RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 LY6LH3BQJ8 138 aa15.91■□□□□ 0.14
CCSAP-201ENST00000284617 ZFAND3Q9H8U3 227 aa15.91■□□□□ 0.14
CCSAP-201ENST00000284617 P0DMU3 169 aa15.91■□□□□ 0.14
CCSAP-201ENST00000284617 FAM231AP0DMU4 169 aa15.91■□□□□ 0.14
CCSAP-201ENST00000284617 FAM231CP0DMU5 169 aa15.91■□□□□ 0.14
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZTI0 123 aa15.91■□□□□ 0.14
CCSAP-201ENST00000284617 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa15.91■□□□□ 0.14
CCSAP-201ENST00000284617 MED12LQ86YW9 2145 aa15.91■□□□□ 0.14
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa15.91■□□□□ 0.14
CCSAP-201ENST00000284617 COX7BP24311 80 aa15.9■□□□□ 0.14
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2AP49459 152 aa15.9■□□□□ 0.14
CCSAP-201ENST00000284617 C22orf34Q6ZV56 151 aa15.9■□□□□ 0.14
CCSAP-201ENST00000284617 U3KQK5 164 aa15.89■□□□□ 0.14
CCSAP-201ENST00000284617 UFSP1Q6NVU6 142 aa15.89■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 CRIP1P50238 77 aa15.89■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 H7C423 109 aa15.88■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 PRR14LQ5THK1 2151 aa15.88■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 LTBP2Q14767 1821 aa15.88■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa15.88■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 WFDC9Q8NEX5 89 aa15.87■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 C20orf173Q96LM9 149 aa15.87■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa15.87■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa15.87■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 C14orf132Q9NPU4 83 aa15.87■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa15.87■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM223A0PJW6 202 aa15.86■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 Q6YL49 198 aa15.86■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00467Q9BRT7 94 aa15.86■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM9A6NGZ8 99 aa15.86■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB114Q30KQ6 69 aa15.86■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 C5orf47Q569G3 176 aa15.85■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 RNF185Q96GF1 192 aa15.84■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 SORL1Q92673 2214 aa15.84■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 DSCAML1Q8TD84 2053 aa15.84■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 PTPN13Q12923 2485 aa15.84■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 M0QY20 66 aa15.84■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa15.83■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 REG3AQ06141 175 aa15.83■□□□□ 0.13
CCSAP-201ENST00000284617 LYRM9A8MSI8 78 aa15.83■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00269Q8N2A0 174 aa15.82■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa15.82■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa15.82■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV2-11P01706 119 aa15.82■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa15.82■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFC2O95298 119 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 PCDH15Q96QU1 1955 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 PLXNB1O43157 2135 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 C19orf84I3L1E1 186 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00308Q8TCZ7 52 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 ALPK3Q96L96 1907 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa15.79■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 FAM222AQ5U5X8 452 aa15.79■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa15.79■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV4-31P0DP07 118 aa15.79■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP126Q5VTH2 177 aa15.79■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 TP73-AS1Q9UF72 201 aa15.78■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa15.78■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 PCNX3Q9H6A9 2034 aa15.78■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf71Q6IPW1 123 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-201ENST00000284617 PRORYQ9H606 182 aa15.77■□□□□ 0.11
CCSAP-201ENST00000284617 BPY2O14599 106 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-201ENST00000284617 UPK3BQ9BT76 320 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-201ENST00000284617 MT-ATP8P03928 68 aa15.75■□□□□ 0.11
CCSAP-201ENST00000284617 Q8N6K4 173 aa15.75■□□□□ 0.11
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf45Q8TAV5 145 aa15.75■□□□□ 0.11
CCSAP-201ENST00000284617 C14orf177Q52M58 125 aa15.75■□□□□ 0.11
CCSAP-201ENST00000284617 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa15.75■□□□□ 0.11
CCSAP-201ENST00000284617 TRIAP1O43715 76 aa15.74■□□□□ 0.11
CCSAP-201ENST00000284617 C2CD3Q4AC94 2353 aa15.74■□□□□ 0.11
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa15.74■□□□□ 0.11
CCSAP-201ENST00000284617 NAV3Q8IVL0 2385 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-201ENST00000284617 NRACQ8N912 160 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-201ENST00000284617 RNF183Q96D59 192 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-201ENST00000284617 B9D2Q9BPU9 175 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-201ENST00000284617 TIMM17BO60830 172 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-201ENST00000284617 FAM110AQ9BQ89 295 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-201ENST00000284617 UQCRQO14949 82 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-201ENST00000284617 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-201ENST00000284617 C4orf48Q5BLP8 95 aa15.7■□□□□ 0.1
CCSAP-201ENST00000284617 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
CCSAP-201ENST00000284617 NAV2Q8IVL1 2488 aa15.7■□□□□ 0.1
CCSAP-201ENST00000284617 H0Y9J4 135 aa15.69■□□□□ 0.1
CCSAP-201ENST00000284617 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa15.69■□□□□ 0.1
CCSAP-201ENST00000284617 WFDC11Q8NEX6 87 aa15.69■□□□□ 0.1
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZSV7 163 aa15.69■□□□□ 0.1
CCSAP-201ENST00000284617 C2orf91Q6ZV80 131 aa15.68■□□□□ 0.1
CCSAP-201ENST00000284617 KLLNB2CW77 178 aa15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.5 ms