RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000235150.4

RNF19B-201, Transcript of ring finger protein 19B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF19B, Length 2,334 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19B-201ENST00000235150 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.73■■■■□ 3.63
RNF19B-201ENST00000235150 TIAM1Q13009 1591 aa37.7■■■■□ 3.63
RNF19B-201ENST00000235150 PBRM1Q86U86 1689 aa37.68■■■■□ 3.62
RNF19B-201ENST00000235150 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.65■■■■□ 3.62
RNF19B-201ENST00000235150 WDR62O43379 1518 aa37.65■■■■□ 3.62
RNF19B-201ENST00000235150 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP37.62■■■■□ 3.61
RNF19B-201ENST00000235150 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP37.62■■■■□ 3.61
RNF19B-201ENST00000235150 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.59■■■■□ 3.61
RNF19B-201ENST00000235150 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.58■■■■□ 3.61
RNF19B-201ENST00000235150 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.54■■■■□ 3.6
RNF19B-201ENST00000235150 SAMD9Q5K651 1589 aa37.53■■■■□ 3.6
RNF19B-201ENST00000235150 IFT140Q96RY7 1462 aa37.53■■■■□ 3.6
RNF19B-201ENST00000235150 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.52■■■■□ 3.6
RNF19B-201ENST00000235150 P3H3Q8IVL6 736 aa37.5■■■■□ 3.59
RNF19B-201ENST00000235150 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa37.5■■■■□ 3.59
RNF19B-201ENST00000235150 ADAMTS12P58397 1594 aa37.5■■■■□ 3.59
RNF19B-201ENST00000235150 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.47■■■■□ 3.59
RNF19B-201ENST00000235150 GRIN2BQ13224 1484 aa37.45■■■■□ 3.59
RNF19B-201ENST00000235150 FMN1Q68DA7 1419 aa37.44■■■■□ 3.58
RNF19B-201ENST00000235150 CCNB3Q8WWL7 1395 aa37.42■■■■□ 3.58
RNF19B-201ENST00000235150 ERCC6Q03468 1493 aa37.38■■■■□ 3.57
RNF19B-201ENST00000235150 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
RNF19B-201ENST00000235150 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.36■■■■□ 3.57
RNF19B-201ENST00000235150 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
RNF19B-201ENST00000235150 IQGAP2Q13576 1575 aa37.28■■■■□ 3.56
RNF19B-201ENST00000235150 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
RNF19B-201ENST00000235150 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.23■■■■□ 3.55
RNF19B-201ENST00000235150 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
RNF19B-201ENST00000235150 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.18■■■■□ 3.54
RNF19B-201ENST00000235150 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.09■■■■□ 3.53
RNF19B-201ENST00000235150 CLSPNQ9HAW4 1339 aa37.08■■■■□ 3.53
RNF19B-201ENST00000235150 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP37.08■■■■□ 3.53
RNF19B-201ENST00000235150 GRIN2AQ12879 1464 aa37.04■■■■□ 3.52
RNF19B-201ENST00000235150 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
RNF19B-201ENST00000235150 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.02■■■■□ 3.52
RNF19B-201ENST00000235150 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.98■■■■□ 3.51
RNF19B-201ENST00000235150 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.98■■■■□ 3.51
RNF19B-201ENST00000235150 HECW1Q76N89 1606 aa36.98■■■■□ 3.51
RNF19B-201ENST00000235150 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.97■■■■□ 3.51
RNF19B-201ENST00000235150 ITGAEP38570 1179 aa36.95■■■■□ 3.51
RNF19B-201ENST00000235150 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.94■■■■□ 3.5
RNF19B-201ENST00000235150 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
RNF19B-201ENST00000235150 SYNJ2O15056 1496 aa36.9■■■■□ 3.5
RNF19B-201ENST00000235150 KIAA0556O60303 1618 aa36.9■■■■□ 3.5
RNF19B-201ENST00000235150 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.88■■■■□ 3.49
RNF19B-201ENST00000235150 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
RNF19B-201ENST00000235150 DISP1Q96F81 1524 aa36.86■■■■□ 3.49
RNF19B-201ENST00000235150 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.86■■■■□ 3.49
RNF19B-201ENST00000235150 NCOA2Q15596 1464 aa36.85■■■■□ 3.49
RNF19B-201ENST00000235150 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.83■■■■□ 3.49
RNF19B-201ENST00000235150 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.82■■■■□ 3.48
RNF19B-201ENST00000235150 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.48
RNF19B-201ENST00000235150 ARHGEF11O15085 1522 aa36.81■■■■□ 3.48
RNF19B-201ENST00000235150 CEP170Q5SW79 1584 aa36.81■■■■□ 3.48
RNF19B-201ENST00000235150 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.78■■■■□ 3.48
RNF19B-201ENST00000235150 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
RNF19B-201ENST00000235150 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
RNF19B-201ENST00000235150 NUP160Q12769 1436 aa36.71■■■■□ 3.47
RNF19B-201ENST00000235150 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
RNF19B-201ENST00000235150 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
RNF19B-201ENST00000235150 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.65■■■■□ 3.46
RNF19B-201ENST00000235150 MAPKBP1O60336 1514 aa36.64■■■■□ 3.46
RNF19B-201ENST00000235150 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.63■■■■□ 3.45
RNF19B-201ENST00000235150 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
RNF19B-201ENST00000235150 FBLN2P98095 1184 aa36.56■■■■□ 3.44
RNF19B-201ENST00000235150 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
RNF19B-201ENST00000235150 PTPRKQ15262 1439 aa36.53■■■■□ 3.44
RNF19B-201ENST00000235150 HFM1A2PYH4 1435 aa36.51■■■■□ 3.43
RNF19B-201ENST00000235150 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.5■■■■□ 3.43
RNF19B-201ENST00000235150 MIA2Q96PC5 1412 aa36.48■■■■□ 3.43
RNF19B-201ENST00000235150 JPH4Q96JJ6 628 aa36.45■■■■□ 3.43
RNF19B-201ENST00000235150 ARID3CA6NKF2 412 aa36.41■■■■□ 3.42
RNF19B-201ENST00000235150 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.38■■■■□ 3.41
RNF19B-201ENST00000235150 NAIPQ13075 1403 aa36.37■■■■□ 3.41
RNF19B-201ENST00000235150 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
RNF19B-201ENST00000235150 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.31■■■■□ 3.4
RNF19B-201ENST00000235150 CHD1O14646 1710 aa36.3■■■■□ 3.4
RNF19B-201ENST00000235150 AKNAQ7Z591 1439 aa36.29■■■■□ 3.4
RNF19B-201ENST00000235150 UACAQ9BZF9 1416 aa36.29■■■■□ 3.4
RNF19B-201ENST00000235150 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
RNF19B-201ENST00000235150 ABCA8O94911 1581 aa36.28■■■■□ 3.4
RNF19B-201ENST00000235150 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.26■■■■□ 3.4
RNF19B-201ENST00000235150 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
RNF19B-201ENST00000235150 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.18■■■■□ 3.38
RNF19B-201ENST00000235150 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa36.17■■■■□ 3.38
RNF19B-201ENST00000235150 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
RNF19B-201ENST00000235150 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.14■■■■□ 3.38
RNF19B-201ENST00000235150 KIF14Q15058 1648 aa36.13■■■■□ 3.37
RNF19B-201ENST00000235150 DAPK1P53355 1430 aa36.12■■■■□ 3.37
RNF19B-201ENST00000235150 SHROOM2Q13796 1616 aa36.12■■■■□ 3.37
RNF19B-201ENST00000235150 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.08■■■■□ 3.37
RNF19B-201ENST00000235150 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.08■■■■□ 3.37
RNF19B-201ENST00000235150 ROCK1Q13464 1354 aa36.07■■■■□ 3.36
RNF19B-201ENST00000235150 ATP10BO94823 1461 aa36.06■■■■□ 3.36
RNF19B-201ENST00000235150 NEUROD1Q13562 356 aa36.06■■■■□ 3.36
RNF19B-201ENST00000235150 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
RNF19B-201ENST00000235150 ABCC5O15440 1437 aa36.05■■■■□ 3.36
RNF19B-201ENST00000235150 KDM6BO15054 1643 aa36.04■■■■□ 3.36
RNF19B-201ENST00000235150 PTPRGP23470 1445 aa36.02■■■■□ 3.36
RNF19B-201ENST00000235150 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.01■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms