RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267176.8

SBNO1-201, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SBNO1, Length 11,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-201ENST00000267176 CRIP3Q6Q6R5 217 aa4.85□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa4.85□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 VSIG2Q96IQ7 327 aa4.85□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 J3QLI3 93 aa4.85□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 WT1P19544 449 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.84□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 COX7A2LO14548 114 aa4.84□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 UBE2BP63146 152 aa4.84□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 Q6Q795 121 aa4.84□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 FANCD2OSQ96PS1 177 aa4.84□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa4.84□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 SMIM9A6NGZ8 99 aa4.84□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 C20orf173Q96LM9 149 aa4.84□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.84□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 GYPEP15421 78 aa4.84□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 WFDC9Q8NEX5 89 aa4.84□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 NREPQ16612 68 aa4.84□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 HHLA3Q9XRX5 114 aa4.84□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa4.84□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 IGFL2Q6UWQ7 119 aa4.84□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 ESM1Q9NQ30 184 aa4.83□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa4.83□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.83□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.83□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 MIAQ16674 131 aa4.83□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 MSMPQ1L6U9 139 aa4.83□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 LINC00643Q86TS7 51 aa4.83□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 UQCRQO14949 82 aa4.83□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 C2orf91Q6ZV80 131 aa4.83□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 SEM1Q6ZVN7 128 aa4.83□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 MBD6Q96DN6 1003 aa4.83□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 MED14OSP0DP75 135 aa4.83□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.83□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 TRBV12-3P01733 135 aa4.83□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 SEC61GP60059 68 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 C16orf74Q96GX8 76 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 P0DMU3 169 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 FAM231AP0DMU4 169 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 FAM231CP0DMU5 169 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 SPTBN4Q9H254 2564 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 CRIP1P50238 77 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 A0A0J9YXY3 114 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 CGB3P0DN86 165 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 NAV2Q8IVL1 2488 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 NCR3O14931 201 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 Q8N7P7 452 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 A0A087WW49 117 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 NFE4Q86UQ8 179 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 PKD1L2Q7Z442 2459 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 IGLC6P0CF74 106 aa4.82□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 MUC6Q6W4X9 2439 aa4.81□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa4.81□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 WISP2O76076 250 aa4.81□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC179H3BU77 68 aa4.81□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 TRIAP1O43715 76 aa4.81□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 CGB7P0DN87 165 aa4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 UPK3BQ9BT76 320 aa4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 COL4A2P08572 1712 aa4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 NDUFA7O95182 113 aa4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 A0A0U1RQV1 116 aa4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 NRGNQ92686 78 aa4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 GPHB5Q86YW7 130 aa4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 JMJD1CQ15652 2540 aa4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 C20orf197Q8N268 126 aa4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 A0A0J9YX75 114 aa4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 C1orf195Q5TG92 126 aa4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa4.8□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 CFAP54Q96N23 3096 aa4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 VCANP13611 3396 aa4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC140Q96MF4 163 aa4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 K7EMT4 169 aa4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 LINC00694P0DN24 101 aa4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 CXCL5P42830 114 aa4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 INSL3P51460 131 aa4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 RMI2Q96E14 147 aa4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 TMEM223A0PJW6 202 aa4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 MP68P56378 58 aa4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 PIP4P1Q86T03 277 aa4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 DIRC1Q969H9 104 aa4.79□□□□□ -1.64
SBNO1-201ENST00000267176 IGHV3-33P01772 117 aa4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 313.7 ms