RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252487.9

TOMM40-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-201ENST00000252487 CEP170Q5SW79 1584 aa42.21■■■■■ 4.35
TOMM40-201ENST00000252487 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.13■■■■■ 4.33
TOMM40-201ENST00000252487 NUP160Q12769 1436 aa42.11■■■■■ 4.33
TOMM40-201ENST00000252487 CEP162Q5TB80 1403 aa42.03■■■■■ 4.32
TOMM40-201ENST00000252487 IQGAP2Q13576 1575 aa42■■■■■ 4.31
TOMM40-201ENST00000252487 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.99■■■■■ 4.31
TOMM40-201ENST00000252487 CLIP1P30622 1438 aa41.89■■■■■ 4.3
TOMM40-201ENST00000252487 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.85■■■■■ 4.29
TOMM40-201ENST00000252487 OSCARQ8IYS5 282 aa41.78■■■■■ 4.28
TOMM40-201ENST00000252487 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.77■■■■■ 4.28
TOMM40-201ENST00000252487 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.76■■■■■ 4.27
TOMM40-201ENST00000252487 P3H3Q8IVL6 736 aa41.72■■■■■ 4.27
TOMM40-201ENST00000252487 JPH4Q96JJ6 628 aa41.72■■■■■ 4.27
TOMM40-201ENST00000252487 SAMD9Q5K651 1589 aa41.7■■■■■ 4.27
TOMM40-201ENST00000252487 SHROOM2Q13796 1616 aa41.67■■■■■ 4.26
TOMM40-201ENST00000252487 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.67■■■■■ 4.26
TOMM40-201ENST00000252487 DISP1Q96F81 1524 aa41.64■■■■■ 4.26
TOMM40-201ENST00000252487 ARAP1Q96P48 1450 aa41.64■■■■■ 4.26
TOMM40-201ENST00000252487 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.62■■■■■ 4.25
TOMM40-201ENST00000252487 KIAA0556O60303 1618 aa41.6■■■■■ 4.25
TOMM40-201ENST00000252487 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
TOMM40-201ENST00000252487 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.56■■■■■ 4.24
TOMM40-201ENST00000252487 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.48■■■■■ 4.23
TOMM40-201ENST00000252487 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.46■■■■■ 4.23
TOMM40-201ENST00000252487 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.37■■■■■ 4.21
TOMM40-201ENST00000252487 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
TOMM40-201ENST00000252487 FMN1Q68DA7 1419 aa41.26■■■■■ 4.2
TOMM40-201ENST00000252487 PTPRGP23470 1445 aa41.2■■■■■ 4.19
TOMM40-201ENST00000252487 ARHGEF11O15085 1522 aa41.18■■■■■ 4.18
TOMM40-201ENST00000252487 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.14■■■■■ 4.18
TOMM40-201ENST00000252487 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.18
TOMM40-201ENST00000252487 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.11■■■■■ 4.17
TOMM40-201ENST00000252487 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.09■■■■■ 4.17
TOMM40-201ENST00000252487 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.09■■■■■ 4.17
TOMM40-201ENST00000252487 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.09■■■■■ 4.17
TOMM40-201ENST00000252487 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.08■■■■■ 4.17
TOMM40-201ENST00000252487 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.08■■■■■ 4.17
TOMM40-201ENST00000252487 ABCA8O94911 1581 aa41.05■■■■■ 4.16
TOMM40-201ENST00000252487 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.03■■■■■ 4.16
TOMM40-201ENST00000252487 ARID3CA6NKF2 412 aa41.01■■■■■ 4.16
TOMM40-201ENST00000252487 HECW1Q76N89 1606 aa41■■■■■ 4.15
TOMM40-201ENST00000252487 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
TOMM40-201ENST00000252487 UACAQ9BZF9 1416 aa40.95■■■■■ 4.15
TOMM40-201ENST00000252487 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
TOMM40-201ENST00000252487 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.14
TOMM40-201ENST00000252487 ABCC2Q92887 1545 aa40.87■■■■■ 4.13
TOMM40-201ENST00000252487 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
TOMM40-201ENST00000252487 APLP2Q06481 763 aa40.86■■■■■ 4.13
TOMM40-201ENST00000252487 TIAM1Q13009 1591 aa40.85■■■■■ 4.13
TOMM40-201ENST00000252487 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.85■■■■■ 4.13
TOMM40-201ENST00000252487 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.83■■■■■ 4.13
TOMM40-201ENST00000252487 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.79■■■■■ 4.12
TOMM40-201ENST00000252487 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.78■■■■■ 4.12
TOMM40-201ENST00000252487 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.78■■■■■ 4.12
TOMM40-201ENST00000252487 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.11
TOMM40-201ENST00000252487 ATP10BO94823 1461 aa40.74■■■■■ 4.11
TOMM40-201ENST00000252487 MAP3K1Q13233 1512 aa40.74■■■■■ 4.11
TOMM40-201ENST00000252487 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
TOMM40-201ENST00000252487 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
TOMM40-201ENST00000252487 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.67■■■■■ 4.1
TOMM40-201ENST00000252487 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
TOMM40-201ENST00000252487 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.64■■■■■ 4.1
TOMM40-201ENST00000252487 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.62■■■■■ 4.09
TOMM40-201ENST00000252487 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.62■■■■■ 4.09
TOMM40-201ENST00000252487 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.55■■■■■ 4.08
TOMM40-201ENST00000252487 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.5■■■■■ 4.07
TOMM40-201ENST00000252487 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
TOMM40-201ENST00000252487 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
TOMM40-201ENST00000252487 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.43■■■■■ 4.06
TOMM40-201ENST00000252487 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.42■■■■■ 4.06
TOMM40-201ENST00000252487 KIF14Q15058 1648 aa40.39■■■■■ 4.06
TOMM40-201ENST00000252487 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
TOMM40-201ENST00000252487 ASXL2Q76L83 1435 aa40.34■■■■■ 4.05
TOMM40-201ENST00000252487 NCOA2Q15596 1464 aa40.33■■■■■ 4.05
TOMM40-201ENST00000252487 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.3■■■■■ 4.04
TOMM40-201ENST00000252487 KCNH8Q96L42 1107 aa40.28■■■■■ 4.04
TOMM40-201ENST00000252487 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.27■■■■■ 4.04
TOMM40-201ENST00000252487 MAPKBP1O60336 1514 aa40.2■■■■■ 4.03
TOMM40-201ENST00000252487 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.16■■■■■ 4.02
TOMM40-201ENST00000252487 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.15■■■■■ 4.02
TOMM40-201ENST00000252487 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.14■■■■■ 4.027e-7■■■■□ 22.9
TOMM40-201ENST00000252487 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.09■■■■■ 4.01
TOMM40-201ENST00000252487 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.08■■■■■ 4.01
TOMM40-201ENST00000252487 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.06■■■■■ 4
TOMM40-201ENST00000252487 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
TOMM40-201ENST00000252487 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40■■■■□ 3.99
TOMM40-201ENST00000252487 FGD6Q6ZV73 1430 aa40■■■■□ 3.99
TOMM40-201ENST00000252487 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.99■■■■□ 3.99
TOMM40-201ENST00000252487 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
TOMM40-201ENST00000252487 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
TOMM40-201ENST00000252487 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.97■■■■□ 3.99
TOMM40-201ENST00000252487 PREX2Q70Z35 1606 aa39.95■■■■□ 3.99
TOMM40-201ENST00000252487 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.94■■■■□ 3.98
TOMM40-201ENST00000252487 DIP2BQ9P265 1576 aa39.94■■■■□ 3.98
TOMM40-201ENST00000252487 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.9■■■■□ 3.98
TOMM40-201ENST00000252487 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
TOMM40-201ENST00000252487 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP39.88■■■■□ 3.97
TOMM40-201ENST00000252487 MIA2Q96PC5 1412 aa39.86■■■■□ 3.97
TOMM40-201ENST00000252487 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.85■■■■□ 3.97
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 719.8 ms