RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 SCO1O75880 301 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 PRM2P04554 102 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 IL5P05113 134 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 HAMPP81172 84 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF846Q147U1 533 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 SMCO1Q147U7 214 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 LAIR2Q6ISS4 152 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 WFDC10BQ8IUB3 73 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 BLNKQ8WV28 456 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 YIPF6Q96EC8 236 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 TP53RKQ96S44 253 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 RNF213Q63HN8 5207 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 CCNKO75909 580 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 GPX1P07203 203 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 OR5G3P0C626 314 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 LINC00869P0C866 280 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 SLC25A6P12236 298 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 SDC2P34741 201 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 AKR1C1Q04828 323 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 Q0VG73 95 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 LELP1Q5T871 98 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 RNF182Q8N6D2 247 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 CHCHD7Q9BUK0 85 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 MEIS3P1A6NDR6 274 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 DISC1C4P0D8 188 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 FNDC10F2Z333 226 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 H3BRN7 92 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 GABARAPL2P60520 117 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 PKIAP61925 76 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 PMVKQ15126 192 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 LHFPL1Q86WI0 220 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 DPH3Q96FX2 82 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRM-208ENST00000578600 SRRQ9GZT4 340 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 GTSF1LQ9H1H1 148 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 NAA60Q9H7X0 242 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRM-208ENST00000578600 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 C7orf66A4D0T2 115 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 K7EPK0 472 aa3.22□□□□□ -1.89
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PTPRM-208ENST00000578600 OR10J4P0C629 311 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 PDE6HQ13956 83 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 RHOHQ15669 191 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 SP6Q3SY56 376 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 C5orf47Q569G3 176 aa3.22□□□□□ -1.89
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PTPRM-208ENST00000578600 PRO0628Q9UI54 55 aa3.22□□□□□ -1.89
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PTPRM-208ENST00000578600 IGKV2D-28P01615 120 aa3.21□□□□□ -1.9
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PTPRM-208ENST00000578600 OR4E1P0C645 316 aa3.21□□□□□ -1.9
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PTPRM-208ENST00000578600 COX19Q49B96 90 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-208ENST00000578600 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-208ENST00000578600 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM229BQ8NBD8 167 aa3.21□□□□□ -1.9
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PTPRM-208ENST00000578600 AP3S1Q92572 193 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-208ENST00000578600 SMIM8Q96KF7 97 aa3.21□□□□□ -1.9
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PTPRM-208ENST00000578600 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa3.21□□□□□ -1.9
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PTPRM-208ENST00000578600 SYNGR2O43760 224 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-208ENST00000578600 COX7A2P2O60397 106 aa3.2□□□□□ -1.9
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PTPRM-208ENST00000578600 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-208ENST00000578600 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-208ENST00000578600 CSN1S1P47710 185 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-208ENST00000578600 LINC00305Q7Z4B0 112 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-208ENST00000578600 SLC25A29Q8N8R3 303 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-208ENST00000578600 OR10P1Q8NGE3 313 aa3.2□□□□□ -1.9
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