RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281623.7

FBXO4-201, Transcript of F-box protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FBXO4, Length 1,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4-201ENST00000281623 NUP160Q12769 1436 aa26.64■■□□□ 1.86
FBXO4-201ENST00000281623 PRXQ9BXM0 1461 aa26.64■■□□□ 1.86
FBXO4-201ENST00000281623 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.63■■□□□ 1.85
FBXO4-201ENST00000281623 CEP162Q5TB80 1403 aa26.62■■□□□ 1.85
FBXO4-201ENST00000281623 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
FBXO4-201ENST00000281623 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.48■■□□□ 1.83
FBXO4-201ENST00000281623 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.48■■□□□ 1.83
FBXO4-201ENST00000281623 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.48■■□□□ 1.83
FBXO4-201ENST00000281623 ARHGEF11O15085 1522 aa26.47■■□□□ 1.83
FBXO4-201ENST00000281623 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.46■■□□□ 1.83
FBXO4-201ENST00000281623 SHROOM2Q13796 1616 aa26.45■■□□□ 1.82
FBXO4-201ENST00000281623 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.43■■□□□ 1.82
FBXO4-201ENST00000281623 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.39■■□□□ 1.81
FBXO4-201ENST00000281623 IQGAP2Q13576 1575 aa26.38■■□□□ 1.81
FBXO4-201ENST00000281623 CLIP1P30622 1438 aa26.37■■□□□ 1.81
FBXO4-201ENST00000281623 JPH4Q96JJ6 628 aa26.31■■□□□ 1.8
FBXO4-201ENST00000281623 ARAP1Q96P48 1450 aa26.31■■□□□ 1.8
FBXO4-201ENST00000281623 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.28■■□□□ 1.8
FBXO4-201ENST00000281623 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
FBXO4-201ENST00000281623 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
FBXO4-201ENST00000281623 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.22■■□□□ 1.79
FBXO4-201ENST00000281623 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.18■■□□□ 1.78
FBXO4-201ENST00000281623 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.16■■□□□ 1.78
FBXO4-201ENST00000281623 DISP1Q96F81 1524 aa26.16■■□□□ 1.78
FBXO4-201ENST00000281623 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.15■■□□□ 1.78
FBXO4-201ENST00000281623 KIAA0556O60303 1618 aa26.13■■□□□ 1.77
FBXO4-201ENST00000281623 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
FBXO4-201ENST00000281623 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.08■■□□□ 1.76
FBXO4-201ENST00000281623 SAMD9Q5K651 1589 aa26.07■■□□□ 1.76
FBXO4-201ENST00000281623 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
FBXO4-201ENST00000281623 EFCAB5A4FU69 1503 aa26■■□□□ 1.75
FBXO4-201ENST00000281623 PTPRGP23470 1445 aa25.96■■□□□ 1.75
FBXO4-201ENST00000281623 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.91■■□□□ 1.74
FBXO4-201ENST00000281623 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
FBXO4-201ENST00000281623 P3H3Q8IVL6 736 aa25.87■■□□□ 1.73
FBXO4-201ENST00000281623 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.85■■□□□ 1.73
FBXO4-201ENST00000281623 UACAQ9BZF9 1416 aa25.82■■□□□ 1.72
FBXO4-201ENST00000281623 ABCC2Q92887 1545 aa25.81■■□□□ 1.72
FBXO4-201ENST00000281623 APLP2Q06481 763 aa25.81■■□□□ 1.72
FBXO4-201ENST00000281623 ABCA8O94911 1581 aa25.8■■□□□ 1.72
FBXO4-201ENST00000281623 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.8■■□□□ 1.72
FBXO4-201ENST00000281623 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.8■■□□□ 1.72
FBXO4-201ENST00000281623 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.76■■□□□ 1.71
FBXO4-201ENST00000281623 HRCP23327 699 aa25.71■■□□□ 1.71
FBXO4-201ENST00000281623 FMN1Q68DA7 1419 aa25.71■■□□□ 1.71
FBXO4-201ENST00000281623 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
FBXO4-201ENST00000281623 MAP3K1Q13233 1512 aa25.7■■□□□ 1.71
FBXO4-201ENST00000281623 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
FBXO4-201ENST00000281623 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.68■■□□□ 1.7
FBXO4-201ENST00000281623 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.68■■□□□ 1.7
FBXO4-201ENST00000281623 TIAM1Q13009 1591 aa25.66■■□□□ 1.7
FBXO4-201ENST00000281623 MAPKBP1O60336 1514 aa25.65■■□□□ 1.7
FBXO4-201ENST00000281623 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.65■■□□□ 1.7
FBXO4-201ENST00000281623 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.63■■□□□ 1.69
FBXO4-201ENST00000281623 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.63■■□□□ 1.69
FBXO4-201ENST00000281623 HECW1Q76N89 1606 aa25.62■■□□□ 1.69
FBXO4-201ENST00000281623 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
FBXO4-201ENST00000281623 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
FBXO4-201ENST00000281623 ATP10BO94823 1461 aa25.56■■□□□ 1.68
FBXO4-201ENST00000281623 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.54■■□□□ 1.68
FBXO4-201ENST00000281623 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.54■■□□□ 1.68
FBXO4-201ENST00000281623 ASXL2Q76L83 1435 aa25.54■■□□□ 1.68
FBXO4-201ENST00000281623 ARID3CA6NKF2 412 aa25.52■■□□□ 1.68
FBXO4-201ENST00000281623 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.52■■□□□ 1.68
FBXO4-201ENST00000281623 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.5■■□□□ 1.67
FBXO4-201ENST00000281623 DIP2BQ9P265 1576 aa25.5■■□□□ 1.67
FBXO4-201ENST00000281623 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
FBXO4-201ENST00000281623 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
FBXO4-201ENST00000281623 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
FBXO4-201ENST00000281623 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
FBXO4-201ENST00000281623 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.46■■□□□ 1.67
FBXO4-201ENST00000281623 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
FBXO4-201ENST00000281623 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.44■■□□□ 1.66
FBXO4-201ENST00000281623 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
FBXO4-201ENST00000281623 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
FBXO4-201ENST00000281623 GLI2P10070 1586 aa25.38■■□□□ 1.65
FBXO4-201ENST00000281623 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.38■■□□□ 1.65
FBXO4-201ENST00000281623 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.32■■□□□ 1.64
FBXO4-201ENST00000281623 TSPOAP1O95153 1857 aa25.32■■□□□ 1.64
FBXO4-201ENST00000281623 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.31■■□□□ 1.64
FBXO4-201ENST00000281623 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
FBXO4-201ENST00000281623 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.31■■□□□ 1.64
FBXO4-201ENST00000281623 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.29■■□□□ 1.64
FBXO4-201ENST00000281623 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
FBXO4-201ENST00000281623 KCNH8Q96L42 1107 aa25.29■■□□□ 1.64
FBXO4-201ENST00000281623 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
FBXO4-201ENST00000281623 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.28■■□□□ 1.64
FBXO4-201ENST00000281623 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.27■■□□□ 1.64
FBXO4-201ENST00000281623 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.27■■□□□ 1.64
FBXO4-201ENST00000281623 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
FBXO4-201ENST00000281623 KIF14Q15058 1648 aa25.25■■□□□ 1.63
FBXO4-201ENST00000281623 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.24■■□□□ 1.63
FBXO4-201ENST00000281623 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
FBXO4-201ENST00000281623 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
FBXO4-201ENST00000281623 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.2■■□□□ 1.62
FBXO4-201ENST00000281623 CD109Q6YHK3 1445 aa25.17■■□□□ 1.62
FBXO4-201ENST00000281623 NCOA2Q15596 1464 aa25.16■■□□□ 1.62
FBXO4-201ENST00000281623 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
FBXO4-201ENST00000281623 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.15■■□□□ 1.62
FBXO4-201ENST00000281623 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.7 ms