RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000172142.7

Nisch-222, Transcript of Nischarin, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 2,780 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-222ENSMUST00000172142 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa32,85■■■□□ 2,85
Nisch-222ENSMUST00000172142 Kdm5bQ80Y84 1544 aa32,79■■■□□ 2,84
Nisch-222ENSMUST00000172142 Tnnt3Q9QZ47 272 aa32,78■■■□□ 2,84
Nisch-222ENSMUST00000172142 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP32,7■■■□□ 2,83
Nisch-222ENSMUST00000172142 Shroom4Q1W617 1475 aa32,69■■■□□ 2,82
Nisch-222ENSMUST00000172142 Baz1bQ9Z277 1479 aa32,69■■■□□ 2,82
Nisch-222ENSMUST00000172142 Map3k1P53349 1493 aa32,67■■■□□ 2,82
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mrc2Q64449 1479 aa32,67■■■□□ 2,82
Nisch-222ENSMUST00000172142 Tiam1Q60610 1591 aa32,63■■■□□ 2,81
Nisch-222ENSMUST00000172142 BlmO88700 1416 aa32,62■■■□□ 2,81
Nisch-222ENSMUST00000172142 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP32,61■■■□□ 2,81
Nisch-222ENSMUST00000172142 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa32,56■■■□□ 2,8
Nisch-222ENSMUST00000172142 Kif21aQ9QXL2 1672 aa32,56■■■□□ 2,8
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP32,54■■■□□ 2,8
Nisch-222ENSMUST00000172142 Naip1Q9QWK5 1403 aa32,53■■■□□ 2,8
Nisch-222ENSMUST00000172142 NclP09405 707 aaKnown RBP32,53■■■□□ 2,8
Nisch-222ENSMUST00000172142 Grin2bQ01097 1482 aa32,52■■■□□ 2,8
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa32,49■■■□□ 2,79
Nisch-222ENSMUST00000172142 Stra8P70278 393 aa32,46■■■□□ 2,79
Nisch-222ENSMUST00000172142 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP32,44■■■□□ 2,78
Nisch-222ENSMUST00000172142 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP32,42■■■□□ 2,78
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa32,42■■■□□ 2,78
Nisch-222ENSMUST00000172142 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP32,4■■■□□ 2,78
Nisch-222ENSMUST00000172142 Erich3F6QRE9 1637 aa32,38■■■□□ 2,77
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP32,37■■■□□ 2,77
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ankrd26Q811D2 1581 aa32,36■■■□□ 2,77
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rpap1Q80TE0 1409 aa32,35■■■□□ 2,77
Nisch-222ENSMUST00000172142 Lmod2Q3UHZ5 550 aa32,34■■■□□ 2,77
Nisch-222ENSMUST00000172142 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP32,32■■■□□ 2,76
Nisch-222ENSMUST00000172142 Duox2A2AQ99 1517 aa32,3■■■□□ 2,76
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pcf11G3X9Z4 1553 aa32,3■■■□□ 2,76
Nisch-222ENSMUST00000172142 Slx4Q6P1D7 1565 aa32,29■■■□□ 2,76
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ccer2J3QPU5 274 aa32,28■■■□□ 2,76
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fam71e1A1L3C1 212 aa32,27■■■□□ 2,76
Nisch-222ENSMUST00000172142 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP32,25■■■□□ 2,75
Nisch-222ENSMUST00000172142 UacaQ8CGB3 1411 aa32,24■■■□□ 2,75
Nisch-222ENSMUST00000172142 CntlnA2AM05 1397 aa32,24■■■□□ 2,75
Nisch-222ENSMUST00000172142 Znf710Q3U288 666 aa32,22■■■□□ 2,75
Nisch-222ENSMUST00000172142 Samd9lQ69Z37 1561 aa32,2■■■□□ 2,74
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm13697A2AK42 830 aa32,19■■■□□ 2,74
Nisch-222ENSMUST00000172142 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP32,18■■■□□ 2,74
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mia2Q91ZV0 1396 aa32,17■■■□□ 2,74
Nisch-222ENSMUST00000172142 Crocc2F6XLV1 1638 aa32,17■■■□□ 2,74
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa32,16■■■□□ 2,74
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fhad1A6PWD2 1420 aa32,14■■■□□ 2,74
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fyco1Q8VDC1 1437 aa32,12■■■□□ 2,73
Nisch-222ENSMUST00000172142 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa32,11■■■□□ 2,73
Nisch-222ENSMUST00000172142 Carmil1Q6EDY6 1374 aa32,1■■■□□ 2,73
Nisch-222ENSMUST00000172142 Plb1Q3TTY0 1478 aa32,08■■■□□ 2,73
Nisch-222ENSMUST00000172142 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP32,08■■■□□ 2,73
Nisch-222ENSMUST00000172142 Efcab5A0JP43 1406 aa32,07■■■□□ 2,72
Nisch-222ENSMUST00000172142 Anp32aO35381 247 aa32,06■■■□□ 2,72
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rad54l2Q99NG0 1466 aa32,06■■■□□ 2,72
Nisch-222ENSMUST00000172142 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa32,05■■■□□ 2,72
Nisch-222ENSMUST00000172142 Vps8Q0P5W1 1427 aa32,02■■■□□ 2,72
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cux1P53564 1515 aa32,02■■■□□ 2,72
Nisch-222ENSMUST00000172142 Bcl11aQ9QYE3 773 aa32,02■■■□□ 2,72
Nisch-222ENSMUST00000172142 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP32,02■■■□□ 2,72
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ube2uB1AUC4 352 aa31,99■■■□□ 2,71
Nisch-222ENSMUST00000172142 Calr4Q3TQS0 420 aa31,91■■■□□ 2,7
Nisch-222ENSMUST00000172142 Peg3Q3URU2 1571 aa31,91■■■□□ 2,7
Nisch-222ENSMUST00000172142 Aebp1Q640N1 1128 aa31,9■■■□□ 2,7
Nisch-222ENSMUST00000172142 Naip2Q9QUK4 1447 aa31,89■■■□□ 2,7
Nisch-222ENSMUST00000172142 Setd1bQ8CFT2 1985 aa31,88■■■□□ 2,69
Nisch-222ENSMUST00000172142 Slc24a1Q91WD8 1130 aa31,84■■■□□ 2,69
Nisch-222ENSMUST00000172142 Camsap2Q8C1B1 1461 aa31,83■■■□□ 2,69
Nisch-222ENSMUST00000172142 SynmQ70IV5 1561 aa31,83■■■□□ 2,69
Nisch-222ENSMUST00000172142 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP31,83■■■□□ 2,69
Nisch-222ENSMUST00000172142 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP31,82■■■□□ 2,68
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa31,82■■■□□ 2,68
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa31,77■■■□□ 2,68
Nisch-222ENSMUST00000172142 Disp1Q3TDN0 1521 aa31,75■■■□□ 2,67
Nisch-222ENSMUST00000172142 Chic2Q9D9G3 165 aa31,74■■■□□ 2,67
Nisch-222ENSMUST00000172142 Magi3Q9EQJ9 1476 aa31,73■■■□□ 2,67
Nisch-222ENSMUST00000172142 Naip5Q9R016 1403 aa31,72■■■□□ 2,67
Nisch-222ENSMUST00000172142 A2mQ6GQT1 1474 aa31,71■■■□□ 2,67
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pla2r1Q62028 1487 aa31,69■■■□□ 2,66
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ncoa2Q61026 1462 aa31,68■■■□□ 2,66
Nisch-222ENSMUST00000172142 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP31,66■■■□□ 2,66
Nisch-222ENSMUST00000172142 Grin2aP35436 1464 aa31,66■■■□□ 2,66
Nisch-222ENSMUST00000172142 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP31,65■■■□□ 2,66
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ccnb3Q810T2 1396 aa31,63■■■□□ 2,65
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rtl5Q5DTT4 599 aa31,58■■■□□ 2,65
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ift140E9PY46 1464 aa31,55■■■□□ 2,64
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cul7Q8VE73 1689 aa31,54■■■□□ 2,64
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa31,53■■■□□ 2,64
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP31,52■■■□□ 2,64
Nisch-222ENSMUST00000172142 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP31,51■■■□□ 2,63
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mphosph9A6H5Y1 991 aa31,51■■■□□ 2,63
Nisch-222ENSMUST00000172142 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP31,48■■■□□ 2,63
Nisch-222ENSMUST00000172142 WizO88286 1684 aaKnown RBP31,47■■■□□ 2,63
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mrs2Q5NCE8 434 aa31,46■■■□□ 2,63
Nisch-222ENSMUST00000172142 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP31,44■■■□□ 2,62
Nisch-222ENSMUST00000172142 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa31,44■■■□□ 2,62
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fhod3Q76LL6 1578 aa31,43■■■□□ 2,62
Nisch-222ENSMUST00000172142 Washc2Q6PGL7 1334 aa31,43■■■□□ 2,62
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa31,43■■■□□ 2,62
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa31,42■■■□□ 2,62
Nisch-222ENSMUST00000172142 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP31,4■■■□□ 2,62
Nisch-222ENSMUST00000172142 Supt16hQ920B9 1047 aa31,4■■■□□ 2,62
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11,7 ms