RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.92■□□□□ 0.3
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PTPRG-201ENST00000295874 NCAPD3P42695 1498 aa16.91■□□□□ 0.3
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PTPRG-201ENST00000295874 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.62■□□□□ 0.25
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PTPRG-201ENST00000295874 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.49■□□□□ 0.23
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PTPRG-201ENST00000295874 TOPBP1Q92547 1522 aa16.39■□□□□ 0.21
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PTPRG-201ENST00000295874 CARD11Q9BXL7 1154 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRG-201ENST00000295874 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRG-201ENST00000295874 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRG-201ENST00000295874 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
PTPRG-201ENST00000295874 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP16.34■□□□□ 0.21
PTPRG-201ENST00000295874 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRG-201ENST00000295874 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.33■□□□□ 0.21
PTPRG-201ENST00000295874 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
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PTPRG-201ENST00000295874 ERCC6Q03468 1493 aa16.31■□□□□ 0.2
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