RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 CDPF1Q6NVV7 123 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 CNFNQ9BYD5 112 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 PSCAO43653 123 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 MGPP08493 103 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 M0QY20 66 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 TRGC1P0CF51 173 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 NTF3P20783 257 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 CEBPGP53567 150 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 SUMO4Q6EEV6 95 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 WDR73Q6P4I2 378 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 FAM231DQ6ZW35 169 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 GTSF1Q8WW33 167 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 CHCHD7Q9BUK0 85 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 SRP19P09132 144 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 DNAJC30Q96LL9 226 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 SMIM7Q9BQ49 75 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 TM2D2Q9BX73 214 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 DPH3P1Q9H4G8 78 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 A0A087WX48 190 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 GATCO43716 136 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 WFDC2Q14508 124 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 KLK12Q9UKR0 248 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 PCLOQ9Y6V0 5065 aa11.77□□□□□ -0.52
CS-219ENST00000550655 H7C1H1 209 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 LINC01551Q86U37 167 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 Q8N814 137 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 KRTAP10-1P60331 282 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 TWIST1Q15672 202 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 MPV17L2Q567V2 206 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 TMEM97Q5BJF2 176 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 CT83Q5H943 113 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 RASL11AQ6T310 242 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 TEX261Q6UWH6 196 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 ZNF727A8MUV8 499 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 ATRAIDQ6UW56 229 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 A8MWL6 223 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 ELOBQ15370 118 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 KCNIP4Q6PIL6 250 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 UBE2WQ96B02 151 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 CHCHD5Q9BSY4 110 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 C9JQL5 133 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 TMEM262E9PQX1 116 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 IQCJQ1A5X6 159 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 NIT2Q9NQR4 276 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 GCSHP23434 173 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 PKIAP61925 76 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 ENHOQ6UWT2 76 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 C15orf54Q8N8G6 183 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 Q8N976 141 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 GATD1Q8NB37 220 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 RMI2Q96E14 147 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 PGLYRP4Q96LB8 373 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 OSTCQ9NRP0 149 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 COX11Q9Y6N1 276 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 LECT2O14960 151 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-219ENST00000550655 XGP55808 180 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 RBX1P62877 108 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 Q0VG73 95 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 GAGE6Q13070 117 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 Q8N1X5 172 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 TSKUQ8WUA8 353 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 BAALCQ8WXS3 180 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 ISOC2Q96AB3 205 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 GFRA4Q9GZZ7 299 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 HIGD1CA8MV81 97 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 ANGP03950 147 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 FAM74A3Q4VXF1 159 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 FRZBQ92765 325 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 V9GYV3 84 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 ABCA13Q86UQ4 5058 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 CRPP02741 224 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 RPL23P62829 140 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 SMIM15Q7Z3B0 74 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 PRR34Q9NV39 138 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 FAM231BA6NCW3 169 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 TMEM241Q24JQ0 296 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 TMEM243Q9BU79 118 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 A0A1B0GUT8 65 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 PEA15Q15121 130 aa11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 277.2 ms