RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.04■■■■■ 4.32
CXCL2-201ENST00000296031 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.03■■■■■ 4.32
CXCL2-201ENST00000296031 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.01■■■■■ 4.32
CXCL2-201ENST00000296031 JPH4Q96JJ6 628 aa42.01■■■■■ 4.32
CXCL2-201ENST00000296031 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.96■■■■■ 4.31
CXCL2-201ENST00000296031 PRXQ9BXM0 1461 aa41.85■■■■■ 4.29
CXCL2-201ENST00000296031 EEA1Q15075 1411 aa41.83■■■■■ 4.29
CXCL2-201ENST00000296031 IQGAP2Q13576 1575 aa41.83■■■■■ 4.29
CXCL2-201ENST00000296031 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.82■■■■■ 4.29
CXCL2-201ENST00000296031 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
CXCL2-201ENST00000296031 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.71■■■■■ 4.27
CXCL2-201ENST00000296031 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.6■■■■■ 4.25
CXCL2-201ENST00000296031 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.56■■■■■ 4.24
CXCL2-201ENST00000296031 DISP1Q96F81 1524 aa41.51■■■■■ 4.24
CXCL2-201ENST00000296031 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.46■■■■■ 4.23
CXCL2-201ENST00000296031 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.23
CXCL2-201ENST00000296031 PTPRGP23470 1445 aa41.44■■■■■ 4.23
CXCL2-201ENST00000296031 KIAA0556O60303 1618 aa41.44■■■■■ 4.22
CXCL2-201ENST00000296031 KIF21BO75037 1637 aa41.44■■■■■ 4.22
CXCL2-201ENST00000296031 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
CXCL2-201ENST00000296031 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.36■■■■■ 4.21
CXCL2-201ENST00000296031 GOLGA3Q08378 1498 aa41.34■■■■■ 4.21
CXCL2-201ENST00000296031 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.23■■■■■ 4.19
CXCL2-201ENST00000296031 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.22■■■■■ 4.19
CXCL2-201ENST00000296031 UACAQ9BZF9 1416 aa41.16■■■■■ 4.18
CXCL2-201ENST00000296031 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.12■■■■■ 4.17
CXCL2-201ENST00000296031 SAMD9Q5K651 1589 aa41.12■■■■■ 4.17
CXCL2-201ENST00000296031 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
CXCL2-201ENST00000296031 ABCC2Q92887 1545 aa41.11■■■■■ 4.17
CXCL2-201ENST00000296031 P3H3Q8IVL6 736 aa41.1■■■■■ 4.17
CXCL2-201ENST00000296031 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
CXCL2-201ENST00000296031 MAPKBP1O60336 1514 aa41.08■■■■■ 4.17
CXCL2-201ENST00000296031 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.02■■■■■ 4.16
CXCL2-201ENST00000296031 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.97■■■■■ 4.15
CXCL2-201ENST00000296031 ABCA8O94911 1581 aa40.96■■■■■ 4.15
CXCL2-201ENST00000296031 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.93■■■■■ 4.14
CXCL2-201ENST00000296031 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.92■■■■■ 4.14
CXCL2-201ENST00000296031 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
CXCL2-201ENST00000296031 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.9■■■■■ 4.14
CXCL2-201ENST00000296031 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.89■■■■■ 4.14
CXCL2-201ENST00000296031 DIP2BQ9P265 1576 aa40.86■■■■■ 4.13
CXCL2-201ENST00000296031 ASXL2Q76L83 1435 aa40.84■■■■■ 4.13
CXCL2-201ENST00000296031 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.83■■■■■ 4.13
CXCL2-201ENST00000296031 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.76■■■■■ 4.12
CXCL2-201ENST00000296031 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.7■■■■■ 4.11
CXCL2-201ENST00000296031 ARID3CA6NKF2 412 aa40.68■■■■■ 4.1
CXCL2-201ENST00000296031 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.63■■■■■ 4.09
CXCL2-201ENST00000296031 ATP10BO94823 1461 aa40.61■■■■■ 4.09
CXCL2-201ENST00000296031 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
CXCL2-201ENST00000296031 TSPOAP1O95153 1857 aa40.6■■■■■ 4.09
CXCL2-201ENST00000296031 GLI2P10070 1586 aa40.59■■■■■ 4.09
CXCL2-201ENST00000296031 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
CXCL2-201ENST00000296031 FMN1Q68DA7 1419 aa40.52■■■■■ 4.08
CXCL2-201ENST00000296031 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
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CXCL2-201ENST00000296031 KCNH8Q96L42 1107 aa40.46■■■■■ 4.07
CXCL2-201ENST00000296031 CLIP1P30622 1438 aa40.44■■■■■ 4.06
CXCL2-201ENST00000296031 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.44■■■■■ 4.06
CXCL2-201ENST00000296031 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
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CXCL2-201ENST00000296031 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
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CXCL2-201ENST00000296031 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.32■■■■■ 4.05
CXCL2-201ENST00000296031 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.31■■■■■ 4.04
CXCL2-201ENST00000296031 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.26■■■■■ 4.04
CXCL2-201ENST00000296031 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
CXCL2-201ENST00000296031 CD109Q6YHK3 1445 aa40.25■■■■■ 4.03
CXCL2-201ENST00000296031 KDM6BO15054 1643 aa40.25■■■■■ 4.03
CXCL2-201ENST00000296031 CEP162Q5TB80 1403 aa40.25■■■■■ 4.03
CXCL2-201ENST00000296031 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.24■■■■■ 4.03
CXCL2-201ENST00000296031 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.2■■■■■ 4.03
CXCL2-201ENST00000296031 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.2■■■■■ 4.03
CXCL2-201ENST00000296031 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.19■■■■■ 4.02
CXCL2-201ENST00000296031 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.16■■■■■ 4.02
CXCL2-201ENST00000296031 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.12■■■■■ 4.01
CXCL2-201ENST00000296031 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.07■■■■■ 4
CXCL2-201ENST00000296031 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.02■■■■■ 4
CXCL2-201ENST00000296031 TTC37Q6PGP7 1564 aa40■■■■□ 3.99
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CXCL2-201ENST00000296031 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.96■■■■□ 3.99
CXCL2-201ENST00000296031 KIF14Q15058 1648 aa39.92■■■■□ 3.98
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CXCL2-201ENST00000296031 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.83■■■■□ 3.97
CXCL2-201ENST00000296031 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.81■■■■□ 3.96
CXCL2-201ENST00000296031 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.8■■■■□ 3.96
CXCL2-201ENST00000296031 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.79■■■■□ 3.96
CXCL2-201ENST00000296031 FANCAO15360 1455 aa39.78■■■■□ 3.96
CXCL2-201ENST00000296031 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.76■■■■□ 3.96
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CXCL2-201ENST00000296031 RAPGEF3O95398 923 aa39.63■■■■□ 3.93
CXCL2-201ENST00000296031 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.63■■■■□ 3.93
CXCL2-201ENST00000296031 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.61■■■■□ 3.93
CXCL2-201ENST00000296031 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.6■■■■□ 3.93
CXCL2-201ENST00000296031 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.6■■■■□ 3.93
CXCL2-201ENST00000296031 PREX2Q70Z35 1606 aa39.59■■■■□ 3.93
CXCL2-201ENST00000296031 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
CXCL2-201ENST00000296031 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.59■■■■□ 3.93
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