RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 TAX1BP3O14907 124 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 NUPR1O60356 82 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 SEC61GP60059 68 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 RNF185Q96GF1 192 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 EML6Q6ZMW3 1958 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 DYSFO75923 2080 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 NDUFC2O95298 119 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 WISP2O76076 250 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV2-11P01706 119 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 BRWD1Q9NSI6 2320 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 Q8IZM0 81 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 ALPK2Q86TB3 2170 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 BPY2O14599 106 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 DCANP1Q8TF63 244 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 TSHBP01222 138 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 UBE2D3P61077 147 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 UBE2D2P62837 147 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 CACNA1DQ01668 2161 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 ESM1Q9NQ30 184 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 DEFB4AO15263 64 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 J3KT08 172 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 SPTA1P02549 2419 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 NRACQ8N912 160 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 CRIP1P50238 77 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 G3V4G9 280 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 RBX1P62877 108 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 IMUPQ9GZP8 106 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 NDUFC1O43677 76 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV1-51P01701 117 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 CLEC2BQ92478 149 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 YPEL4Q96NS1 127 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF407Q9C0G0 2248 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 H0Y9J4 135 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 UBE2D1P51668 147 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 DAND5Q8N907 189 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 TECTAO75443 2155 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 TCL1BO95988 128 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 DEFB1P60022 68 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 V9GYY9 64 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 DOCK9Q9BZ29 2069 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 A0A087WZ39 114 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 PCDH15Q96QU1 1955 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 Q8N2B8 174 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 PTPRSQ13332 1948 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 CEP290O15078 2479 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 WFDC2Q14508 124 aa6.21□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 PRR15LQ9BU68 103 aa6.21□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.21□□□□□ -1.41
PTPRB-208ENST00000550358 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-208ENST00000550358 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-208ENST00000550358 C2orf48Q96LS8 159 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-208ENST00000550358 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-208ENST00000550358 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-208ENST00000550358 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-208ENST00000550358 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-208ENST00000550358 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-208ENST00000550358 MED12Q93074 2177 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-208ENST00000550358 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-208ENST00000550358 UQCRQO14949 82 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-208ENST00000550358 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-208ENST00000550358 Q6JHZ5 121 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-208ENST00000550358 FAM186AA6NE01 2351 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1B0GUV1 79 aa6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms