RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294161.10

TTC9C-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC9C, Length 1,833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9C-201ENST00000294161 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TTC9C-201ENST00000294161 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.45■■□□□ 1.18
TTC9C-201ENST00000294161 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TTC9C-201ENST00000294161 FBLN2P98095 1184 aa22.43■■□□□ 1.18
TTC9C-201ENST00000294161 CUL7Q14999 1698 aa22.43■■□□□ 1.18
TTC9C-201ENST00000294161 ARAP1Q96P48 1450 aa22.42■■□□□ 1.18
TTC9C-201ENST00000294161 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
TTC9C-201ENST00000294161 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.39■■□□□ 1.17
TTC9C-201ENST00000294161 CHD1O14646 1710 aa22.38■■□□□ 1.17
TTC9C-201ENST00000294161 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
TTC9C-201ENST00000294161 SYNJ2O15056 1496 aa22.36■■□□□ 1.17
TTC9C-201ENST00000294161 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
TTC9C-201ENST00000294161 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.31■■□□□ 1.16
TTC9C-201ENST00000294161 GRIN2AQ12879 1464 aa22.31■■□□□ 1.16
TTC9C-201ENST00000294161 CEP170Q5SW79 1584 aa22.24■■□□□ 1.15
TTC9C-201ENST00000294161 MAP3K1Q13233 1512 aa22.2■■□□□ 1.14
TTC9C-201ENST00000294161 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.17■■□□□ 1.14
TTC9C-201ENST00000294161 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TTC9C-201ENST00000294161 NUP160Q12769 1436 aa22.15■■□□□ 1.14
TTC9C-201ENST00000294161 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.14■■□□□ 1.14
TTC9C-201ENST00000294161 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TTC9C-201ENST00000294161 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TTC9C-201ENST00000294161 OSCARQ8IYS5 282 aa22.07■■□□□ 1.12
TTC9C-201ENST00000294161 TIAM1Q13009 1591 aa22.07■■□□□ 1.12
TTC9C-201ENST00000294161 IQGAP2Q13576 1575 aa22.07■■□□□ 1.12
TTC9C-201ENST00000294161 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.06■■□□□ 1.12
TTC9C-201ENST00000294161 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.06■■□□□ 1.12
TTC9C-201ENST00000294161 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22■■□□□ 1.11
TTC9C-201ENST00000294161 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.99■■□□□ 1.11
TTC9C-201ENST00000294161 P3H3Q8IVL6 736 aa21.99■■□□□ 1.11
TTC9C-201ENST00000294161 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.98■■□□□ 1.11
TTC9C-201ENST00000294161 FMN1Q68DA7 1419 aa21.97■■□□□ 1.11
TTC9C-201ENST00000294161 JPH4Q96JJ6 628 aa21.97■■□□□ 1.11
TTC9C-201ENST00000294161 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.97■■□□□ 1.11
TTC9C-201ENST00000294161 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.97■■□□□ 1.11
TTC9C-201ENST00000294161 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.97■■□□□ 1.11
TTC9C-201ENST00000294161 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.96■■□□□ 1.11
TTC9C-201ENST00000294161 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
TTC9C-201ENST00000294161 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.93■■□□□ 1.1
TTC9C-201ENST00000294161 SHROOM2Q13796 1616 aa21.93■■□□□ 1.1
TTC9C-201ENST00000294161 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.92■■□□□ 1.1
TTC9C-201ENST00000294161 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
TTC9C-201ENST00000294161 DISP1Q96F81 1524 aa21.9■■□□□ 1.1
TTC9C-201ENST00000294161 SAMD9Q5K651 1589 aa21.89■■□□□ 1.09
TTC9C-201ENST00000294161 KIAA0556O60303 1618 aa21.87■■□□□ 1.09
TTC9C-201ENST00000294161 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TTC9C-201ENST00000294161 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
TTC9C-201ENST00000294161 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
TTC9C-201ENST00000294161 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.78■■□□□ 1.08
TTC9C-201ENST00000294161 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
TTC9C-201ENST00000294161 ARHGEF11O15085 1522 aa21.77■■□□□ 1.08
TTC9C-201ENST00000294161 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.77■■□□□ 1.08
TTC9C-201ENST00000294161 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TTC9C-201ENST00000294161 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.75■■□□□ 1.07
TTC9C-201ENST00000294161 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.75■■□□□ 1.07
TTC9C-201ENST00000294161 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.75■■□□□ 1.07
TTC9C-201ENST00000294161 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.71■■□□□ 1.07
TTC9C-201ENST00000294161 ITGAEP38570 1179 aa21.71■■□□□ 1.07
TTC9C-201ENST00000294161 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
TTC9C-201ENST00000294161 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.69■■□□□ 1.06
TTC9C-201ENST00000294161 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.69■■□□□ 1.06
TTC9C-201ENST00000294161 PTPRGP23470 1445 aa21.68■■□□□ 1.06
TTC9C-201ENST00000294161 ARID3CA6NKF2 412 aa21.66■■□□□ 1.06
TTC9C-201ENST00000294161 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.66■■□□□ 1.06
TTC9C-201ENST00000294161 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.65■■□□□ 1.06
TTC9C-201ENST00000294161 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.65■■□□□ 1.06
TTC9C-201ENST00000294161 HECW1Q76N89 1606 aa21.64■■□□□ 1.05
TTC9C-201ENST00000294161 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.62■■□□□ 1.05
TTC9C-201ENST00000294161 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TTC9C-201ENST00000294161 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.61■■□□□ 1.05
TTC9C-201ENST00000294161 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.59■■□□□ 1.05
TTC9C-201ENST00000294161 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.58■■□□□ 1.05
TTC9C-201ENST00000294161 ABCA8O94911 1581 aa21.58■■□□□ 1.04
TTC9C-201ENST00000294161 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.57■■□□□ 1.04
TTC9C-201ENST00000294161 NCOA2Q15596 1464 aa21.57■■□□□ 1.04
TTC9C-201ENST00000294161 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.56■■□□□ 1.04
TTC9C-201ENST00000294161 UACAQ9BZF9 1416 aa21.54■■□□□ 1.04
TTC9C-201ENST00000294161 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.54■■□□□ 1.04
TTC9C-201ENST00000294161 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TTC9C-201ENST00000294161 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
TTC9C-201ENST00000294161 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
TTC9C-201ENST00000294161 ABCC2Q92887 1545 aa21.5■■□□□ 1.03
TTC9C-201ENST00000294161 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.45■■□□□ 1.03
TTC9C-201ENST00000294161 MAPKBP1O60336 1514 aa21.45■■□□□ 1.02
TTC9C-201ENST00000294161 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.44■■□□□ 1.02
TTC9C-201ENST00000294161 HFM1A2PYH4 1435 aa21.43■■□□□ 1.02
TTC9C-201ENST00000294161 ATP10BO94823 1461 aa21.43■■□□□ 1.02
TTC9C-201ENST00000294161 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
TTC9C-201ENST00000294161 MIA2Q96PC5 1412 aa21.42■■□□□ 1.02
TTC9C-201ENST00000294161 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.42■■□□□ 1.02
TTC9C-201ENST00000294161 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
TTC9C-201ENST00000294161 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TTC9C-201ENST00000294161 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.41■■□□□ 1.02
TTC9C-201ENST00000294161 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TTC9C-201ENST00000294161 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.37■■□□□ 1.01
TTC9C-201ENST00000294161 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
TTC9C-201ENST00000294161 AKNAQ7Z591 1439 aa21.33■■□□□ 1.01
TTC9C-201ENST00000294161 PTPRKQ15262 1439 aa21.32■■□□□ 1
TTC9C-201ENST00000294161 NAIPQ13075 1403 aa21.32■■□□□ 1
TTC9C-201ENST00000294161 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.9 ms