RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
VGF-201ENST00000249330 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.51■■■□□ 2.47
VGF-201ENST00000249330 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
VGF-201ENST00000249330 IFT140Q96RY7 1462 aa30.48■■■□□ 2.47
VGF-201ENST00000249330 APLP2Q06481 763 aa30.41■■■□□ 2.46
VGF-201ENST00000249330 NEUROD1Q13562 356 aa30.4■■■□□ 2.46
VGF-201ENST00000249330 P3H3Q8IVL6 736 aa30.4■■■□□ 2.46
VGF-201ENST00000249330 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
VGF-201ENST00000249330 PBRM1Q86U86 1689 aa30.38■■■□□ 2.45
VGF-201ENST00000249330 GRIN2BQ13224 1484 aa30.34■■■□□ 2.45
VGF-201ENST00000249330 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
VGF-201ENST00000249330 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.29■■■□□ 2.44
VGF-201ENST00000249330 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.28■■■□□ 2.44
VGF-201ENST00000249330 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
VGF-201ENST00000249330 ADAMTS12P58397 1594 aa30.24■■■□□ 2.43
VGF-201ENST00000249330 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
VGF-201ENST00000249330 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.21■■■□□ 2.43
VGF-201ENST00000249330 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.2■■■□□ 2.42
VGF-201ENST00000249330 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa30.18■■■□□ 2.42
VGF-201ENST00000249330 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
VGF-201ENST00000249330 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.1■■■□□ 2.41
VGF-201ENST00000249330 FBLN2P98095 1184 aa30.07■■■□□ 2.4
VGF-201ENST00000249330 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
VGF-201ENST00000249330 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
VGF-201ENST00000249330 GRIN2AQ12879 1464 aa30.01■■■□□ 2.39
VGF-201ENST00000249330 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
VGF-201ENST00000249330 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
VGF-201ENST00000249330 SAMD9Q5K651 1589 aa30■■■□□ 2.39
VGF-201ENST00000249330 MYT1Q01538 1121 aa29.99■■■□□ 2.39
VGF-201ENST00000249330 IQGAP2Q13576 1575 aa29.99■■■□□ 2.39
VGF-201ENST00000249330 SYNJ2O15056 1496 aa29.95■■■□□ 2.38
VGF-201ENST00000249330 FMN1Q68DA7 1419 aa29.93■■■□□ 2.38
VGF-201ENST00000249330 TIAM1Q13009 1591 aa29.93■■■□□ 2.38
VGF-201ENST00000249330 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
VGF-201ENST00000249330 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.91■■■□□ 2.38
VGF-201ENST00000249330 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.9■■■□□ 2.38
VGF-201ENST00000249330 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.87■■■□□ 2.37
VGF-201ENST00000249330 MAP3K1Q13233 1512 aa29.86■■■□□ 2.37
VGF-201ENST00000249330 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.84■■■□□ 2.37
VGF-201ENST00000249330 CEP170Q5SW79 1584 aa29.83■■■□□ 2.37
VGF-201ENST00000249330 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.81■■■□□ 2.36
VGF-201ENST00000249330 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.76■■■□□ 2.35
VGF-201ENST00000249330 DISP1Q96F81 1524 aa29.75■■■□□ 2.35
VGF-201ENST00000249330 NUP160Q12769 1436 aa29.74■■■□□ 2.35
VGF-201ENST00000249330 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
VGF-201ENST00000249330 JPH4Q96JJ6 628 aa29.7■■■□□ 2.35
VGF-201ENST00000249330 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
VGF-201ENST00000249330 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.7■■■□□ 2.34
VGF-201ENST00000249330 ARID3CA6NKF2 412 aa29.69■■■□□ 2.34
VGF-201ENST00000249330 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.69■■■□□ 2.34
VGF-201ENST00000249330 KIAA0556O60303 1618 aa29.68■■■□□ 2.34
VGF-201ENST00000249330 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.66■■■□□ 2.34
VGF-201ENST00000249330 MIER1Q8N108 512 aa29.63■■■□□ 2.33
VGF-201ENST00000249330 ITGAEP38570 1179 aa29.62■■■□□ 2.33
VGF-201ENST00000249330 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.62■■■□□ 2.33
VGF-201ENST00000249330 CHD1O14646 1710 aa29.56■■■□□ 2.32
VGF-201ENST00000249330 HECW1Q76N89 1606 aa29.54■■■□□ 2.32
VGF-201ENST00000249330 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
VGF-201ENST00000249330 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
VGF-201ENST00000249330 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
VGF-201ENST00000249330 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.51■■■□□ 2.32
VGF-201ENST00000249330 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.51■■■□□ 2.31
VGF-201ENST00000249330 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.5■■■□□ 2.31
VGF-201ENST00000249330 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.46■■■□□ 2.31
VGF-201ENST00000249330 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
VGF-201ENST00000249330 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
VGF-201ENST00000249330 NCOA2Q15596 1464 aa29.43■■■□□ 2.3
VGF-201ENST00000249330 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.42■■■□□ 2.3
VGF-201ENST00000249330 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.41■■■□□ 2.3
VGF-201ENST00000249330 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.36■■■□□ 2.29
VGF-201ENST00000249330 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
VGF-201ENST00000249330 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.31■■■□□ 2.28
VGF-201ENST00000249330 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.31■■■□□ 2.28
VGF-201ENST00000249330 ARHGEF11O15085 1522 aa29.28■■■□□ 2.28
VGF-201ENST00000249330 PTPRGP23470 1445 aa29.28■■■□□ 2.28
VGF-201ENST00000249330 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
VGF-201ENST00000249330 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.24■■■□□ 2.27
VGF-201ENST00000249330 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.23■■■□□ 2.27
VGF-201ENST00000249330 SHROOM2Q13796 1616 aa29.22■■■□□ 2.27
VGF-201ENST00000249330 ABCA8O94911 1581 aa29.22■■■□□ 2.27
VGF-201ENST00000249330 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
VGF-201ENST00000249330 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.2■■■□□ 2.27
VGF-201ENST00000249330 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.16■■■□□ 2.26
VGF-201ENST00000249330 PTPRKQ15262 1439 aa29.16■■■□□ 2.26
VGF-201ENST00000249330 ATP10BO94823 1461 aa29.16■■■□□ 2.26
VGF-201ENST00000249330 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.15■■■□□ 2.26
VGF-201ENST00000249330 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.15■■■□□ 2.26
VGF-201ENST00000249330 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
VGF-201ENST00000249330 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.1■■■□□ 2.25
VGF-201ENST00000249330 UACAQ9BZF9 1416 aa29.07■■■□□ 2.24
VGF-201ENST00000249330 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
VGF-201ENST00000249330 MIA2Q96PC5 1412 aa29.05■■■□□ 2.24
VGF-201ENST00000249330 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.05■■■□□ 2.24
VGF-201ENST00000249330 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
VGF-201ENST00000249330 KIF14Q15058 1648 aa29.04■■■□□ 2.24
VGF-201ENST00000249330 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
VGF-201ENST00000249330 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.97■■■□□ 2.23
VGF-201ENST00000249330 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
VGF-201ENST00000249330 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
VGF-201ENST00000249330 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms