RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000154553.1

Sft2d1-210, Transcript of Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sft2d1, Length 1,049 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 AknaQ80VW7 1404 aa37,85■■■■□ 3,65
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 SynmQ70IV5 1561 aa37,84■■■■□ 3,65
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Abcc1O35379 1528 aa37,82■■■■□ 3,65
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa37,82■■■■□ 3,64
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 PtprtQ99M80 1454 aa37,81■■■■□ 3,64
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Chic1Q8CBW7 227 aa37,8■■■■□ 3,64
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 CadpsQ80TJ1 1355 aa37,72■■■■□ 3,63
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP37,71■■■■□ 3,63
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP37,59■■■■□ 3,61
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Chd1P40201 1711 aa37,58■■■■□ 3,61
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Zeb1Q64318 1117 aa37,58■■■■□ 3,61
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa37,58■■■■□ 3,61
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Pprc1Q6NZN1 1644 aa37,54■■■■□ 3,6
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Soga1E1U8D0 1418 aa37,53■■■■□ 3,6
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Abcc2Q8VI47 1543 aa37,53■■■■□ 3,6
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Arhgap27A2AB59 869 aa37,52■■■■□ 3,6
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Abca16E9PWJ7 1678 aa37,48■■■■□ 3,59
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Neo1P97798 1493 aa37,48■■■■□ 3,59
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa37,46■■■■□ 3,59
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 PxdnQ3UQ28 1475 aa37,45■■■■□ 3,59
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Map3k4O08648 1597 aa37,45■■■■□ 3,59
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 WizO88286 1684 aaKnown RBP37,43■■■■□ 3,58
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 BC005561E9Q5E2 1589 aa37,41■■■■□ 3,58
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gm14025A2AP89 1413 aa37,39■■■■□ 3,58
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP37,39■■■■□ 3,58
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Adamts12Q811B3 1600 aa37,39■■■■□ 3,58
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa37,38■■■■□ 3,58
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Setbp1Q9Z180 1582 aa37,36■■■■□ 3,57
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 AI481877A2ALV5 1481 aa37,23■■■■□ 3,55
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Npm2Q80W85 207 aa37,23■■■■□ 3,55
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Slx4Q6P1D7 1565 aa37,21■■■■□ 3,55
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP37,2■■■■□ 3,55
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP37,17■■■■□ 3,54
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa37,14■■■■□ 3,54
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Carmil1Q6EDY6 1374 aa37,13■■■■□ 3,53
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rpap1Q80TE0 1409 aa37,1■■■■□ 3,53
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Jph4Q80WT0 628 aa37,1■■■■□ 3,53
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ak9G3UYQ4 1894 aa37,09■■■■□ 3,53
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Map3k1P53349 1493 aa37,07■■■■□ 3,53
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa37,05■■■■□ 3,52
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa36,99■■■■□ 3,51
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Arhgap35Q91YM2 1499 aa36,94■■■■□ 3,5
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Abca5Q8K448 1642 aa36,89■■■■□ 3,5
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP36,86■■■■□ 3,49
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP36,86■■■■□ 3,49
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP36,83■■■■□ 3,49
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 WrnO09053 1401 aa36,82■■■■□ 3,48
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Igf1rQ60751 1373 aa36,78■■■■□ 3,48
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ttc37F8VPK0 1563 aa36,74■■■■□ 3,47
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Arid3cA6PWV5 409 aa36,73■■■■□ 3,47
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Kdm5bQ80Y84 1544 aa36,72■■■■□ 3,47
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP36,71■■■■□ 3,47
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa36,71■■■■□ 3,47
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gab3Q8BSM5 595 aa36,71■■■■□ 3,47
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cux1P53564 1515 aa36,68■■■■□ 3,46
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 AdgbG3UZ78 1657 aa36,67■■■■□ 3,46
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa36,67■■■■□ 3,46
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Clip1Q922J3 1391 aa36,66■■■■□ 3,46
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Znf608Q56A10 1511 aa36,6■■■■□ 3,45
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Depdc5P61460 1591 aa36,58■■■■□ 3,45
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Fyco1Q8VDC1 1437 aa36,54■■■■□ 3,44
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Wdr7Q920I9 1489 aa36,53■■■■□ 3,44
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Zfyve16Q80U44 1528 aa36,53■■■■□ 3,44
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cep162Q6ZQ06 1403 aa36,52■■■■□ 3,44
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa36,51■■■■□ 3,43
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa36,49■■■■□ 3,43
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Arhgef11Q68FM7 1552 aa36,46■■■■□ 3,43
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 NhsB1AV60 1647 aa36,45■■■■□ 3,42
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 HrcG5E8J6 738 aa36,39■■■■□ 3,42
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cul7Q8VE73 1689 aa36,38■■■■□ 3,41
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa36,38■■■■□ 3,41
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Myt1lP97500 1187 aa36,36■■■■□ 3,41
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Fndc1E9Q043 1732 aa36,36■■■■□ 3,41
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Atp10dQ8K2X1 1416 aa36,35■■■■□ 3,41
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Alpk3Q924C5 1678 aa36,26■■■■□ 3,39
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 AglF8VPN4 1532 aa36,25■■■■□ 3,39
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Mroh2aD3Z750 1679 aa36,2■■■■□ 3,39
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Dnajc5gQ8C632 165 aa36,19■■■■□ 3,38
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ankrd26Q811D2 1581 aa36,19■■■■□ 3,38
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Plppr3Q7TPB0 716 aa36,17■■■■□ 3,38
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gcc2Q8CHG3 1679 aa36,16■■■■□ 3,38
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Aebp1Q640N1 1128 aa36,15■■■■□ 3,38
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 BlmO88700 1416 aa36,13■■■■□ 3,37
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ncoa2Q61026 1462 aa36,12■■■■□ 3,37
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa36,12■■■■□ 3,37
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa36,12■■■■□ 3,37
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Fancd2Q80V62 1450 aa36,11■■■■□ 3,37
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Abca8bQ8K440 1620 aa36,08■■■■□ 3,37
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Kif27Q7M6Z4 1394 aa36,05■■■■□ 3,36
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Arap1Q4LDD4 1452 aa35,99■■■■□ 3,35
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Magi1Q6RHR9 1471 aa35,99■■■■□ 3,35
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 A2mQ6GQT1 1474 aa35,98■■■■□ 3,35
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rnf17Q99MV7 1640 aa35,93■■■■□ 3,34
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Setd5Q5XJV7 1441 aa35,87■■■■□ 3,33
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Prex2Q3LAC4 1598 aa35,84■■■■□ 3,33
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP35,83■■■■□ 3,33
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Fam163aQ8CAA5 168 aa35,81■■■■□ 3,32
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP35,8■■■■□ 3,32
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa35,8■■■■□ 3,32
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ncoa3O09000 1398 aa35,79■■■■□ 3,32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14,4 ms