RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264039.6

GPC1-201, Transcript of glypican 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPC1, Length 3,713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-201ENST00000264039 MRS2Q9HD23 443 aa22.27■■□□□ 1.16
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GPC1-201ENST00000264039 TONSLQ96HA7 1378 aa22.24■■□□□ 1.15
GPC1-201ENST00000264039 IL27Q8NEV9 243 aa22.24■■□□□ 1.15
GPC1-201ENST00000264039 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.23■■□□□ 1.15
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GPC1-201ENST00000264039 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.15■■□□□ 1.14
GPC1-201ENST00000264039 EEA1Q15075 1411 aa22.07■■□□□ 1.12
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GPC1-201ENST00000264039 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.06■■□□□ 1.12
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GPC1-201ENST00000264039 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.03■■□□□ 1.12
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GPC1-201ENST00000264039 SLC4A3P48751 1232 aa21.84■■□□□ 1.09
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GPC1-201ENST00000264039 SKAP1Q86WV1 359 aa21.57■■□□□ 1.04
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GPC1-201ENST00000264039 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
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