RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296388.9

P3H1-202, Transcript of prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene P3H1, Length 2,585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1-202ENST00000296388 CUL7Q14999 1698 aa24.01■■□□□ 1.43
P3H1-202ENST00000296388 P3H3Q8IVL6 736 aa23.99■■□□□ 1.43
P3H1-202ENST00000296388 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.98■■□□□ 1.432e-7■■■□□ 16.3
P3H1-202ENST00000296388 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
P3H1-202ENST00000296388 ERCC6Q03468 1493 aa23.96■■□□□ 1.43
P3H1-202ENST00000296388 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.94■■□□□ 1.42
P3H1-202ENST00000296388 WDR62O43379 1518 aa23.92■■□□□ 1.42
P3H1-202ENST00000296388 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
P3H1-202ENST00000296388 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
P3H1-202ENST00000296388 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.86■■□□□ 1.41
P3H1-202ENST00000296388 PBRM1Q86U86 1689 aa23.85■■□□□ 1.41
P3H1-202ENST00000296388 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.83■■□□□ 1.41
P3H1-202ENST00000296388 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
P3H1-202ENST00000296388 IFT140Q96RY7 1462 aa23.82■■□□□ 1.4
P3H1-202ENST00000296388 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
P3H1-202ENST00000296388 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
P3H1-202ENST00000296388 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
P3H1-202ENST00000296388 GRIN2BQ13224 1484 aa23.77■■□□□ 1.4
P3H1-202ENST00000296388 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.76■■□□□ 1.39
P3H1-202ENST00000296388 ADAMTS12P58397 1594 aa23.73■■□□□ 1.39
P3H1-202ENST00000296388 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.72■■□□□ 1.39
P3H1-202ENST00000296388 MYT1Q01538 1121 aa23.72■■□□□ 1.39
P3H1-202ENST00000296388 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
P3H1-202ENST00000296388 TIAM1Q13009 1591 aa23.69■■□□□ 1.38
P3H1-202ENST00000296388 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
P3H1-202ENST00000296388 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.65■■□□□ 1.38
P3H1-202ENST00000296388 SAMD9Q5K651 1589 aa23.64■■□□□ 1.37
P3H1-202ENST00000296388 MAP3K1Q13233 1512 aa23.61■■□□□ 1.37
P3H1-202ENST00000296388 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.61■■□□□ 1.37
P3H1-202ENST00000296388 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.6■■□□□ 1.37
P3H1-202ENST00000296388 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
P3H1-202ENST00000296388 FMN1Q68DA7 1419 aa23.59■■□□□ 1.37
P3H1-202ENST00000296388 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.58■■□□□ 1.37
P3H1-202ENST00000296388 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
P3H1-202ENST00000296388 IQGAP2Q13576 1575 aa23.57■■□□□ 1.36
P3H1-202ENST00000296388 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.55■■□□□ 1.36
P3H1-202ENST00000296388 FBLN2P98095 1184 aa23.54■■□□□ 1.36
P3H1-202ENST00000296388 MIER1Q8N108 512 aa23.53■■□□□ 1.36
P3H1-202ENST00000296388 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.53■■□□□ 1.36
P3H1-202ENST00000296388 GRIN2AQ12879 1464 aa23.52■■□□□ 1.36
P3H1-202ENST00000296388 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.52■■□□□ 1.36
P3H1-202ENST00000296388 ITGAEP38570 1179 aa23.51■■□□□ 1.35
P3H1-202ENST00000296388 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
P3H1-202ENST00000296388 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.48■■□□□ 1.35
P3H1-202ENST00000296388 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
P3H1-202ENST00000296388 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.45■■□□□ 1.34
P3H1-202ENST00000296388 SYNJ2O15056 1496 aa23.43■■□□□ 1.34
P3H1-202ENST00000296388 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.42■■□□□ 1.34
P3H1-202ENST00000296388 ARID3CA6NKF2 412 aa23.4■■□□□ 1.34
P3H1-202ENST00000296388 CEP170Q5SW79 1584 aa23.39■■□□□ 1.34
P3H1-202ENST00000296388 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
P3H1-202ENST00000296388 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.38■■□□□ 1.33
P3H1-202ENST00000296388 DISP1Q96F81 1524 aa23.38■■□□□ 1.33
P3H1-202ENST00000296388 KIAA0556O60303 1618 aa23.33■■□□□ 1.32
P3H1-202ENST00000296388 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.3■■□□□ 1.32
P3H1-202ENST00000296388 NUP160Q12769 1436 aa23.29■■□□□ 1.32
P3H1-202ENST00000296388 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
P3H1-202ENST00000296388 JPH4Q96JJ6 628 aa23.28■■□□□ 1.32
P3H1-202ENST00000296388 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
P3H1-202ENST00000296388 HECW1Q76N89 1606 aa23.27■■□□□ 1.32
P3H1-202ENST00000296388 NCOA2Q15596 1464 aa23.26■■□□□ 1.31
P3H1-202ENST00000296388 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
P3H1-202ENST00000296388 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.24■■□□□ 1.31
P3H1-202ENST00000296388 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.23■■□□□ 1.31
P3H1-202ENST00000296388 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.23■■□□□ 1.31
P3H1-202ENST00000296388 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.21■■□□□ 1.31
P3H1-202ENST00000296388 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.2■■□□□ 1.3
P3H1-202ENST00000296388 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
P3H1-202ENST00000296388 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
P3H1-202ENST00000296388 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.16■■□□□ 1.3
P3H1-202ENST00000296388 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.16■■□□□ 1.3
P3H1-202ENST00000296388 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.15■■□□□ 1.3
P3H1-202ENST00000296388 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.14■■□□□ 1.29
P3H1-202ENST00000296388 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.13■■□□□ 1.29
P3H1-202ENST00000296388 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.13■■□□□ 1.293e-6■■■■■ 40.9
P3H1-202ENST00000296388 ARHGEF11O15085 1522 aa23.12■■□□□ 1.29
P3H1-202ENST00000296388 CHD1O14646 1710 aa23.12■■□□□ 1.29
P3H1-202ENST00000296388 PTPRKQ15262 1439 aa23.1■■□□□ 1.29
P3H1-202ENST00000296388 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.05■■□□□ 1.28
P3H1-202ENST00000296388 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
P3H1-202ENST00000296388 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
P3H1-202ENST00000296388 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.98■■□□□ 1.27
P3H1-202ENST00000296388 MAPKBP1O60336 1514 aa22.97■■□□□ 1.27
P3H1-202ENST00000296388 ABCA8O94911 1581 aa22.95■■□□□ 1.26
P3H1-202ENST00000296388 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
P3H1-202ENST00000296388 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
P3H1-202ENST00000296388 PTPRGP23470 1445 aa22.94■■□□□ 1.26
P3H1-202ENST00000296388 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
P3H1-202ENST00000296388 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.93■■□□□ 1.26
P3H1-202ENST00000296388 MIA2Q96PC5 1412 aa22.93■■□□□ 1.26
P3H1-202ENST00000296388 HFM1A2PYH4 1435 aa22.92■■□□□ 1.26
P3H1-202ENST00000296388 ATP10BO94823 1461 aa22.91■■□□□ 1.26
P3H1-202ENST00000296388 NAIPQ13075 1403 aa22.91■■□□□ 1.26
P3H1-202ENST00000296388 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.91■■□□□ 1.26
P3H1-202ENST00000296388 KIF14Q15058 1648 aa22.89■■□□□ 1.26
P3H1-202ENST00000296388 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.89■■□□□ 1.25
P3H1-202ENST00000296388 SHROOM2Q13796 1616 aa22.87■■□□□ 1.25
P3H1-202ENST00000296388 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.87■■□□□ 1.25
P3H1-202ENST00000296388 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
P3H1-202ENST00000296388 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms