RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541284.5

CNOT4-212, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene CNOT4, Length 3,563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-212ENST00000541284 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 SLURP1P55000 103 aa6.93□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.93□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.93□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.92□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 DEFB136Q30KP8 78 aa6.92□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.92□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 KRTAP10-9P60411 292 aa6.92□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 TEN1Q86WV5 123 aa6.92□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 LINC01600Q96MT4 127 aa6.92□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 J3QLI3 93 aa6.92□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 J3QR89 54 aa6.92□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 PRB1P04280 392 aa6.92□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.92□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.91□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.91□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.91□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.91□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.91□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 M0QXV9 152 aa6.91□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.91□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 CD28P10747 220 aa6.91□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 CRYBA4P53673 196 aa6.91□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 DEFB131AP59861 70 aa6.9□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.9□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.9□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 XGP55808 180 aa6.9□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.9□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.9□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 VCX2Q9H322 139 aa6.9□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 POLQO75417 2590 aa6.9□□□□□ -1.3
CNOT4-212ENST00000541284 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 A8MZ25 164 aa6.9□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 TGFAP01135 160 aa6.9□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.9□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 RAX2Q96IS3 184 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 MT-ATP8P03928 68 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 IL17DQ8TAD2 202 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 SPXQ9BT56 116 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 SPANXCQ9NY87 97 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 Q6ZUT4 128 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 DUX3Q96PT4 197 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 A8MWV9 139 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 IGHV3-53P01767 116 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 TRIAP1O43715 76 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 Q6ZSV7 163 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 RS1O15537 224 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 HTN1P15515 57 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 SLC25A20O43772 301 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 ERG28Q9UKR5 140 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 SPINK8P0C7L1 97 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 ZNF415Q09FC8 603 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 MIAQ16674 131 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 ITPR3Q14573 2671 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 CHD6Q8TD26 2715 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 C9JAW5 83 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 COX6A2Q02221 97 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 LINC01620Q4KN68 170 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 RNF183Q96D59 192 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 H7C2G1 150 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 CITED1Q99966 193 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-212ENST00000541284 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.84□□□□□ -1.31
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