 1.11
CHSY3-201ENST00000305031 ERCC6Q03468 1493 aa21.96■■□□□ 1.11
CHSY3-201ENST00000305031 TSPY4P0CV99 314 aa21.94■■□□□ 1.1
CHSY3-201ENST00000305031 TSPY10P0CW01 314 aa21.94■■□□□ 1.1
CHSY3-201ENST00000305031 FMN1Q68DA7 1419 aa21.94■■□□□ 1.1
CHSY3-201ENST00000305031 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.94■■□□□ 1.1
CHSY3-201ENST00000305031 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
CHSY3-201ENST00000305031 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.92■■□□□ 1.1
CHSY3-201ENST00000305031 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
CHSY3-201ENST00000305031 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CHSY3-201ENST00000305031 RGL3Q3MIN7 710 aa21.89■■□□□ 1.09
CHSY3-201ENST00000305031 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
CHSY3-201ENST00000305031 ARXQ96QS3 562 aa21.88■■□□□ 1.09
CHSY3-201ENST00000305031 TMC1Q8TDI8 760 aa21.86■■□□□ 1.09
CHSY3-201ENST00000305031 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CHSY3-201ENST00000305031 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CHSY3-201ENST00000305031 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.86■■□□□ 1.09
CHSY3-201ENST00000305031 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.84■■□□□ 1.09
CHSY3-201ENST00000305031 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CHSY3-201ENST00000305031 TOPBP1Q92547 1522 aa21.81■■□□□ 1.08
CHSY3-201ENST00000305031 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.81■■□□□ 1.08
CHSY3-201ENST00000305031 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CHSY3-201ENST00000305031 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CHSY3-201ENST00000305031 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CHSY3-201ENST00000305031 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
CHSY3-201ENST00000305031 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.76■■□□□ 1.07
CHSY3-201ENST00000305031 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CHSY3-201ENST00000305031 JPH4Q96JJ6 628 aa21.72■■□□□ 1.07
CHSY3-201ENST00000305031 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.71■■□□□ 1.07
CHSY3-201ENST00000305031 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.7■■□□□ 1.06
CHSY3-201ENST00000305031 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.69■■□□□ 1.06
CHSY3-201ENST00000305031 PKD2Q13563 968 aa21.69■■□□□ 1.06
CHSY3-201ENST00000305031 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.67■■□□□ 1.06
CHSY3-201ENST00000305031 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CHSY3-201ENST00000305031 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.05
CHSY3-201ENST00000305031 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.64■■□□□ 1.05
CHSY3-201ENST00000305031 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
CHSY3-201ENST00000305031 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.64■■□□□ 1.05
CHSY3-201ENST00000305031 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.63■■□□□ 1.05
CHSY3-201ENST00000305031 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.62■■□□□ 1.05
CHSY3-201ENST00000305031 CCER2I3L3R5 266 aa21.62■■□□□ 1.05
CHSY3-201ENST00000305031 TIAM1Q13009 1591 aa21.62■■□□□ 1.05
CHSY3-201ENST00000305031 NCOA2Q15596 1464 aa21.58■■□□□ 1.05
CHSY3-201ENST00000305031 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CHSY3-201ENST00000305031 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.56■■□□□ 1.04
CHSY3-201ENST00000305031 CCDC184Q52MB2 194 aa21.56■■□□□ 1.04
CHSY3-201ENST00000305031 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.56■■□□□ 1.04
CHSY3-201ENST00000305031 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.55■■□□□ 1.04
CHSY3-201ENST00000305031 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
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