RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000274063.4

SFRP2-201, Transcript of secreted frizzled related protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP2, Length 2,032 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2-201ENST00000274063 CEP162Q5TB80 1403 aa26.51■■□□□ 1.83
SFRP2-201ENST00000274063 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
SFRP2-201ENST00000274063 CEP170Q5SW79 1584 aa26.48■■□□□ 1.83
SFRP2-201ENST00000274063 NUP160Q12769 1436 aa26.42■■□□□ 1.82
SFRP2-201ENST00000274063 CLIP1P30622 1438 aa26.4■■□□□ 1.82
SFRP2-201ENST00000274063 IQGAP2Q13576 1575 aa26.4■■□□□ 1.82
SFRP2-201ENST00000274063 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.37■■□□□ 1.81
SFRP2-201ENST00000274063 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.3■■□□□ 1.8
SFRP2-201ENST00000274063 SAMD9Q5K651 1589 aa26.25■■□□□ 1.79
SFRP2-201ENST00000274063 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.24■■□□□ 1.79
SFRP2-201ENST00000274063 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.24■■□□□ 1.79
SFRP2-201ENST00000274063 ARAP1Q96P48 1450 aa26.23■■□□□ 1.79
SFRP2-201ENST00000274063 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.22■■□□□ 1.79
SFRP2-201ENST00000274063 P3H3Q8IVL6 736 aa26.21■■□□□ 1.79
SFRP2-201ENST00000274063 JPH4Q96JJ6 628 aa26.18■■□□□ 1.78
SFRP2-201ENST00000274063 DISP1Q96F81 1524 aa26.16■■□□□ 1.78
SFRP2-201ENST00000274063 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.16■■□□□ 1.78
SFRP2-201ENST00000274063 SHROOM2Q13796 1616 aa26.16■■□□□ 1.78
SFRP2-201ENST00000274063 KIAA0556O60303 1618 aa26.14■■□□□ 1.78
SFRP2-201ENST00000274063 OSCARQ8IYS5 282 aa26.13■■□□□ 1.77
SFRP2-201ENST00000274063 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.1■■□□□ 1.77
SFRP2-201ENST00000274063 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
SFRP2-201ENST00000274063 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.04■■□□□ 1.76
SFRP2-201ENST00000274063 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.04■■□□□ 1.76
SFRP2-201ENST00000274063 FMN1Q68DA7 1419 aa25.98■■□□□ 1.75
SFRP2-201ENST00000274063 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
SFRP2-201ENST00000274063 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
SFRP2-201ENST00000274063 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.89■■□□□ 1.73
SFRP2-201ENST00000274063 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.88■■□□□ 1.73
SFRP2-201ENST00000274063 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.86■■□□□ 1.73
SFRP2-201ENST00000274063 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
SFRP2-201ENST00000274063 PTPRGP23470 1445 aa25.85■■□□□ 1.73
SFRP2-201ENST00000274063 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.84■■□□□ 1.73
SFRP2-201ENST00000274063 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.84■■□□□ 1.73
SFRP2-201ENST00000274063 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
SFRP2-201ENST00000274063 HECW1Q76N89 1606 aa25.8■■□□□ 1.72
SFRP2-201ENST00000274063 ABCA8O94911 1581 aa25.78■■□□□ 1.72
SFRP2-201ENST00000274063 APLP2Q06481 763 aa25.78■■□□□ 1.72
SFRP2-201ENST00000274063 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.76■■□□□ 1.71
SFRP2-201ENST00000274063 TIAM1Q13009 1591 aa25.76■■□□□ 1.71
SFRP2-201ENST00000274063 ARHGEF11O15085 1522 aa25.76■■□□□ 1.71
SFRP2-201ENST00000274063 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
SFRP2-201ENST00000274063 ARID3CA6NKF2 412 aa25.71■■□□□ 1.71
SFRP2-201ENST00000274063 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
SFRP2-201ENST00000274063 MAP3K1Q13233 1512 aa25.71■■□□□ 1.71
SFRP2-201ENST00000274063 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
SFRP2-201ENST00000274063 UACAQ9BZF9 1416 aa25.69■■□□□ 1.7
SFRP2-201ENST00000274063 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.69■■□□□ 1.7
SFRP2-201ENST00000274063 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.69■■□□□ 1.7
SFRP2-201ENST00000274063 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.69■■□□□ 1.7
SFRP2-201ENST00000274063 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.68■■□□□ 1.7
SFRP2-201ENST00000274063 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
SFRP2-201ENST00000274063 ABCC2Q92887 1545 aa25.65■■□□□ 1.7
SFRP2-201ENST00000274063 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.62■■□□□ 1.69
SFRP2-201ENST00000274063 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.61■■□□□ 1.69
SFRP2-201ENST00000274063 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.59■■□□□ 1.69
SFRP2-201ENST00000274063 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.59■■□□□ 1.69
SFRP2-201ENST00000274063 ATP10BO94823 1461 aa25.59■■□□□ 1.69
SFRP2-201ENST00000274063 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
SFRP2-201ENST00000274063 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
SFRP2-201ENST00000274063 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.53■■□□□ 1.68
SFRP2-201ENST00000274063 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
SFRP2-201ENST00000274063 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.5■■□□□ 1.67
SFRP2-201ENST00000274063 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.5■■□□□ 1.67
SFRP2-201ENST00000274063 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.49■■□□□ 1.67
SFRP2-201ENST00000274063 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
SFRP2-201ENST00000274063 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
SFRP2-201ENST00000274063 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
SFRP2-201ENST00000274063 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.4■■□□□ 1.66
SFRP2-201ENST00000274063 KIF14Q15058 1648 aa25.39■■□□□ 1.66
SFRP2-201ENST00000274063 NCOA2Q15596 1464 aa25.39■■□□□ 1.65
SFRP2-201ENST00000274063 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.37■■□□□ 1.65
SFRP2-201ENST00000274063 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
SFRP2-201ENST00000274063 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.64
SFRP2-201ENST00000274063 ASXL2Q76L83 1435 aa25.28■■□□□ 1.64
SFRP2-201ENST00000274063 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.28■■□□□ 1.64
SFRP2-201ENST00000274063 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.26■■□□□ 1.63
SFRP2-201ENST00000274063 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.26■■□□□ 1.63
SFRP2-201ENST00000274063 KCNH8Q96L42 1107 aa25.25■■□□□ 1.63
SFRP2-201ENST00000274063 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.25■■□□□ 1.63
SFRP2-201ENST00000274063 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.24■■□□□ 1.63
SFRP2-201ENST00000274063 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.24■■□□□ 1.63
SFRP2-201ENST00000274063 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.23■■□□□ 1.63
SFRP2-201ENST00000274063 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SFRP2-201ENST00000274063 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
SFRP2-201ENST00000274063 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.22■■□□□ 1.63
SFRP2-201ENST00000274063 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.21■■□□□ 1.63
SFRP2-201ENST00000274063 MAPKBP1O60336 1514 aa25.2■■□□□ 1.63
SFRP2-201ENST00000274063 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.2■■□□□ 1.62
SFRP2-201ENST00000274063 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SFRP2-201ENST00000274063 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.15■■□□□ 1.62
SFRP2-201ENST00000274063 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.15■■□□□ 1.62
SFRP2-201ENST00000274063 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.14■■□□□ 1.62
SFRP2-201ENST00000274063 PREX2Q70Z35 1606 aa25.14■■□□□ 1.61
SFRP2-201ENST00000274063 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.13■■□□□ 1.61
SFRP2-201ENST00000274063 MIA2Q96PC5 1412 aa25.11■■□□□ 1.61
SFRP2-201ENST00000274063 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SFRP2-201ENST00000274063 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SFRP2-201ENST00000274063 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SFRP2-201ENST00000274063 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
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