RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296210.11

TPRA1-201, Transcript of transmembrane protein adipocyte associated 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TPRA1, Length 1,725 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRA1-201ENST00000296210 CEP162Q5TB80 1403 aa42.49■■■■■ 4.39
TPRA1-201ENST00000296210 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
TPRA1-201ENST00000296210 CHD1O14646 1710 aa42.34■■■■■ 4.37
TPRA1-201ENST00000296210 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.31■■■■■ 4.36
TPRA1-201ENST00000296210 HRCP23327 699 aa42.29■■■■■ 4.36
TPRA1-201ENST00000296210 NUP160Q12769 1436 aa42.29■■■■■ 4.36
TPRA1-201ENST00000296210 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.26■■■■■ 4.36
TPRA1-201ENST00000296210 CEP170Q5SW79 1584 aa42.26■■■■■ 4.35
TPRA1-201ENST00000296210 CLIP1P30622 1438 aa42.23■■■■■ 4.35
TPRA1-201ENST00000296210 IQGAP2Q13576 1575 aa42.19■■■■■ 4.34
TPRA1-201ENST00000296210 OSCARQ8IYS5 282 aa42.08■■■■■ 4.33
TPRA1-201ENST00000296210 JPH4Q96JJ6 628 aa42.03■■■■■ 4.32
TPRA1-201ENST00000296210 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.98■■■■■ 4.31
TPRA1-201ENST00000296210 P3H3Q8IVL6 736 aa41.98■■■■■ 4.31
TPRA1-201ENST00000296210 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.97■■■■■ 4.31
TPRA1-201ENST00000296210 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.97■■■■■ 4.31
TPRA1-201ENST00000296210 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.9■■■■■ 4.3
TPRA1-201ENST00000296210 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.86■■■■■ 4.29
TPRA1-201ENST00000296210 SAMD9Q5K651 1589 aa41.85■■■■■ 4.29
TPRA1-201ENST00000296210 ARAP1Q96P48 1450 aa41.83■■■■■ 4.29
TPRA1-201ENST00000296210 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.81■■■■■ 4.28
TPRA1-201ENST00000296210 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
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TPRA1-201ENST00000296210 DISP1Q96F81 1524 aa41.77■■■■■ 4.28
TPRA1-201ENST00000296210 KIAA0556O60303 1618 aa41.74■■■■■ 4.27
TPRA1-201ENST00000296210 SHROOM2Q13796 1616 aa41.74■■■■■ 4.27
TPRA1-201ENST00000296210 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.73■■■■■ 4.27
TPRA1-201ENST00000296210 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
TPRA1-201ENST00000296210 FMN1Q68DA7 1419 aa41.66■■■■■ 4.26
TPRA1-201ENST00000296210 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
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TPRA1-201ENST00000296210 PTPRGP23470 1445 aa41.5■■■■■ 4.23
TPRA1-201ENST00000296210 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.49■■■■■ 4.23
TPRA1-201ENST00000296210 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.43■■■■■ 4.22
TPRA1-201ENST00000296210 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.38■■■■■ 4.22
TPRA1-201ENST00000296210 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
TPRA1-201ENST00000296210 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
TPRA1-201ENST00000296210 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.28■■■■■ 4.2
TPRA1-201ENST00000296210 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.26■■■■■ 4.2
TPRA1-201ENST00000296210 HECW1Q76N89 1606 aa41.24■■■■■ 4.19
TPRA1-201ENST00000296210 ARHGEF11O15085 1522 aa41.24■■■■■ 4.19
TPRA1-201ENST00000296210 UACAQ9BZF9 1416 aa41.21■■■■■ 4.19
TPRA1-201ENST00000296210 ABCA8O94911 1581 aa41.18■■■■■ 4.18
TPRA1-201ENST00000296210 ARID3CA6NKF2 412 aa41.16■■■■■ 4.18
TPRA1-201ENST00000296210 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
TPRA1-201ENST00000296210 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
TPRA1-201ENST00000296210 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.13■■■■■ 4.18
TPRA1-201ENST00000296210 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
TPRA1-201ENST00000296210 MAP3K1Q13233 1512 aa41.11■■■■■ 4.17
TPRA1-201ENST00000296210 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
TPRA1-201ENST00000296210 TIAM1Q13009 1591 aa41.08■■■■■ 4.17
TPRA1-201ENST00000296210 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.07■■■■■ 4.17
TPRA1-201ENST00000296210 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.07■■■■■ 4.17
TPRA1-201ENST00000296210 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.07■■■■■ 4.17
TPRA1-201ENST00000296210 ABCC2Q92887 1545 aa41.05■■■■■ 4.16
TPRA1-201ENST00000296210 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.02■■■■■ 4.16
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TPRA1-201ENST00000296210 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
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TPRA1-201ENST00000296210 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.98■■■■■ 4.15
TPRA1-201ENST00000296210 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.96■■■■■ 4.15
TPRA1-201ENST00000296210 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.94■■■■■ 4.15
TPRA1-201ENST00000296210 ATP10BO94823 1461 aa40.93■■■■■ 4.14
TPRA1-201ENST00000296210 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.93■■■■■ 4.14
TPRA1-201ENST00000296210 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.88■■■■■ 4.13
TPRA1-201ENST00000296210 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.86■■■■■ 4.13
TPRA1-201ENST00000296210 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.86■■■■■ 4.13
TPRA1-201ENST00000296210 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.82■■■■■ 4.13
TPRA1-201ENST00000296210 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.78■■■■■ 4.12
TPRA1-201ENST00000296210 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
TPRA1-201ENST00000296210 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
TPRA1-201ENST00000296210 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.72■■■■■ 4.11
TPRA1-201ENST00000296210 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.71■■■■■ 4.11
TPRA1-201ENST00000296210 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.71■■■■■ 4.11
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TPRA1-201ENST00000296210 KCNH8Q96L42 1107 aa40.56■■■■■ 4.08
TPRA1-201ENST00000296210 ASXL2Q76L83 1435 aa40.52■■■■■ 4.08
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TPRA1-201ENST00000296210 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.46■■■■■ 4.07
TPRA1-201ENST00000296210 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.39■■■■■ 4.06
TPRA1-201ENST00000296210 MAPKBP1O60336 1514 aa40.37■■■■■ 4.05
TPRA1-201ENST00000296210 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.33■■■■■ 4.05
TPRA1-201ENST00000296210 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.29■■■■■ 4.04
TPRA1-201ENST00000296210 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.28■■■■■ 4.04
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TPRA1-201ENST00000296210 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
TPRA1-201ENST00000296210 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
TPRA1-201ENST00000296210 MIA2Q96PC5 1412 aa40.25■■■■■ 4.03
TPRA1-201ENST00000296210 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.22■■■■■ 4.03
TPRA1-201ENST00000296210 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.21■■■■■ 4.03
TPRA1-201ENST00000296210 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
TPRA1-201ENST00000296210 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.13■■■■■ 4.01
TPRA1-201ENST00000296210 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.12■■■■■ 4.01
TPRA1-201ENST00000296210 PLCH2O75038 1416 aa40.12■■■■■ 4.01
TPRA1-201ENST00000296210 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.11■■■■■ 4.01
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