RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 CRIP1P50238 77 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 Q8IZM0 81 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 CLEC2BQ92478 149 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRB-201ENST00000261266 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 BPY2O14599 106 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 UQCRQO14949 82 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 ESPL1Q14674 2120 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 PLA2G2AP14555 144 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 ARID1AO14497 2285 aa6.68□□□□□ -1.34
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PTPRB-201ENST00000261266 SYCNQ0VAF6 134 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 DCANP1Q8TF63 244 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 DAND5Q8N907 189 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 UBE2D1P51668 147 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 RNF183Q96D59 192 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 UBE2D3P61077 147 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 UBE2D2P62837 147 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 DYSFO75923 2080 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 C7orf33Q8WU49 177 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 NRGNQ92686 78 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 EML6Q6ZMW3 1958 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 M0QXV9 152 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 CEP290O15078 2479 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 PTPRSQ13332 1948 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 Q6Q795 121 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 Q8N976 141 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 LST1O00453 97 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 LINC01006Q8NI28 216 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 LY6G6DO95868 133 aa6.64□□□□□ -1.35
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PTPRB-201ENST00000261266 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.64□□□□□ -1.35
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PTPRB-201ENST00000261266 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 B5MCH6 92 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 RBX1P62877 108 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 Q6JHZ5 121 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 PRR15LQ9BU68 103 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 DNAJC13O75165 2243 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 TRIAP1O43715 76 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 NUPR2A6NF83 97 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 LINC01546A6NGU7 62 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 APC2O95996 2303 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 PCDH15Q96QU1 1955 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 IGIPA6NJ69 53 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 BRWD1Q9NSI6 2320 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 H0Y9J4 135 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 ACACAQ13085 2346 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 DEFB1P60022 68 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 IGLV1-51P01701 117 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 INAFM1C9JVW0 142 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 FAM236CP0DP71 79 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 Q8N2B8 174 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 C2orf48Q96LS8 159 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 FAM186AA6NE01 2351 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-201ENST00000261266 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
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