RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 TRAV2A0A0B4J234 112 aa5.98□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 RBAKDNA6NC62 111 aa5.98□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 F6UB75 175 aa5.98□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 C9orf139Q6ZV77 190 aa5.98□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 DYNLRB2Q8TF09 96 aa5.98□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 ZFAND3Q9H8U3 227 aa5.98□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 ATP5G1P05496 136 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 CD7P09564 240 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV4-31P0DP07 118 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM258P61165 79 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 DEFB136Q30KP8 78 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM89A2RUT3 159 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 IGF1P05019 195 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 FAM236CP0DP71 79 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 CT83Q5H943 113 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 AMN1Q8IY45 258 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 NCR2O95944 276 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 TRACP01848 142 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 GDF5OSQ5U4N7 250 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 ITPR2Q14571 2701 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 F5H697 171 aa5.96□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 H3BVH4 76 aa5.96□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 IGLV2-11P01706 119 aa5.96□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 MGPP08493 103 aa5.96□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 CRYGAP11844 174 aa5.96□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 OR8A1Q8NGG7 326 aa5.96□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM158Q8WZ71 300 aa5.96□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 ODF3Q96PU9 254 aa5.96□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa5.96□□□□□ -1.45
TRPS1-208ENST00000519076 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.96□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.96□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 C19orf71A6NCJ1 209 aa5.96□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 OVOL1O14753 267 aa5.96□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa5.96□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 IMUPQ9GZP8 106 aa5.96□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 GFRA4Q9GZZ7 299 aa5.96□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 D6R8Y8 96 aa5.96□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 SMKR1H3BMG3 65 aa5.96□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 ORMDL3Q8N138 153 aa5.96□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa5.95□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa5.95□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 H3BUA1 57 aa5.95□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 FXYD7P58549 80 aa5.95□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF493Q6ZR52 646 aa5.95□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa5.95□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM190Q8WZ59 177 aa5.95□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 C9orf85Q96MD7 179 aa5.95□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa5.95□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 AGRNO00468 2067 aa5.95□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 SPRY2O43597 315 aa5.95□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 CRIP1P50238 77 aa5.95□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 COX7CP15954 63 aa5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 PFN2P35080 140 aa5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 TRAV21A0A0B4J279 112 aa5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 CLPSL1A2RUU4 121 aa5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 DPM2O94777 84 aa5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 MSRB1Q9NZV6 116 aa5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 J3QQQ9 107 aa5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 APRG1Q8IVJ8 170 aa5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 IL17DQ8TAD2 202 aa5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.93□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa5.93□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.93□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.93□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.93□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 A8MZ25 164 aa5.93□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 HIST1H4GQ99525 98 aa5.93□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 A0A087WW49 117 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1B0GXF2 115 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 PRSS1P07477 247 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 ELANEP08246 267 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 HLA-DRB4P13762 266 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 NPYP01303 97 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 SLURP1P55000 103 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 CACNG7P62955 275 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 Q6YL49 198 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 APCP25054 2843 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-208ENST00000519076 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa5.92□□□□□ -1.46
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