RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-208	ENST00000487290	SNAPIN	O95295	136 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290		Q8N3U1	123 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	C20orf78	Q9BR46	151 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	ST20	Q9HBF5	79 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	SMKR1	H3BMG3	65 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290		I3L3M4	83 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	APOC3	P02656	99 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A1B0GVY2	172 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV3-30	P01768	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV3-33	P01772	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	MPV17L2	Q567V2	206 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM243	Q9BU79	118 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A1B0GUV1	79 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290		D6R8Y8	96 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290		H7C423	109 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	TSHB	P01222	138 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	ESD	P10768	282 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	S100P	P25815	95 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	CKS2	P33552	79 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	ELOB	Q15370	118 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	ATRAID	Q6UW56	229 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	ORMDL3	Q8N138	153 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A087WX48	190 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	PRSS47	A8MTI9	375 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	TNFRSF6B	O95407	300 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	AMT	P48728	403 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	COX19	Q49B96	90 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	VCY	O14598	125 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	APCS	P02743	223 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	PRR34	Q9NV39	138 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	NPY	P01303	97 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	HLA-DQA1	P01909	254 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	RBX1	P62877	108 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HCLS1-208	ENST00000487290	TCAP	O15273	167 aa		11.08	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	PMCH	P20382	165 aa		11.08	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	TNP2	Q05952	138 aa		11.08	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	YPEL4	Q96NS1	127 aa		11.08	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	MT-ND6	P03923	174 aa		11.07	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	GAGE6	Q13070	117 aa		11.07	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290		Q8N976	141 aa		11.07	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		11.07	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	PRELID3A	Q96N28	172 aa		11.07	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	KLK12	Q9UKR0	248 aa		11.07	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		11.07	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM262	E9PQX1	116 aa		11.06	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290		Q0VG73	95 aa		11.06	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	KIR2DL4	Q99706	377 aa		11.06	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	ENHO	Q6UWT2	76 aa		11.05	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	COX11	Q9Y6N1	276 aa		11.05	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		11.04	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	UBE2L6	O14933	153 aa		11.04	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	MIA	Q16674	131 aa		11.04	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	TM2D2	Q9BX73	214 aa		11.04	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		11.03	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	FGF6	P10767	208 aa		11.03	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		11.03	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	RMI2	Q96E14	147 aa		11.03	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
HCLS1-208	ENST00000487290	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	UBE2W	Q96B02	151 aa		11.02	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290		Q9HAA7	133 aa		11.02	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A087WTM6	91 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290		K7EMI3	77 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	CRP	P02741	224 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	FCER1G	P30273	86 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	REG3A	Q06141	175 aa		11	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		11	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290		Q8N8P6	123 aa		11	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	LCE2B	O14633	110 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	LINC01546	A6NGU7	62 aa		10.98	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		10.98	□□□□□ -0.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms