RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373190.5

PTPRT-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-204ENST00000373190 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 Q96MF0 132 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 NDUFC1O43677 76 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 ODF3L1Q8IXM7 274 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 SPRNQ5BIV9 151 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 A0A0U1RQV1 116 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 BPY2O14599 106 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 RNF138Q8WVD3 245 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 AJUBAQ96IF1 538 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 PKD1L2Q7Z442 2459 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 TRIAP1O43715 76 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 K7EMT4 169 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 ENHOQ6UWT2 76 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV4-59P01825 116 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 Q8N9W7 124 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 COX7BP24311 80 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 GPHB5Q86YW7 130 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 SEC61GP60059 68 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 MLST8Q9BVC4 326 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 SPAG11BQ08648 103 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 SERP2Q8N6R1 65 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 H0Y9J4 135 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 U3KQK5 164 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 MBD6Q96DN6 1003 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 TMEM223A0PJW6 202 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV3-30P01768 117 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV3-33P01772 117 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 UBE2AP49459 152 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 SPRY4Q9C004 299 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 IGLV1-47P01700 117 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 IGF2RP11717 2491 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 CCDC179H3BU77 68 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 IGKV4-1P06312 121 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 BLCAPP62952 87 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 A0A087WW49 117 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 ODF3Q96PU9 254 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 ZMAT4Q9H898 229 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 USP17L23D6RBM5 183 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 DEFB1P60022 68 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 A0A0J9YX75 114 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 COX7CP15954 63 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 CENPFP49454 3210 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 NCOR2Q9Y618 2525 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 CCL18P55774 89 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 H7C423 109 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 XGP55808 180 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-204ENST00000373190 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-204ENST00000373190 RNF185Q96GF1 192 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-204ENST00000373190 KLK12Q9UKR0 248 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-204ENST00000373190 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-204ENST00000373190 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-204ENST00000373190 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-204ENST00000373190 Q6Q795 121 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-204ENST00000373190 TIMM17BO60830 172 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-204ENST00000373190 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-204ENST00000373190 PIEZO1Q92508 2521 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-204ENST00000373190 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-204ENST00000373190 Q6ZPA2 131 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-204ENST00000373190 CCDC140Q96MF4 163 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-204ENST00000373190 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-204ENST00000373190 SIRPDQ9H106 197 aa6.64□□□□□ -1.35
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