RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 ERVFC1-1P60608 527 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 PEA15Q15121 130 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 LINC01556Q5JQF7 62 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 M0QY20 66 aa5□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGHV3-30P01768 117 aa5□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGHV3-33P01772 117 aa5□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 MGPP08493 103 aa5□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 RPL23P62829 140 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM241Q24JQ0 296 aa5□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM74A3Q4VXF1 159 aa5□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 ISOC2Q96AB3 205 aa5□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 SMDT1Q9H4I9 107 aa5□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 HERC2O95714 4834 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 A0A087WWC5 75 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 A8MWL6 223 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRGC1P0CF51 173 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 IFITM2Q01629 132 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 C10orf126Q8N4M7 172 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 TSKUQ8WUA8 353 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 PGLYRP4Q96LB8 373 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 DPH3P1Q9H4G8 78 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 OSTCQ9NRP0 149 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 NAT8Q9UHE5 227 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 V9GYV3 84 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 KIAA1109Q2LD37 5005 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 IFITM10A6NMD0 228 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 ADIRFQ15847 76 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 NFE4Q86UQ8 179 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 NIT1Q86X76 327 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 GFRA4Q9GZZ7 299 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 HSPG2P98160 4391 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM231BA6NCW3 169 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 HIGD1CA8MV81 97 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 H7C1H1 209 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 RAB14P61106 215 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 CLLU1Q5K131 121 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 RASL11AQ6T310 242 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 C15orf54Q8N8G6 183 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 GATD1Q8NB37 220 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 DNAJC30Q96LL9 226 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 RYR1P21817 5038 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU1-38P-201ENST00000362817 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 A0A1B0GUT8 65 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 LAGE3Q14657 143 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPATA12Q7Z6I5 190 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 NUP35Q8NFH5 326 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 Q9HAA7 133 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 NIT2Q9NQR4 276 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 A0A087WTM6 91 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 GAS8-AS1O95177 125 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM97Q5BJF2 176 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 SMIM15Q7Z3B0 74 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 FRZBQ92765 325 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 BORCS7Q96B45 105 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 RNF185Q96GF1 192 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 CHCHD7Q9BUK0 85 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 A0A087WX48 190 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 C16orf90A8MZG2 172 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM262E9PQX1 116 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.94□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 RIGQ13278 110 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 IQCJQ1A5X6 159 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 MPV17L2Q567V2 206 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 CHCHD5Q9BSY4 110 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM191AQ9H0A3 160 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 NAT8BQ9UHF3 227 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 KLK12Q9UKR0 248 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 PSCAO43653 123 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 RAB4AP20338 218 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 GAGE6Q13070 117 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 KCNIP4Q6PIL6 250 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 ATRAIDQ6UW56 229 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 AMN1Q8IY45 258 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 Q8N976 141 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 ADCYAP1P18509 176 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 RPS10P46783 165 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 RBX1P62877 108 aa4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.7 ms