RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
CNIH1-201ENST00000216416 HRCP23327 699 aa10.08□□□□□ -0.8
CNIH1-201ENST00000216416 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa10.07□□□□□ -0.8
CNIH1-201ENST00000216416 ERICH3Q5RHP9 1530 aa10.06□□□□□ -0.8
CNIH1-201ENST00000216416 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CNIH1-201ENST00000216416 WDR62O43379 1518 aa10.04□□□□□ -0.8
CNIH1-201ENST00000216416 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CNIH1-201ENST00000216416 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa10.04□□□□□ -0.8
CNIH1-201ENST00000216416 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CNIH1-201ENST00000216416 GRIN2BQ13224 1484 aa10.03□□□□□ -0.8
CNIH1-201ENST00000216416 IFT140Q96RY7 1462 aa10.03□□□□□ -0.8
CNIH1-201ENST00000216416 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
CNIH1-201ENST00000216416 WDR97A6NE52 1622 aa10.01□□□□□ -0.81
CNIH1-201ENST00000216416 JPH4Q96JJ6 628 aa10.01□□□□□ -0.81
CNIH1-201ENST00000216416 FHAD1B1AJZ9 1412 aa10□□□□□ -0.81
CNIH1-201ENST00000216416 PBRM1Q86U86 1689 aa9.97□□□□□ -0.81
CNIH1-201ENST00000216416 CHIC2Q9UKJ5 165 aa9.95□□□□□ -0.82
CNIH1-201ENST00000216416 GRIN2AQ12879 1464 aa9.94□□□□□ -0.82
CNIH1-201ENST00000216416 CUL7Q14999 1698 aa9.93□□□□□ -0.82
CNIH1-201ENST00000216416 PHLDB1Q86UU1 1377 aa9.93□□□□□ -0.82
CNIH1-201ENST00000216416 ADAMTS12P58397 1594 aa9.93□□□□□ -0.82
CNIH1-201ENST00000216416 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CNIH1-201ENST00000216416 MTUS2Q5JR59 1369 aa9.92□□□□□ -0.82
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CNIH1-201ENST00000216416 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CNIH1-201ENST00000216416 PLB1Q6P1J6 1458 aa9.9□□□□□ -0.83
CNIH1-201ENST00000216416 KCNH8Q96L42 1107 aa9.9□□□□□ -0.83
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CNIH1-201ENST00000216416 SYNJ2O15056 1496 aa9.89□□□□□ -0.83
CNIH1-201ENST00000216416 IQGAP2Q13576 1575 aa9.89□□□□□ -0.83
CNIH1-201ENST00000216416 CEP170Q5SW79 1584 aa9.89□□□□□ -0.83
CNIH1-201ENST00000216416 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa9.89□□□□□ -0.83
CNIH1-201ENST00000216416 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa9.86□□□□□ -0.83
CNIH1-201ENST00000216416 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa9.86□□□□□ -0.83
CNIH1-201ENST00000216416 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa9.86□□□□□ -0.83
CNIH1-201ENST00000216416 FMN1Q68DA7 1419 aa9.86□□□□□ -0.83
CNIH1-201ENST00000216416 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CNIH1-201ENST00000216416 DISP1Q96F81 1524 aa9.86□□□□□ -0.83
CNIH1-201ENST00000216416 CCNB3Q8WWL7 1395 aa9.85□□□□□ -0.83
CNIH1-201ENST00000216416 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CNIH1-201ENST00000216416 ERCC6L2Q5T890 1561 aa9.85□□□□□ -0.83
CNIH1-201ENST00000216416 TIAM1Q13009 1591 aa9.84□□□□□ -0.83
CNIH1-201ENST00000216416 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa9.84□□□□□ -0.83
CNIH1-201ENST00000216416 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa9.82□□□□□ -0.84
CNIH1-201ENST00000216416 NEUROD1Q13562 356 aa9.81□□□□□ -0.84
CNIH1-201ENST00000216416 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa9.8□□□□□ -0.84
CNIH1-201ENST00000216416 CHD1O14646 1710 aa9.8□□□□□ -0.84
CNIH1-201ENST00000216416 PTPRGP23470 1445 aa9.8□□□□□ -0.84
CNIH1-201ENST00000216416 SAMD9Q5K651 1589 aa9.8□□□□□ -0.84
CNIH1-201ENST00000216416 NUP160Q12769 1436 aa9.79□□□□□ -0.84
CNIH1-201ENST00000216416 EFCAB5A4FU69 1503 aa9.79□□□□□ -0.84
CNIH1-201ENST00000216416 SIN3AQ96ST3 1273 aa9.79□□□□□ -0.84
CNIH1-201ENST00000216416 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CNIH1-201ENST00000216416 FYCO1Q9BQS8 1478 aa9.78□□□□□ -0.84
CNIH1-201ENST00000216416 FOXD1Q16676 465 aa9.78□□□□□ -0.84
CNIH1-201ENST00000216416 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.84
CNIH1-201ENST00000216416 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa9.77□□□□□ -0.84
CNIH1-201ENST00000216416 NCOA2Q15596 1464 aa9.77□□□□□ -0.85
CNIH1-201ENST00000216416 PLEKHD1A6NEE1 506 aa9.77□□□□□ -0.85
CNIH1-201ENST00000216416 KIAA0556O60303 1618 aa9.77□□□□□ -0.85
CNIH1-201ENST00000216416 CYB5RLQ6IPT4 315 aa9.76□□□□□ -0.85
CNIH1-201ENST00000216416 OSCARQ8IYS5 282 aa9.76□□□□□ -0.85
CNIH1-201ENST00000216416 PTPRKQ15262 1439 aa9.76□□□□□ -0.85
CNIH1-201ENST00000216416 UGGT2Q9NYU1 1516 aa9.76□□□□□ -0.85
CNIH1-201ENST00000216416 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CNIH1-201ENST00000216416 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa9.75□□□□□ -0.85
CNIH1-201ENST00000216416 TRIM52Q96A61 297 aa9.74□□□□□ -0.85
CNIH1-201ENST00000216416 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.852e-8■■■■■ 32.7
CNIH1-201ENST00000216416 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CNIH1-201ENST00000216416 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CNIH1-201ENST00000216416 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CNIH1-201ENST00000216416 FGD6Q6ZV73 1430 aa9.73□□□□□ -0.85
CNIH1-201ENST00000216416 ATP10BO94823 1461 aa9.71□□□□□ -0.85
CNIH1-201ENST00000216416 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CNIH1-201ENST00000216416 MYOM3Q5VTT5 1437 aa9.69□□□□□ -0.86
CNIH1-201ENST00000216416 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CNIH1-201ENST00000216416 ARHGEF11O15085 1522 aa9.69□□□□□ -0.86
CNIH1-201ENST00000216416 MYT1LQ9UL68 1186 aa9.68□□□□□ -0.86
CNIH1-201ENST00000216416 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa9.68□□□□□ -0.86
CNIH1-201ENST00000216416 CFAP43Q8NDM7 1665 aa9.68□□□□□ -0.86
CNIH1-201ENST00000216416 KIF14Q15058 1648 aa9.67□□□□□ -0.86
CNIH1-201ENST00000216416 HECW1Q76N89 1606 aa9.67□□□□□ -0.86
CNIH1-201ENST00000216416 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.86
CNIH1-201ENST00000216416 UACAQ9BZF9 1416 aa9.65□□□□□ -0.86
CNIH1-201ENST00000216416 SETD5Q9C0A6 1442 aa9.65□□□□□ -0.86
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC18Q5T9S5 1454 aa9.64□□□□□ -0.87
CNIH1-201ENST00000216416 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CNIH1-201ENST00000216416 MAP3K1Q13233 1512 aa9.64□□□□□ -0.87
CNIH1-201ENST00000216416 AFAP1Q8N556 730 aa9.64□□□□□ -0.87
CNIH1-201ENST00000216416 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CNIH1-201ENST00000216416 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa9.62□□□□□ -0.87
CNIH1-201ENST00000216416 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CNIH1-201ENST00000216416 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CNIH1-201ENST00000216416 PTPN23Q9H3S7 1636 aa9.61□□□□□ -0.87
CNIH1-201ENST00000216416 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
CNIH1-201ENST00000216416 ABCA8O94911 1581 aa9.6□□□□□ -0.87
CNIH1-201ENST00000216416 NAIPQ13075 1403 aa9.59□□□□□ -0.87
CNIH1-201ENST00000216416 TSPY4P0CV99 314 aa9.59□□□□□ -0.87
CNIH1-201ENST00000216416 TSPY10P0CW01 314 aa9.59□□□□□ -0.87
CNIH1-201ENST00000216416 KDM6BO15054 1643 aa9.59□□□□□ -0.87
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