RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558550.1

EFTUD1P1-202, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD1P1, Length 418 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 A0A087WWC5 75 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 M0QY20 66 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RAB4AP20338 218 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 AMN1Q8IY45 258 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GATD1Q8NB37 220 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DNAJC30Q96LL9 226 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GTSF1LQ9H1H1 148 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NIT2Q9NQR4 276 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TMEM242Q9NWH2 141 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 A0A1B0GXF2 115 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 UBE2D3P61077 147 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 UBE2D2P62837 147 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FAM104BQ5XKR9 115 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FRZBQ92765 325 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MRAP2Q96G30 205 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LINC00694P0DN24 101 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CKS2P33552 79 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TIRAPP58753 221 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 OR10J3Q5JRS4 329 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RNF185Q96GF1 192 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 Q9H8V8 135 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SMKR1H3BMG3 65 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 M0R2N4 97 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SIVA1O15304 175 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NCR2O95944 276 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PPP1R17O96001 155 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TMEM97Q5BJF2 176 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LELP1Q5T871 98 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 UPK3BQ9BT76 320 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ST20Q9HBF5 79 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DNAH7Q8WXX0 4024 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SDHAF1A6NFY7 115 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GAS8-AS1O95177 125 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PPBPP02775 128 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PMCHP20382 165 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RPS10P46783 165 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 COTL1Q14019 142 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ATRAIDQ6UW56 229 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 WFDC10BQ8IUB3 73 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 D6R8Y8 96 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HLA-DQA1P01909 254 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ELOBQ15370 118 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 COX19Q49B96 90 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TTC32Q5I0X7 151 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TMEM136Q6ZRR5 245 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ORMDL3Q8N138 153 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NRACQ8N912 160 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PRELID3AQ96N28 172 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CHCHD5Q9BSY4 110 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GNB1LQ9BYB4 327 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SMCO4Q9NRQ5 59 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 A0A087WX48 190 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TMEM262E9PQX1 116 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 I3L3M4 83 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 VCYO14598 125 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TNFRSF6BO95407 300 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IGHV3-30P01768 117 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IGHV3-33P01772 117 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 APCSP02743 223 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MT-ND6P03923 174 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 AMTP48728 403 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CBLN2Q8IUK8 224 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 C20orf78Q9BR46 151 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TMEM243Q9BU79 118 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TMEM70Q9BUB7 260 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PHOX2AO14813 284 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NPYP01303 97 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FCER1GP30273 86 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD1P1-202ENST00000558550 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.5 ms