RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 NIT1Q86X76 327 aa14.37□□□□□ -0.11
CSAG3-202ENST00000617158 CHCHD7Q9BUK0 85 aa14.37□□□□□ -0.11
CSAG3-202ENST00000617158 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
CSAG3-202ENST00000617158 ESDP10768 282 aa14.36□□□□□ -0.11
CSAG3-202ENST00000617158 COTL1Q14019 142 aa14.36□□□□□ -0.11
CSAG3-202ENST00000617158 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa14.36□□□□□ -0.11
CSAG3-202ENST00000617158 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa14.35□□□□□ -0.11
CSAG3-202ENST00000617158 C3orf84H3BNL1 204 aa14.35□□□□□ -0.11
CSAG3-202ENST00000617158 TCTAP57738 103 aa14.35□□□□□ -0.11
CSAG3-202ENST00000617158 LINC00588Q9Y4M8 146 aa14.35□□□□□ -0.11
CSAG3-202ENST00000617158 TENM2Q9NT68 2774 aa14.33□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 LINC00614P0C842 121 aa14.33□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 LELP1Q5T871 98 aa14.33□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 KIR2DL4Q99706 377 aa14.33□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 A0A096LNJ9 63 aa14.32□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 SERF1AO75920 110 aa14.32□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 BAGE3Q86Y29 109 aa14.32□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa14.31□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 AMTP48728 403 aa14.31□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM97Q5BJF2 176 aa14.31□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 FA2HQ7L5A8 372 aa14.31□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 FCER1GP30273 86 aa14.3□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 RAB5BP61020 215 aa14.3□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 LAGE3Q14657 143 aa14.3□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 K7EMI3 77 aa14.29□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 NDUFA6P56556 154 aa14.29□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 WFDC10BQ8IUB3 73 aa14.29□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 Q8N3U1 123 aa14.29□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 C20orf203Q8NBC4 194 aa14.29□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM243Q9BU79 118 aa14.29□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 AP5S1Q9NUS5 200 aa14.29□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa14.28□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 RPL39P62891 51 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 PMCHL1Q16048 86 aa14.28□□□□□ -0.12
CSAG3-202ENST00000617158 CCL18P55774 89 aa14.27□□□□□ -0.13
CSAG3-202ENST00000617158 VPS13DQ5THJ4 4388 aa14.27□□□□□ -0.13
CSAG3-202ENST00000617158 GAGE6Q13070 117 aa14.26□□□□□ -0.13
CSAG3-202ENST00000617158 ORMDL2Q53FV1 153 aa14.26□□□□□ -0.13
CSAG3-202ENST00000617158 FAM104AQ969W3 186 aa14.26□□□□□ -0.13
CSAG3-202ENST00000617158 UPK3BQ9BT76 320 aa14.26□□□□□ -0.13
CSAG3-202ENST00000617158 CHCHD5Q9BSY4 110 aa14.25□□□□□ -0.13
CSAG3-202ENST00000617158 C2orf66Q6UXQ4 117 aa14.24□□□□□ -0.13
CSAG3-202ENST00000617158 FAM19A2Q8N3H0 131 aa14.24□□□□□ -0.13
CSAG3-202ENST00000617158 TOMM6Q96B49 74 aa14.23□□□□□ -0.13
CSAG3-202ENST00000617158 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa14.22□□□□□ -0.13
CSAG3-202ENST00000617158 FGF6P10767 208 aa14.22□□□□□ -0.13
CSAG3-202ENST00000617158 MPV17L2Q567V2 206 aa14.22□□□□□ -0.13
CSAG3-202ENST00000617158 PDZD11Q5EBL8 140 aa14.22□□□□□ -0.13
CSAG3-202ENST00000617158 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa14.22□□□□□ -0.13
CSAG3-202ENST00000617158 DNAH1Q9P2D7 4330 aa14.21□□□□□ -0.13
CSAG3-202ENST00000617158 H7C423 109 aa14.21□□□□□ -0.13
CSAG3-202ENST00000617158 BTF3P20290 206 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
CSAG3-202ENST00000617158 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
CSAG3-202ENST00000617158 LYSTQ99698 3801 aa14.21□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa14.2□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 IGIPA6NJ69 53 aa14.2□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 HSBP1O75506 76 aa14.2□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 RBX1P62877 108 aa14.2□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 LGALS9CQ6DKI2 356 aa14.2□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 LINC00173Q6ZV60 143 aa14.2□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 Q8N976 141 aa14.2□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 CYSLTR1Q9Y271 337 aa14.2□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 HBDP02042 147 aa14.19□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 DNAH10OSP0CZ25 163 aa14.19□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa14.19□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 TIMM21Q9BVV7 248 aa14.19□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 ALMS1Q8TCU4 4167 aa14.18□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 IGHV3-30P01768 117 aa14.18□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 IGHV3-33P01772 117 aa14.18□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa14.18□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa14.18□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 LINC01556Q5JQF7 62 aa14.18□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 A0A1B0GUV1 79 aa14.17□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 C5orf52A6NGY3 159 aa14.17□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM262E9PQX1 116 aa14.17□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 UBE2L6O14933 153 aa14.17□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 SIVA1O15304 175 aa14.17□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 LINC00476Q8WZB0 136 aa14.17□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 Q9H8V8 135 aa14.17□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa14.17□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 IFITM10A6NMD0 228 aa14.16□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 HIST3H2BBQ8N257 126 aa14.16□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM18Q96B42 140 aa14.16□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 SPANXA1Q9NS26 97 aa14.16□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa14.15□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 Q6ZUT4 128 aa14.15□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa14.15□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa14.15□□□□□ -0.14
CSAG3-202ENST00000617158 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa14.14□□□□□ -0.15
CSAG3-202ENST00000617158 ERASQ7Z444 233 aa14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms