RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582122.1

TOP3A-212, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 4

Gene TOP3A, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-212ENST00000582122 NFE4Q86UQ8 179 aa7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-212ENST00000582122 GTSF1Q8WW33 167 aa7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-212ENST00000582122 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-212ENST00000582122 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-212ENST00000582122 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-212ENST00000582122 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.15□□□□□ -1.27
TOP3A-212ENST00000582122 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.14□□□□□ -1.27
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TOP3A-212ENST00000582122 S100A8P05109 93 aa7.14□□□□□ -1.27
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TOP3A-212ENST00000582122 UBE2D2P62837 147 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-212ENST00000582122 IFITM2Q01629 132 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-212ENST00000582122 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.13□□□□□ -1.27
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TOP3A-212ENST00000582122 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-212ENST00000582122 M0QY20 66 aa7.12□□□□□ -1.27
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TOP3A-212ENST00000582122 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-212ENST00000582122 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-212ENST00000582122 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-212ENST00000582122 NIT2Q9NQR4 276 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-212ENST00000582122 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-212ENST00000582122 PPP1R17O96001 155 aa7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-212ENST00000582122 ELOBQ15370 118 aa7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-212ENST00000582122 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-212ENST00000582122 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-212ENST00000582122 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-212ENST00000582122 LAGE3Q14657 143 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-212ENST00000582122 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-212ENST00000582122 NUP35Q8NFH5 326 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-212ENST00000582122 A0A087WX48 190 aa7.09□□□□□ -1.27
TOP3A-212ENST00000582122 TMEM218A2RU14 115 aa7.09□□□□□ -1.27
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TOP3A-212ENST00000582122 F8W036 122 aa7.09□□□□□ -1.27
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TOP3A-212ENST00000582122 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.09□□□□□ -1.27
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TOP3A-212ENST00000582122 SEC11CQ9BY50 192 aa7.09□□□□□ -1.27
TOP3A-212ENST00000582122 Q9UF83 564 aa7.09□□□□□ -1.27
TOP3A-212ENST00000582122 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.08□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.08□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 LINC00862A6NCI5 91 aa7.08□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.08□□□□□ -1.28
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TOP3A-212ENST00000582122 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.07□□□□□ -1.28
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TOP3A-212ENST00000582122 NIT1Q86X76 327 aa7.07□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 GATD1Q8NB37 220 aa7.07□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 RMI2Q96E14 147 aa7.07□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 IMMP2LQ96T52 175 aa7.07□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 TM2D2Q9BX73 214 aa7.07□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.07□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.07□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.06□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 TMEM262E9PQX1 116 aa7.06□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 Q0VG73 95 aa7.06□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.06□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 PKHD1P08F94 4074 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 TCAPO15273 167 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 IGHV3-30P01768 117 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 IGHV3-33P01772 117 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 PPBPP02775 128 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 RAB4AP20338 218 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 TMEM243Q9BU79 118 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 ST20Q9HBF5 79 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.04□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.04□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 H7C423 109 aa7.04□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 I3L3M4 83 aa7.04□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 UBE2L6O14933 153 aa7.04□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 PSCAO43653 123 aa7.04□□□□□ -1.28
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TOP3A-212ENST00000582122 NDUFA5Q16718 116 aa7.04□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 AMN1Q8IY45 258 aa7.04□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 BTF3L4Q96K17 158 aa7.04□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.03□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.03□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 A0A1B0GXF2 115 aa7.03□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.03□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 PHOX2AO14813 284 aa7.03□□□□□ -1.28
TOP3A-212ENST00000582122 PMCHP20382 165 aa7.03□□□□□ -1.28
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