RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SynmQ70IV5 1561 aa30,93■■■□□ 2,54
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Erich3F6QRE9 1637 aa30,88■■■□□ 2,53
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Carmil1Q6EDY6 1374 aa30,87■■■□□ 2,53
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rusc2Q80U22 1514 aa30,85■■■□□ 2,53
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ift140E9PY46 1464 aa30,84■■■□□ 2,53
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ankrd26Q811D2 1581 aa30,83■■■□□ 2,53
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Setd5Q5XJV7 1441 aa30,83■■■□□ 2,53
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP30,72■■■□□ 2,51
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa30,62■■■□□ 2,49
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tiam1Q60610 1591 aa30,61■■■□□ 2,49
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Adamts12Q811B3 1600 aa30,36■■■□□ 2,45
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kdm5bQ80Y84 1544 aa29,94■■■□□ 2,38
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm156Q58A37 223 aa29,93■■■□□ 2,38
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa29,86■■■□□ 2,37
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa29,85■■■□□ 2,37
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa29,85■■■□□ 2,37
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP29,73■■■□□ 2,35
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