RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487620.1

ZNF3-215, Transcript of zinc finger protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF3, Length 2,660 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3-215ENST00000487620 CUBNO60494 3623 aa7.17□□□□□ -1.26
ZNF3-215ENST00000487620 DEFB112Q30KQ8 113 aa7.17□□□□□ -1.26
ZNF3-215ENST00000487620 FAM104AQ969W3 186 aa7.17□□□□□ -1.26
ZNF3-215ENST00000487620 LITAFQ99732 161 aa7.17□□□□□ -1.26
ZNF3-215ENST00000487620 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.17□□□□□ -1.26
ZNF3-215ENST00000487620 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
ZNF3-215ENST00000487620 Q6ZSV7 163 aa7.16□□□□□ -1.26
ZNF3-215ENST00000487620 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.16□□□□□ -1.26
ZNF3-215ENST00000487620 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.16□□□□□ -1.26
ZNF3-215ENST00000487620 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
ZNF3-215ENST00000487620 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.16□□□□□ -1.26
ZNF3-215ENST00000487620 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ZNF3-215ENST00000487620 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.15□□□□□ -1.26
ZNF3-215ENST00000487620 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ZNF3-215ENST00000487620 B4DSR2 109 aa7.15□□□□□ -1.26
ZNF3-215ENST00000487620 M0QXV9 152 aa7.15□□□□□ -1.26
ZNF3-215ENST00000487620 SNCGO76070 127 aa7.15□□□□□ -1.26
ZNF3-215ENST00000487620 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ZNF3-215ENST00000487620 DUX3Q96PT4 197 aa7.15□□□□□ -1.26
ZNF3-215ENST00000487620 CENPEQ02224 2701 aa7.15□□□□□ -1.26
ZNF3-215ENST00000487620 CFAP46Q8IYW2 2715 aa7.15□□□□□ -1.26
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ZNF3-215ENST00000487620 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 GATA3P23771 443 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 DEFB131AP59861 70 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 CRLF1O75462 422 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 C2orf82Q6UX34 121 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 Q6ZSN1 163 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 DAND5Q8N907 189 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 CITED1Q99966 193 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 H3BMM0 161 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 COX6CP09669 75 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 GAGE2BQ13066 116 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 MIAQ16674 131 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 GAGE2EQ4V326 116 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 CLEC2BQ92478 149 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 NRGNQ92686 78 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 UBE2WQ96B02 151 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.14□□□□□ -1.27
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ZNF3-215ENST00000487620 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.13□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.13□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 SPANXCQ9NY87 97 aa7.13□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.13□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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ZNF3-215ENST00000487620 H7C423 109 aa7.12□□□□□ -1.27
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ZNF3-215ENST00000487620 SLURP1P55000 103 aa7.12□□□□□ -1.27
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ZNF3-215ENST00000487620 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.11□□□□□ -1.27
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ZNF3-215ENST00000487620 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.1□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.1□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 LINC01587Q99440 93 aa7.1□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 YAE1D1Q9NRH1 226 aa7.1□□□□□ -1.27
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ZNF3-215ENST00000487620 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa7.1□□□□□ -1.27
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ZNF3-215ENST00000487620 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.09□□□□□ -1.27
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ZNF3-215ENST00000487620 GAGE5Q13069 117 aa7.09□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 GAGE6Q13070 117 aa7.09□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.09□□□□□ -1.27
ZNF3-215ENST00000487620 H3BT86 120 aa7.08□□□□□ -1.28
ZNF3-215ENST00000487620 LST1O00453 97 aa7.08□□□□□ -1.28
ZNF3-215ENST00000487620 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
ZNF3-215ENST00000487620 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.08□□□□□ -1.28
ZNF3-215ENST00000487620 TMEM101Q96IK0 257 aa7.08□□□□□ -1.28
ZNF3-215ENST00000487620 PRORYQ9H606 182 aa7.08□□□□□ -1.28
ZNF3-215ENST00000487620 WNK1Q9H4A3 2382 aa7.08□□□□□ -1.28
ZNF3-215ENST00000487620 CHD6Q8TD26 2715 aa7.08□□□□□ -1.28
ZNF3-215ENST00000487620 IFITM1P13164 125 aa7.08□□□□□ -1.28
ZNF3-215ENST00000487620 COX6A2Q02221 97 aa7.08□□□□□ -1.28
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