RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 C2orf82Q6UX34 121 aa11.41□□□□□ -0.58
SFRP4-201ENST00000436072 IGHV1-69P01742 117 aa11.4□□□□□ -0.58
SFRP4-201ENST00000436072 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa11.4□□□□□ -0.58
SFRP4-201ENST00000436072 IFITM1P13164 125 aa11.4□□□□□ -0.58
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM95Q3KNT9 176 aa11.4□□□□□ -0.58
SFRP4-201ENST00000436072 C10orf105Q8TEF2 133 aa11.4□□□□□ -0.58
SFRP4-201ENST00000436072 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa11.4□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 A0A0B4J2C4 111 aa11.4□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 LGALS9O00182 355 aa11.4□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 C20orf203Q8NBC4 194 aa11.4□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 Q9UF83 564 aa11.4□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 MYO9AB2RTY4 2548 aa11.39□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa11.39□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 H3BUX3 64 aa11.39□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 M0R2P5 195 aa11.39□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 APRG1Q8IVJ8 170 aa11.39□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 KNCNA6PVL3 124 aa11.39□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 H3BMM0 161 aa11.39□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 UBE2WQ96B02 151 aa11.39□□□□□ -0.59
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SFRP4-201ENST00000436072 GAGE12JA6NER3 117 aa11.38□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 GAGE7O76087 117 aa11.38□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 GAGE12FP0CL80 117 aa11.38□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 GAGE12GP0CL81 117 aa11.38□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 GAGE12IP0CL82 117 aa11.38□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 CD28P10747 220 aa11.38□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 RPL32P62910 135 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 GAGE4Q13068 117 aa11.38□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 C19orf54Q5BKX5 351 aa11.38□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 TIMM21Q9BVV7 248 aa11.38□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 CCDC168Q8NDH2 2452 aa11.38□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 A0A0U1RRA0 63 aa11.38□□□□□ -0.59
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SFRP4-201ENST00000436072 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 H7C423 109 aa11.37□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 AVPP01185 164 aa11.37□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 ICOSQ9Y6W8 199 aa11.37□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 SMIM20Q8N5G0 67 aa11.36□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 DUX5Q96PT3 197 aa11.36□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa11.36□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 I3L3M4 83 aa11.36□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 C10orf99Q6UWK7 81 aa11.36□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa11.35□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 NDUFA12Q9UI09 145 aa11.35□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 ID1P41134 155 aa11.35□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 DCANP1Q8TF63 244 aa11.35□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 LITAFQ99732 161 aa11.35□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 MSMBP08118 114 aa11.34□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 C9orf85Q96MD7 179 aa11.34□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 CHCHD5Q9BSY4 110 aa11.34□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 NOTCH3Q9UM47 2321 aa11.34□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 RHOHQ15669 191 aa11.34□□□□□ -0.59
SFRP4-201ENST00000436072 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa11.33□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa11.33□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa11.33□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 C2CD3Q4AC94 2353 aa11.33□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 FAM104AQ969W3 186 aa11.32□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 USMG5Q96IX5 58 aa11.32□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 NF1P21359 2839 aa11.32□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 APCP25054 2843 aa11.31□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 HERV-K104P63124 156 aa11.3□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa11.3□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 COX6CP09669 75 aa11.3□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 MEIG1Q5JSS6 88 aa11.3□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 CHD6Q8TD26 2715 aa11.29□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 A0A0J9YX75 114 aa11.29□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 IGHG2P01859 326 aa11.29□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 M0QXV9 152 aa11.29□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa11.28□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 Q6ZSN1 163 aa11.28□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 B4DSR2 109 aa11.28□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 SHISA2Q6UWI4 295 aa11.28□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 IGHV4-59P01825 116 aa11.28□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa11.28□□□□□ -0.6
SFRP4-201ENST00000436072 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
SFRP4-201ENST00000436072 RBMY1CP0DJD4 496 aa11.27□□□□□ -0.61
SFRP4-201ENST00000436072 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
SFRP4-201ENST00000436072 MIAQ16674 131 aa11.27□□□□□ -0.61
SFRP4-201ENST00000436072 TRGV11A0A075B6L2 103 aa11.27□□□□□ -0.61
SFRP4-201ENST00000436072 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
SFRP4-201ENST00000436072 SYNJ2BPP57105 145 aa11.26□□□□□ -0.61
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP10-9P60411 292 aa11.26□□□□□ -0.61
SFRP4-201ENST00000436072 VSIG2Q96IQ7 327 aa11.26□□□□□ -0.61
SFRP4-201ENST00000436072 A6NDX4 124 aa11.26□□□□□ -0.61
SFRP4-201ENST00000436072 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
SFRP4-201ENST00000436072 TENM4Q6N022 2769 aa11.26□□□□□ -0.61
SFRP4-201ENST00000436072 DEFB112Q30KQ8 113 aa11.25□□□□□ -0.61
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM61Q8N0U2 210 aa11.25□□□□□ -0.61
SFRP4-201ENST00000436072 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa11.25□□□□□ -0.61
SFRP4-201ENST00000436072 LST1O00453 97 aa11.25□□□□□ -0.61
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