RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 BCL2P10415 239 aa7.15□□□□□ -1.26
EFTUD2-209ENST00000587957 LINC00310P59036 64 aa7.15□□□□□ -1.26
EFTUD2-209ENST00000587957 AP1S3Q96PC3 154 aa7.15□□□□□ -1.26
EFTUD2-209ENST00000587957 HSPG2P98160 4391 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A087WX48 190 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 LECT2O14960 151 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 SNAI2O43623 268 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 PDE6DO43924 150 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 P01737 135 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 CXCL1P09341 107 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 Q6ZNX1 250 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 TM2D2Q9BX73 214 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM262E9PQX1 116 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 OR5AL1P0C617 328 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 CEBPGP53567 150 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP10-1P60331 282 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 RAB4BP61018 213 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 HAMPP81172 84 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 LAGE3Q14657 143 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 TOR2AQ5JU69 321 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 ALKAL2Q6UX46 152 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 C9orf62Q8N4C0 152 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 VAX2Q9UIW0 290 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 KLK12Q9UKR0 248 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 XKRY2A2RUG3 117 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 GCSHP23434 173 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 UBE2D3P61077 147 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 UBE2D2P62837 147 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 NIT1Q86X76 327 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 UBE2WQ96B02 151 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 IGLV2-8P01709 118 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 Q8N1X5 172 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 Q8N814 137 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 RMI2Q96E14 147 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.1□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.1□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 CRPP02741 224 aa7.1□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 WFDC2Q14508 124 aa7.1□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.1□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 BAALCQ8WXS3 180 aa7.1□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 BIN3Q9NQY0 253 aa7.1□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 IGLC6P0CF74 106 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 CACNG7P62955 275 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 ELOBQ15370 118 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 SMIM12Q96EX1 92 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-209ENST00000587957 EPM2AB3EWF7 344 aa7.08□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 TRGC1P0CF51 173 aa7.08□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 BLOC1S1P78537 153 aa7.08□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 GAGE6Q13070 117 aa7.08□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 MPV17L2Q567V2 206 aa7.08□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.08□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.08□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 H7C1H1 209 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 HLA-DQA1P01909 254 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 XGP55808 180 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 TWIST1Q15672 202 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 FRZBQ92765 325 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 NUDT11Q96G61 164 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 COX11Q9Y6N1 276 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.06□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A1B0GVG6 124 aa7.06□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 F2Z2F3 143 aa7.06□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 K7EN84 100 aa7.06□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 NTF3P20783 257 aa7.06□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 LINC01620Q4KN68 170 aa7.06□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 Q5VSD8 79 aa7.06□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 Q8N976 141 aa7.06□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 OCC1Q8TAD7 63 aa7.06□□□□□ -1.28
EFTUD2-209ENST00000587957 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125.7 ms