RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239223.3

DUSP1-201, Transcript of dual specificity phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DUSP1, Length 2,019 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1-201ENST00000239223 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.45■■■□□ 2.46
DUSP1-201ENST00000239223 ARAP1Q96P48 1450 aa30.42■■■□□ 2.46
DUSP1-201ENST00000239223 FBLN2P98095 1184 aa30.42■■■□□ 2.46
DUSP1-201ENST00000239223 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
DUSP1-201ENST00000239223 CEP170Q5SW79 1584 aa30.34■■■□□ 2.45
DUSP1-201ENST00000239223 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.31■■■□□ 2.44
DUSP1-201ENST00000239223 IQGAP2Q13576 1575 aa30.31■■■□□ 2.44
DUSP1-201ENST00000239223 CHD1O14646 1710 aa30.31■■■□□ 2.44
DUSP1-201ENST00000239223 P3H3Q8IVL6 736 aa30.29■■■□□ 2.44
DUSP1-201ENST00000239223 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
DUSP1-201ENST00000239223 NUP160Q12769 1436 aa30.24■■■□□ 2.43
DUSP1-201ENST00000239223 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.24■■■□□ 2.43
DUSP1-201ENST00000239223 SAMD9Q5K651 1589 aa30.23■■■□□ 2.43
DUSP1-201ENST00000239223 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.23■■■□□ 2.43
DUSP1-201ENST00000239223 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.23■■■□□ 2.43
DUSP1-201ENST00000239223 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.14■■■□□ 2.41
DUSP1-201ENST00000239223 DISP1Q96F81 1524 aa30.06■■■□□ 2.4
DUSP1-201ENST00000239223 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
DUSP1-201ENST00000239223 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
DUSP1-201ENST00000239223 KIAA0556O60303 1618 aa30.02■■■□□ 2.4
DUSP1-201ENST00000239223 JPH4Q96JJ6 628 aa30■■■□□ 2.39
DUSP1-201ENST00000239223 FMN1Q68DA7 1419 aa29.94■■■□□ 2.38
DUSP1-201ENST00000239223 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.9■■■□□ 2.38
DUSP1-201ENST00000239223 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.9■■■□□ 2.38
DUSP1-201ENST00000239223 APLP2Q06481 763 aa29.89■■■□□ 2.38
DUSP1-201ENST00000239223 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
DUSP1-201ENST00000239223 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.89■■■□□ 2.37
DUSP1-201ENST00000239223 SHROOM2Q13796 1616 aa29.87■■■□□ 2.37
DUSP1-201ENST00000239223 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.86■■■□□ 2.37
DUSP1-201ENST00000239223 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
DUSP1-201ENST00000239223 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.85■■■□□ 2.37
DUSP1-201ENST00000239223 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
DUSP1-201ENST00000239223 TIAM1Q13009 1591 aa29.83■■■□□ 2.37
DUSP1-201ENST00000239223 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.82■■■□□ 2.36
DUSP1-201ENST00000239223 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
DUSP1-201ENST00000239223 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.82■■■□□ 2.36
DUSP1-201ENST00000239223 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.79■■■□□ 2.36
DUSP1-201ENST00000239223 MAP3K1Q13233 1512 aa29.74■■■□□ 2.35
DUSP1-201ENST00000239223 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.71■■■□□ 2.35
DUSP1-201ENST00000239223 HECW1Q76N89 1606 aa29.7■■■□□ 2.35
DUSP1-201ENST00000239223 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.69■■■□□ 2.34
DUSP1-201ENST00000239223 ARID3CA6NKF2 412 aa29.69■■■□□ 2.34
DUSP1-201ENST00000239223 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.68■■■□□ 2.34
DUSP1-201ENST00000239223 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
DUSP1-201ENST00000239223 OSCARQ8IYS5 282 aa29.65■■■□□ 2.34
DUSP1-201ENST00000239223 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
DUSP1-201ENST00000239223 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.33
DUSP1-201ENST00000239223 PTPRGP23470 1445 aa29.6■■■□□ 2.33
DUSP1-201ENST00000239223 ABCA8O94911 1581 aa29.59■■■□□ 2.33
DUSP1-201ENST00000239223 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.58■■■□□ 2.33
DUSP1-201ENST00000239223 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.57■■■□□ 2.33
DUSP1-201ENST00000239223 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.5■■■□□ 2.31
DUSP1-201ENST00000239223 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.45■■■□□ 2.31
DUSP1-201ENST00000239223 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.45■■■□□ 2.3
DUSP1-201ENST00000239223 UACAQ9BZF9 1416 aa29.43■■■□□ 2.3
DUSP1-201ENST00000239223 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
DUSP1-201ENST00000239223 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
DUSP1-201ENST00000239223 ATP10BO94823 1461 aa29.41■■■□□ 2.3
DUSP1-201ENST00000239223 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
DUSP1-201ENST00000239223 NCOA2Q15596 1464 aa29.37■■■□□ 2.29
DUSP1-201ENST00000239223 ABCC2Q92887 1545 aa29.37■■■□□ 2.29
DUSP1-201ENST00000239223 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
DUSP1-201ENST00000239223 ARHGEF11O15085 1522 aa29.31■■■□□ 2.28
DUSP1-201ENST00000239223 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.29■■■□□ 2.28
DUSP1-201ENST00000239223 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.27■■■□□ 2.28
DUSP1-201ENST00000239223 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
DUSP1-201ENST00000239223 KIF14Q15058 1648 aa29.26■■■□□ 2.27
DUSP1-201ENST00000239223 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.25■■■□□ 2.27
DUSP1-201ENST00000239223 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
DUSP1-201ENST00000239223 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
DUSP1-201ENST00000239223 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.2■■■□□ 2.27
DUSP1-201ENST00000239223 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.2■■■□□ 2.27
DUSP1-201ENST00000239223 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.18■■■□□ 2.26
DUSP1-201ENST00000239223 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.18■■■□□ 2.26
DUSP1-201ENST00000239223 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
DUSP1-201ENST00000239223 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.14■■■□□ 2.25
DUSP1-201ENST00000239223 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.14■■■□□ 2.25
DUSP1-201ENST00000239223 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.14■■■□□ 2.25
DUSP1-201ENST00000239223 ITGAEP38570 1179 aa29.13■■■□□ 2.25
DUSP1-201ENST00000239223 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.09■■■□□ 2.25
DUSP1-201ENST00000239223 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.07■■■□□ 2.24
DUSP1-201ENST00000239223 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
DUSP1-201ENST00000239223 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.03■■■□□ 2.24
DUSP1-201ENST00000239223 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.23
DUSP1-201ENST00000239223 TTC37Q6PGP7 1564 aa29■■■□□ 2.23
DUSP1-201ENST00000239223 MIA2Q96PC5 1412 aa29■■■□□ 2.23
DUSP1-201ENST00000239223 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
DUSP1-201ENST00000239223 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.99■■■□□ 2.23
DUSP1-201ENST00000239223 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.99■■■□□ 2.23
DUSP1-201ENST00000239223 KCNH8Q96L42 1107 aa28.99■■■□□ 2.23
DUSP1-201ENST00000239223 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
DUSP1-201ENST00000239223 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.97■■■□□ 2.231e-7■■■□□ 15.5
DUSP1-201ENST00000239223 PTPRKQ15262 1439 aa28.95■■■□□ 2.22
DUSP1-201ENST00000239223 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.92■■■□□ 2.22
DUSP1-201ENST00000239223 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
DUSP1-201ENST00000239223 ASXL2Q76L83 1435 aa28.91■■■□□ 2.22
DUSP1-201ENST00000239223 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.9■■■□□ 2.22
DUSP1-201ENST00000239223 PREX2Q70Z35 1606 aa28.89■■■□□ 2.21
DUSP1-201ENST00000239223 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.88■■■□□ 2.21
DUSP1-201ENST00000239223 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms