RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366955.7

CENPF-201, Transcript of centromere protein F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPF, Length 10,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-201ENST00000366955 C9orf62Q8N4C0 152 aa3.13□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 MUC6Q6W4X9 2439 aa3.13□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 ODF3BA8MYP8 253 aa3.13□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 C1orf137Q5JT78 98 aa3.13□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 C10orf25Q5T742 122 aa3.13□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 HIST1H2BLQ99880 126 aa3.13□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 SIRPDQ9H106 197 aa3.13□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 MED12LQ86YW9 2145 aa3.13□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 CEND1Q8N111 149 aa3.12□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 A4D1N5 150 aa3.12□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa3.12□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 IMUPQ9GZP8 106 aa3.12□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 F8VRH5 84 aa3.12□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa3.12□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 ABCA2Q9BZC7 2435 aa3.12□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 ACACBO00763 2458 aa3.12□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 C6orf223Q8N319 242 aa3.12□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 MDFIQ99750 246 aa3.12□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 COL4A2P08572 1712 aa3.12□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 LELP1Q5T871 98 aa3.12□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa3.12□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa3.12□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa3.12□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 BRK1Q8WUW1 75 aa3.12□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 CDIP1Q9H305 208 aa3.12□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 PSMB8P28062 276 aa3.12□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 SVIPQ8NHG7 77 aa3.12□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 LINC00336Q6ZUF6 198 aa3.12□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 LMO4P61968 165 aa3.11□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 WFDC10BQ8IUB3 73 aa3.11□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 SERP2Q8N6R1 65 aa3.11□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 PDE6GP18545 87 aa3.11□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 NCOR2Q9Y618 2525 aa3.11□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 ATRAIDQ6UW56 229 aa3.11□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 CLUHP3Q96NS8 147 aa3.11□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 DSCAMO60469 2012 aa3.11□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 SPEGQ15772 3267 aa3.11□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 H7C423 109 aa3.11□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 DYSFO75923 2080 aa3.11□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa3.11□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 IFITM1P13164 125 aa3.11□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 Q6ZSR3 168 aa3.11□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa3.11□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 A0A1B0GV90 55 aa3.11□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 LGALS9BQ3B8N2 356 aa3.11□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 DCANP1Q8TF63 244 aa3.11□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 PROK2Q9HC23 129 aa3.11□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 MYO15AQ9UKN7 3530 aa3.11□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 HCFC1P51610 2035 aa3.1□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 BRI3O95415 125 aa3.1□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa3.1□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 USF3Q68DE3 2245 aa3.1□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 H2BFSP57053 126 aa3.1□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 VCANP13611 3396 aa3.1□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 EPM2AB3EWF7 344 aa3.1□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 WT1-ASQ06250 92 aa3.1□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 Q6ZTI0 123 aa3.1□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 M0QXV9 152 aa3.1□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 KRTAP10-9P60411 292 aa3.1□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 PTPRBP23467 1997 aa3.1□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 Q6ZS49 121 aa3.1□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 HIVEP2P31629 2446 aa3.1□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 A0A0J9YX75 114 aa3.1□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 LINC01545Q5VT33 79 aa3.1□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 Q8N9L7 120 aa3.1□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 RNF126Q9BV68 326 aa3.1□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 LST1O00453 97 aa3.1□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 H3BMG7 143 aa3.09□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 C2orf48Q96LS8 159 aa3.09□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 C16orf95Q9H693 158 aa3.09□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 C15orf65H3BRN8 121 aa3.09□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 NMBP08949 121 aa3.09□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa3.09□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 IGKV2D-28P01615 120 aa3.09□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 Q8N7P7 452 aa3.09□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.09□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 POM121L12Q8N7R1 296 aa3.09□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 C11orf52Q96A22 123 aa3.09□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa3.09□□□□□ -1.91
CENPF-201ENST00000366955 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa3.09□□□□□ -1.92
CENPF-201ENST00000366955 C10orf142B7Z368 130 aa3.09□□□□□ -1.92
CENPF-201ENST00000366955 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.09□□□□□ -1.92
CENPF-201ENST00000366955 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa3.09□□□□□ -1.92
CENPF-201ENST00000366955 FAM231DQ6ZW35 169 aa3.09□□□□□ -1.92
CENPF-201ENST00000366955 MUC3AQ02505 3323 aa3.09□□□□□ -1.92
CENPF-201ENST00000366955 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa3.09□□□□□ -1.92
CENPF-201ENST00000366955 PCP4P48539 62 aa3.08□□□□□ -1.92
CENPF-201ENST00000366955 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
CENPF-201ENST00000366955 MT-ATP8P03928 68 aa3.08□□□□□ -1.92
CENPF-201ENST00000366955 POU2AF1Q16633 256 aa3.08□□□□□ -1.92
CENPF-201ENST00000366955 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.7 ms