RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278499.6

SESN3-201, Transcript of sestrin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SESN3, Length 1,710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SESN3-201ENST00000278499 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.31■■□□□ 1.16
SESN3-201ENST00000278499 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SESN3-201ENST00000278499 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SESN3-201ENST00000278499 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.24■■□□□ 1.15
SESN3-201ENST00000278499 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.13■■□□□ 1.13
SESN3-201ENST00000278499 IQGAP2Q13576 1575 aa22.08■■□□□ 1.13
SESN3-201ENST00000278499 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SESN3-201ENST00000278499 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.02■■□□□ 1.12
SESN3-201ENST00000278499 PTPRGP23470 1445 aa22■■□□□ 1.11
SESN3-201ENST00000278499 PRXQ9BXM0 1461 aa21.98■■□□□ 1.11
SESN3-201ENST00000278499 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.98■■□□□ 1.11
SESN3-201ENST00000278499 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
SESN3-201ENST00000278499 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.97■■□□□ 1.11
SESN3-201ENST00000278499 DISP1Q96F81 1524 aa21.96■■□□□ 1.11
SESN3-201ENST00000278499 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.94■■□□□ 1.1
SESN3-201ENST00000278499 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.92■■□□□ 1.1
SESN3-201ENST00000278499 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.89■■□□□ 1.1
SESN3-201ENST00000278499 MAPKBP1O60336 1514 aa21.88■■□□□ 1.09
SESN3-201ENST00000278499 KIAA0556O60303 1618 aa21.88■■□□□ 1.09
SESN3-201ENST00000278499 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SESN3-201ENST00000278499 EEA1Q15075 1411 aa21.84■■□□□ 1.09
SESN3-201ENST00000278499 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.84■■□□□ 1.09
SESN3-201ENST00000278499 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.83■■□□□ 1.09
SESN3-201ENST00000278499 UACAQ9BZF9 1416 aa21.83■■□□□ 1.09
SESN3-201ENST00000278499 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.82■■□□□ 1.08
SESN3-201ENST00000278499 ABCC2Q92887 1545 aa21.82■■□□□ 1.08
SESN3-201ENST00000278499 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.82■■□□□ 1.08
SESN3-201ENST00000278499 GOLGA3Q08378 1498 aa21.79■■□□□ 1.08
SESN3-201ENST00000278499 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.79■■□□□ 1.08
SESN3-201ENST00000278499 DIP2BQ9P265 1576 aa21.79■■□□□ 1.08
SESN3-201ENST00000278499 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.73■■□□□ 1.07
SESN3-201ENST00000278499 ASXL2Q76L83 1435 aa21.72■■□□□ 1.07
SESN3-201ENST00000278499 P3H3Q8IVL6 736 aa21.72■■□□□ 1.07
SESN3-201ENST00000278499 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.7■■□□□ 1.06
SESN3-201ENST00000278499 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SESN3-201ENST00000278499 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.66■■□□□ 1.06
SESN3-201ENST00000278499 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SESN3-201ENST00000278499 KIF21BO75037 1637 aa21.64■■□□□ 1.06
SESN3-201ENST00000278499 ABCA8O94911 1581 aa21.64■■□□□ 1.06
SESN3-201ENST00000278499 SAMD9Q5K651 1589 aa21.62■■□□□ 1.05
SESN3-201ENST00000278499 TSPOAP1O95153 1857 aa21.61■■□□□ 1.05
SESN3-201ENST00000278499 ARID3CA6NKF2 412 aa21.59■■□□□ 1.05
SESN3-201ENST00000278499 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SESN3-201ENST00000278499 GLI2P10070 1586 aa21.58■■□□□ 1.04
SESN3-201ENST00000278499 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.56■■□□□ 1.04
SESN3-201ENST00000278499 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.55■■□□□ 1.04
SESN3-201ENST00000278499 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SESN3-201ENST00000278499 KDM6BO15054 1643 aa21.52■■□□□ 1.03
SESN3-201ENST00000278499 KCNH8Q96L42 1107 aa21.51■■□□□ 1.03
SESN3-201ENST00000278499 ATP10BO94823 1461 aa21.49■■□□□ 1.03
SESN3-201ENST00000278499 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SESN3-201ENST00000278499 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.48■■□□□ 1.03
SESN3-201ENST00000278499 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.47■■□□□ 1.03
SESN3-201ENST00000278499 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.47■■□□□ 1.03
SESN3-201ENST00000278499 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SESN3-201ENST00000278499 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SESN3-201ENST00000278499 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SESN3-201ENST00000278499 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.42■■□□□ 1.02
SESN3-201ENST00000278499 CD109Q6YHK3 1445 aa21.41■■□□□ 1.02
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SESN3-201ENST00000278499 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SESN3-201ENST00000278499 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.37■■□□□ 1.01
SESN3-201ENST00000278499 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.36■■□□□ 1.01
SESN3-201ENST00000278499 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.34■■□□□ 1.01
SESN3-201ENST00000278499 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
SESN3-201ENST00000278499 FMN1Q68DA7 1419 aa21.29■■□□□ 1
SESN3-201ENST00000278499 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.29■■□□□ 1
SESN3-201ENST00000278499 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.28■■□□□ 1
SESN3-201ENST00000278499 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
SESN3-201ENST00000278499 HECW1Q76N89 1606 aa21.22■□□□□ 0.99
SESN3-201ENST00000278499 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.18■□□□□ 0.98
SESN3-201ENST00000278499 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.17■□□□□ 0.981e-6■■■□□ 16.6
SESN3-201ENST00000278499 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.15■□□□□ 0.98
SESN3-201ENST00000278499 CLIP1P30622 1438 aa21.15■□□□□ 0.98
SESN3-201ENST00000278499 NEO1Q92859 1461 aa21.14■□□□□ 0.97
SESN3-201ENST00000278499 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.14■□□□□ 0.97
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SESN3-201ENST00000278499 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
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SESN3-201ENST00000278499 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.1■□□□□ 0.97
SESN3-201ENST00000278499 FANCAO15360 1455 aa21.09■□□□□ 0.97
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SESN3-201ENST00000278499 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.08■□□□□ 0.96
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SESN3-201ENST00000278499 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.03■□□□□ 0.96
SESN3-201ENST00000278499 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
SESN3-201ENST00000278499 CEP162Q5TB80 1403 aa21■□□□□ 0.95
SESN3-201ENST00000278499 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.97■□□□□ 0.95
SESN3-201ENST00000278499 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.96■□□□□ 0.95
SESN3-201ENST00000278499 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.95■□□□□ 0.94
SESN3-201ENST00000278499 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.95■□□□□ 0.94
SESN3-201ENST00000278499 RICTORQ6R327 1708 aa20.95■□□□□ 0.94
SESN3-201ENST00000278499 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.94■□□□□ 0.94
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