RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219302.7

NME3-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME3, Length 1,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-201ENST00000219302 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
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NME3-201ENST00000219302 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.72■■■□□ 2.03
NME3-201ENST00000219302 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.71■■■□□ 2.03
NME3-201ENST00000219302 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.68■■■□□ 2.02
NME3-201ENST00000219302 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.65■■■□□ 2.02
NME3-201ENST00000219302 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.64■■■□□ 2.02
NME3-201ENST00000219302 CUL7Q14999 1698 aa27.62■■■□□ 2.01
NME3-201ENST00000219302 MAPKBP1O60336 1514 aa27.62■■■□□ 2.01
NME3-201ENST00000219302 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.6■■■□□ 2.01
NME3-201ENST00000219302 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.59■■■□□ 2.01
NME3-201ENST00000219302 DIP2BQ9P265 1576 aa27.51■■□□□ 1.99
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NME3-201ENST00000219302 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.44■■□□□ 1.98
NME3-201ENST00000219302 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.41■■□□□ 1.98
NME3-201ENST00000219302 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
NME3-201ENST00000219302 IQGAP2Q13576 1575 aa27.36■■□□□ 1.97
NME3-201ENST00000219302 ABCC2Q92887 1545 aa27.35■■□□□ 1.97
NME3-201ENST00000219302 DISP1Q96F81 1524 aa27.31■■□□□ 1.96
NME3-201ENST00000219302 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.31■■□□□ 1.96
NME3-201ENST00000219302 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.29■■□□□ 1.96
NME3-201ENST00000219302 TSPOAP1O95153 1857 aa27.29■■□□□ 1.96
NME3-201ENST00000219302 KDM6BO15054 1643 aa27.28■■□□□ 1.96
NME3-201ENST00000219302 ASXL2Q76L83 1435 aa27.28■■□□□ 1.96
NME3-201ENST00000219302 UACAQ9BZF9 1416 aa27.28■■□□□ 1.96
NME3-201ENST00000219302 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.26■■□□□ 1.95
NME3-201ENST00000219302 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.23■■□□□ 1.95
NME3-201ENST00000219302 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.23■■□□□ 1.95
NME3-201ENST00000219302 GLI2P10070 1586 aa27.21■■□□□ 1.95
NME3-201ENST00000219302 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.18■■□□□ 1.94
NME3-201ENST00000219302 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.93
NME3-201ENST00000219302 KIAA0556O60303 1618 aa27.12■■□□□ 1.93
NME3-201ENST00000219302 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
NME3-201ENST00000219302 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
NME3-201ENST00000219302 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
NME3-201ENST00000219302 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.02■■□□□ 1.92
NME3-201ENST00000219302 PRXQ9BXM0 1461 aa27■■□□□ 1.91
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NME3-201ENST00000219302 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.96■■□□□ 1.91
NME3-201ENST00000219302 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.96■■□□□ 1.91
NME3-201ENST00000219302 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.96■■□□□ 1.91
NME3-201ENST00000219302 ABCA8O94911 1581 aa26.92■■□□□ 1.9
NME3-201ENST00000219302 KCNH8Q96L42 1107 aa26.88■■□□□ 1.89
NME3-201ENST00000219302 ADGRL1O94910 1474 aa26.87■■□□□ 1.89
NME3-201ENST00000219302 CD109Q6YHK3 1445 aa26.85■■□□□ 1.89
NME3-201ENST00000219302 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.84■■□□□ 1.89
NME3-201ENST00000219302 P3H3Q8IVL6 736 aa26.79■■□□□ 1.88
NME3-201ENST00000219302 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.79■■□□□ 1.88
NME3-201ENST00000219302 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.77■■□□□ 1.88
NME3-201ENST00000219302 ATP10BO94823 1461 aa26.74■■□□□ 1.87
NME3-201ENST00000219302 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
NME3-201ENST00000219302 ARID3CA6NKF2 412 aa26.72■■□□□ 1.87
NME3-201ENST00000219302 SAMD9Q5K651 1589 aa26.64■■□□□ 1.86
NME3-201ENST00000219302 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.64■■□□□ 1.85
NME3-201ENST00000219302 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.58■■□□□ 1.85
NME3-201ENST00000219302 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.57■■□□□ 1.84
NME3-201ENST00000219302 EEA1Q15075 1411 aa26.56■■□□□ 1.84
NME3-201ENST00000219302 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.56■■□□□ 1.84
NME3-201ENST00000219302 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.54■■□□□ 1.84
NME3-201ENST00000219302 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
NME3-201ENST00000219302 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
NME3-201ENST00000219302 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
NME3-201ENST00000219302 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
NME3-201ENST00000219302 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
NME3-201ENST00000219302 RAPGEF3O95398 923 aa26.5■■□□□ 1.83
NME3-201ENST00000219302 KIF21BO75037 1637 aa26.49■■□□□ 1.83
NME3-201ENST00000219302 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.48■■□□□ 1.83
NME3-201ENST00000219302 NEO1Q92859 1461 aa26.48■■□□□ 1.83
NME3-201ENST00000219302 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.43■■□□□ 1.82
NME3-201ENST00000219302 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.36■■□□□ 1.81
NME3-201ENST00000219302 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.34■■□□□ 1.81
NME3-201ENST00000219302 PTPRMP28827 1452 aa26.33■■□□□ 1.81
NME3-201ENST00000219302 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.33■■□□□ 1.81
NME3-201ENST00000219302 AKNAQ7Z591 1439 aa26.31■■□□□ 1.8
NME3-201ENST00000219302 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
NME3-201ENST00000219302 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.29■■□□□ 1.83e-22■□□□□ 10.7
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NME3-201ENST00000219302 FANCAO15360 1455 aa26.27■■□□□ 1.8
NME3-201ENST00000219302 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.25■■□□□ 1.79
NME3-201ENST00000219302 RICTORQ6R327 1708 aa26.22■■□□□ 1.79
NME3-201ENST00000219302 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.21■■□□□ 1.79
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NME3-201ENST00000219302 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
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NME3-201ENST00000219302 MADDQ8WXG6 1647 aa26.17■■□□□ 1.78
NME3-201ENST00000219302 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.17■■□□□ 1.78
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NME3-201ENST00000219302 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.15■■□□□ 1.78
NME3-201ENST00000219302 FMN1Q68DA7 1419 aa26.14■■□□□ 1.78
NME3-201ENST00000219302 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.14■■□□□ 1.77
NME3-201ENST00000219302 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.13■■□□□ 1.77
NME3-201ENST00000219302 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.12■■□□□ 1.77
NME3-201ENST00000219302 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
NME3-201ENST00000219302 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.12■■□□□ 1.77
NME3-201ENST00000219302 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.09■■□□□ 1.77
NME3-201ENST00000219302 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.09■■□□□ 1.77
NME3-201ENST00000219302 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.08■■□□□ 1.77
NME3-201ENST00000219302 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.08■■□□□ 1.77
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