RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272139.4

C1orf35-201, Transcript of chromosome 1 open reading frame 35, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C1orf35, Length 1,427 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf35-201ENST00000272139 NUP160Q12769 1436 aa37.95■■■■□ 3.67
C1orf35-201ENST00000272139 CEP170Q5SW79 1584 aa37.9■■■■□ 3.66
C1orf35-201ENST00000272139 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.78■■■■□ 3.64
C1orf35-201ENST00000272139 PRXQ9BXM0 1461 aa37.76■■■■□ 3.64
C1orf35-201ENST00000272139 SHROOM2Q13796 1616 aa37.71■■■■□ 3.63
C1orf35-201ENST00000272139 KIF21BO75037 1637 aa37.59■■■■□ 3.61
C1orf35-201ENST00000272139 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.58■■■■□ 3.61
C1orf35-201ENST00000272139 JPH4Q96JJ6 628 aa37.53■■■■□ 3.6
C1orf35-201ENST00000272139 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.59
C1orf35-201ENST00000272139 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.5■■■■□ 3.59
C1orf35-201ENST00000272139 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.47■■■■□ 3.59
C1orf35-201ENST00000272139 GOLGA3Q08378 1498 aa37.43■■■■□ 3.58
C1orf35-201ENST00000272139 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.42■■■■□ 3.58
C1orf35-201ENST00000272139 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
C1orf35-201ENST00000272139 IQGAP2Q13576 1575 aa37.36■■■■□ 3.57
C1orf35-201ENST00000272139 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.35■■■■□ 3.57
C1orf35-201ENST00000272139 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.15■■■■□ 3.54
C1orf35-201ENST00000272139 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.15■■■■□ 3.54
C1orf35-201ENST00000272139 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.14■■■■□ 3.54
C1orf35-201ENST00000272139 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
C1orf35-201ENST00000272139 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.07■■■■□ 3.52
C1orf35-201ENST00000272139 DISP1Q96F81 1524 aa37.02■■■■□ 3.52
C1orf35-201ENST00000272139 PTPRGP23470 1445 aa37.02■■■■□ 3.52
C1orf35-201ENST00000272139 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.99■■■■□ 3.51
C1orf35-201ENST00000272139 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.99■■■■□ 3.51
C1orf35-201ENST00000272139 KIAA0556O60303 1618 aa36.98■■■■□ 3.51
C1orf35-201ENST00000272139 SAMD9Q5K651 1589 aa36.92■■■■□ 3.5
C1orf35-201ENST00000272139 P3H3Q8IVL6 736 aa36.91■■■■□ 3.5
C1orf35-201ENST00000272139 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.88■■■■□ 3.49
C1orf35-201ENST00000272139 MAPKBP1O60336 1514 aa36.88■■■■□ 3.49
C1orf35-201ENST00000272139 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
C1orf35-201ENST00000272139 CLIP1P30622 1438 aa36.79■■■■□ 3.48
C1orf35-201ENST00000272139 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.78■■■■□ 3.48
C1orf35-201ENST00000272139 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.78■■■■□ 3.48
C1orf35-201ENST00000272139 UACAQ9BZF9 1416 aa36.77■■■■□ 3.48
C1orf35-201ENST00000272139 ABCC2Q92887 1545 aa36.76■■■■□ 3.48
C1orf35-201ENST00000272139 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.75■■■■□ 3.47
C1orf35-201ENST00000272139 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.75■■■■□ 3.47
C1orf35-201ENST00000272139 CEP162Q5TB80 1403 aa36.75■■■■□ 3.47
C1orf35-201ENST00000272139 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.74■■■■□ 3.47
C1orf35-201ENST00000272139 DIP2BQ9P265 1576 aa36.66■■■■□ 3.46
C1orf35-201ENST00000272139 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.65■■■■□ 3.46
C1orf35-201ENST00000272139 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.59■■■■□ 3.45
C1orf35-201ENST00000272139 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.57■■■■□ 3.44
C1orf35-201ENST00000272139 FMN1Q68DA7 1419 aa36.56■■■■□ 3.44
C1orf35-201ENST00000272139 ASXL2Q76L83 1435 aa36.55■■■■□ 3.44
C1orf35-201ENST00000272139 ABCA8O94911 1581 aa36.53■■■■□ 3.44
C1orf35-201ENST00000272139 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
C1orf35-201ENST00000272139 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.48■■■■□ 3.43
C1orf35-201ENST00000272139 GLI2P10070 1586 aa36.41■■■■□ 3.42
C1orf35-201ENST00000272139 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
C1orf35-201ENST00000272139 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
C1orf35-201ENST00000272139 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
C1orf35-201ENST00000272139 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.32■■■■□ 3.4
C1orf35-201ENST00000272139 ARID3CA6NKF2 412 aa36.32■■■■□ 3.4
C1orf35-201ENST00000272139 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.31■■■■□ 3.4
C1orf35-201ENST00000272139 HECW1Q76N89 1606 aa36.31■■■■□ 3.4
C1orf35-201ENST00000272139 TSPOAP1O95153 1857 aa36.3■■■■□ 3.4
C1orf35-201ENST00000272139 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
C1orf35-201ENST00000272139 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.27■■■■□ 3.4
C1orf35-201ENST00000272139 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
C1orf35-201ENST00000272139 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.4
C1orf35-201ENST00000272139 ATP10BO94823 1461 aa36.26■■■■□ 3.39
C1orf35-201ENST00000272139 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.26■■■■□ 3.39
C1orf35-201ENST00000272139 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.21■■■■□ 3.39
C1orf35-201ENST00000272139 KDM6BO15054 1643 aa36.2■■■■□ 3.38
C1orf35-201ENST00000272139 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.17■■■■□ 3.38
C1orf35-201ENST00000272139 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
C1orf35-201ENST00000272139 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
C1orf35-201ENST00000272139 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.13■■■■□ 3.37
C1orf35-201ENST00000272139 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.12■■■■□ 3.37
C1orf35-201ENST00000272139 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.08■■■■□ 3.37
C1orf35-201ENST00000272139 KCNH8Q96L42 1107 aa36.08■■■■□ 3.37
C1orf35-201ENST00000272139 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.07■■■■□ 3.36
C1orf35-201ENST00000272139 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
C1orf35-201ENST00000272139 CD109Q6YHK3 1445 aa36.02■■■■□ 3.36
C1orf35-201ENST00000272139 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.98■■■■□ 3.35
C1orf35-201ENST00000272139 APLP2Q06481 763 aa35.98■■■■□ 3.35
C1orf35-201ENST00000272139 TIAM1Q13009 1591 aa35.9■■■■□ 3.34
C1orf35-201ENST00000272139 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.89■■■■□ 3.34
C1orf35-201ENST00000272139 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
C1orf35-201ENST00000272139 MAP3K1Q13233 1512 aa35.87■■■■□ 3.33
C1orf35-201ENST00000272139 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.84■■■■□ 3.33
C1orf35-201ENST00000272139 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
C1orf35-201ENST00000272139 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
C1orf35-201ENST00000272139 KIF14Q15058 1648 aa35.76■■■■□ 3.32
C1orf35-201ENST00000272139 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.74■■■■□ 3.31
C1orf35-201ENST00000272139 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.74■■■■□ 3.31
C1orf35-201ENST00000272139 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.73■■■■□ 3.31
C1orf35-201ENST00000272139 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
C1orf35-201ENST00000272139 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.7■■■■□ 3.31
C1orf35-201ENST00000272139 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.68■■■■□ 3.3
C1orf35-201ENST00000272139 NEO1Q92859 1461 aa35.67■■■■□ 3.3
C1orf35-201ENST00000272139 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.64■■■■□ 3.3
C1orf35-201ENST00000272139 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
C1orf35-201ENST00000272139 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.57■■■■□ 3.29
C1orf35-201ENST00000272139 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.56■■■■□ 3.28
C1orf35-201ENST00000272139 NCOA2Q15596 1464 aa35.55■■■■□ 3.28
C1orf35-201ENST00000272139 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.53■■■■□ 3.28
C1orf35-201ENST00000272139 PLCH2O75038 1416 aa35.51■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms