RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303230.5

HCN1-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN1, Length 9,885 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN1-201ENST00000303230 GOLGA3Q08378 1498 aa22.11■■□□□ 1.13
HCN1-201ENST00000303230 PTMSP20962 102 aa22.1■■□□□ 1.13
HCN1-201ENST00000303230 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HCN1-201ENST00000303230 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
HCN1-201ENST00000303230 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.07■■□□□ 1.12
HCN1-201ENST00000303230 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
HCN1-201ENST00000303230 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HCN1-201ENST00000303230 CFAP44Q96MT7 982 aa21.99■■□□□ 1.11
HCN1-201ENST00000303230 CDCA8Q53HL2 280 aa21.96■■□□□ 1.11
HCN1-201ENST00000303230 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
HCN1-201ENST00000303230 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
HCN1-201ENST00000303230 MS4A1P11836 297 aa21.95■■□□□ 1.1
HCN1-201ENST00000303230 CEP162Q5TB80 1403 aa21.93■■□□□ 1.1
HCN1-201ENST00000303230 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.93■■□□□ 1.1
HCN1-201ENST00000303230 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.88■■□□□ 1.09
HCN1-201ENST00000303230 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
HCN1-201ENST00000303230 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HCN1-201ENST00000303230 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HCN1-201ENST00000303230 ABCC9O60706 1549 aa21.84■■□□□ 1.09
HCN1-201ENST00000303230 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.82■■□□□ 1.08
HCN1-201ENST00000303230 CFAP53Q96M91 514 aa21.81■■□□□ 1.08
HCN1-201ENST00000303230 HSCBQ8IWL3 235 aa21.79■■□□□ 1.08
HCN1-201ENST00000303230 CCER2I3L3R5 266 aa21.78■■□□□ 1.08
HCN1-201ENST00000303230 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
HCN1-201ENST00000303230 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
HCN1-201ENST00000303230 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.77■■□□□ 1.08
HCN1-201ENST00000303230 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.76■■□□□ 1.07
HCN1-201ENST00000303230 USP35Q9P2H5 1018 aa21.76■■□□□ 1.07
HCN1-201ENST00000303230 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.76■■□□□ 1.07
HCN1-201ENST00000303230 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
HCN1-201ENST00000303230 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
HCN1-201ENST00000303230 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.73■■□□□ 1.07
HCN1-201ENST00000303230 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
HCN1-201ENST00000303230 GBP4Q96PP9 640 aa21.71■■□□□ 1.07
HCN1-201ENST00000303230 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.71■■□□□ 1.07
HCN1-201ENST00000303230 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
HCN1-201ENST00000303230 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
HCN1-201ENST00000303230 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.7■■□□□ 1.06
HCN1-201ENST00000303230 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
HCN1-201ENST00000303230 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.69■■□□□ 1.06
HCN1-201ENST00000303230 TSPY4P0CV99 314 aa21.66■■□□□ 1.06
HCN1-201ENST00000303230 TSPY10P0CW01 314 aa21.66■■□□□ 1.06
HCN1-201ENST00000303230 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.66■■□□□ 1.06
HCN1-201ENST00000303230 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
HCN1-201ENST00000303230 P3H3Q8IVL6 736 aa21.64■■□□□ 1.06
HCN1-201ENST00000303230 MCCP23508 829 aa21.64■■□□□ 1.05
HCN1-201ENST00000303230 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
HCN1-201ENST00000303230 FBLN2P98095 1184 aa21.6■■□□□ 1.05
HCN1-201ENST00000303230 NACADO15069 1562 aa21.59■■□□□ 1.05
HCN1-201ENST00000303230 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.59■■□□□ 1.05
HCN1-201ENST00000303230 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
HCN1-201ENST00000303230 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
HCN1-201ENST00000303230 PHF14O94880 888 aa21.57■■□□□ 1.04
HCN1-201ENST00000303230 KIF27Q86VH2 1401 aa21.55■■□□□ 1.04
HCN1-201ENST00000303230 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
HCN1-201ENST00000303230 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.51■■□□□ 1.03
HCN1-201ENST00000303230 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.51■■□□□ 1.03
HCN1-201ENST00000303230 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HCN1-201ENST00000303230 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
HCN1-201ENST00000303230 RGS3P49796 1198 aa21.5■■□□□ 1.03
HCN1-201ENST00000303230 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
HCN1-201ENST00000303230 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.5■■□□□ 1.03
HCN1-201ENST00000303230 NUDCQ9Y266 331 aa21.49■■□□□ 1.03
HCN1-201ENST00000303230 DRC7Q8IY82 874 aa21.49■■□□□ 1.03
HCN1-201ENST00000303230 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HCN1-201ENST00000303230 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa21.48■■□□□ 1.03
HCN1-201ENST00000303230 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.47■■□□□ 1.03
HCN1-201ENST00000303230 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.44■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.44■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.43■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.43■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.43■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 FGD1P98174 961 aa21.42■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 PLCB2Q00722 1185 aa21.42■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 ARID3CA6NKF2 412 aa21.4■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.4■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.4■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.39■■□□□ 1.01
HCN1-201ENST00000303230 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
HCN1-201ENST00000303230 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HCN1-201ENST00000303230 KCNJ4P48050 445 aa21.37■■□□□ 1.01
HCN1-201ENST00000303230 TPM4P67936 248 aa21.37■■□□□ 1.01
HCN1-201ENST00000303230 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HCN1-201ENST00000303230 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.36■■□□□ 1.01
HCN1-201ENST00000303230 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.36■■□□□ 1.01
HCN1-201ENST00000303230 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
HCN1-201ENST00000303230 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
HCN1-201ENST00000303230 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
HCN1-201ENST00000303230 RALBP1Q15311 655 aa21.32■■□□□ 1
HCN1-201ENST00000303230 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HCN1-201ENST00000303230 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
HCN1-201ENST00000303230 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
HCN1-201ENST00000303230 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.3■■□□□ 1
HCN1-201ENST00000303230 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
HCN1-201ENST00000303230 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 1
HCN1-201ENST00000303230 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms