RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000274606.7

NHP2-201, Transcript of NHP2 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NHP2, Length 865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHP2-201ENST00000274606 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.2■□□□□ 0.98
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NHP2-201ENST00000274606 IQGAP2Q13576 1575 aa21.13■□□□□ 0.97
NHP2-201ENST00000274606 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.09■□□□□ 0.97
NHP2-201ENST00000274606 EEA1Q15075 1411 aa21.08■□□□□ 0.97
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NHP2-201ENST00000274606 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.07■□□□□ 0.96
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NHP2-201ENST00000274606 KIAA0556O60303 1618 aa20.93■□□□□ 0.94
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NHP2-201ENST00000274606 TSPOAP1O95153 1857 aa20.52■□□□□ 0.88
NHP2-201ENST00000274606 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.52■□□□□ 0.88
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NHP2-201ENST00000274606 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NHP2-201ENST00000274606 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
NHP2-201ENST00000274606 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
NHP2-201ENST00000274606 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.34■□□□□ 0.85
NHP2-201ENST00000274606 CD109Q6YHK3 1445 aa20.31■□□□□ 0.84
NHP2-201ENST00000274606 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.3■□□□□ 0.84
NHP2-201ENST00000274606 CEP162Q5TB80 1403 aa20.29■□□□□ 0.84
NHP2-201ENST00000274606 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.27■□□□□ 0.84
NHP2-201ENST00000274606 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.27■□□□□ 0.83
NHP2-201ENST00000274606 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.27■□□□□ 0.83
NHP2-201ENST00000274606 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.26■□□□□ 0.83
NHP2-201ENST00000274606 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.25■□□□□ 0.83
NHP2-201ENST00000274606 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.23■□□□□ 0.83
NHP2-201ENST00000274606 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.23■□□□□ 0.83
NHP2-201ENST00000274606 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.21■□□□□ 0.83
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NHP2-201ENST00000274606 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
NHP2-201ENST00000274606 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.13■□□□□ 0.81
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NHP2-201ENST00000274606 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.01■□□□□ 0.79
NHP2-201ENST00000274606 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.01■□□□□ 0.79
NHP2-201ENST00000274606 PREX2Q70Z35 1606 aa20.01■□□□□ 0.79
NHP2-201ENST00000274606 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20■□□□□ 0.79
NHP2-201ENST00000274606 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
NHP2-201ENST00000274606 ADGRL1O94910 1474 aa19.99■□□□□ 0.79
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NHP2-201ENST00000274606 RICTORQ6R327 1708 aa19.98■□□□□ 0.79
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